蒋兴鹏 - 华中师范大学

个人简介

蒋兴鹏，博士，教授，硕士生导师。1979年7月出生，2009年7月于中科院自动化所模式识别国家重点实验室获得博士学位，专业为模式识别与智能系统，师从蒋田仔研究员。先后于2009年8月-2012年1月在加拿大McMaster大学生物系、2012年2月至2014年12月在美国Drexel大学信息与计算学院从事博士后研究工作。2015年1月加入华中师范大学计算机学院，2015年入选湖北省“楚天学者”-楚天学子计划。目前担任IEEE会员，中国计算机学会会员及中国生物工程学会会员，IEEE BIBM 程序委员会成员及SCI期刊International Journal of Data Mining & Bioinformatics编委, BMC Bioinformatics, BMC Genomics特刊编辑；第一届计算调控基因组学及宏基因组学研讨会发起人及会议主席，中医药大数据产业联盟理事。主要从事高维微生物组学数据分析和计算方法的研究，具体研究涉及网络分析和模拟中的计算方法、宏基因组学与自然环境或人类疾病的关联、大规模生物数据的集成、降维和可视化等领域。近五年来，在IEEE/ACM Transctions on Computational Biology and Bioinformatics，Journal of Mathematical Biology, PLoS ONE，FEBS Letters等学术期刊上发表SCI、EI论文30余篇, 其中IEEE/ACM Transactions系列5篇，第一作者或通讯作者SCI论文11篇，封面论文一篇（FEBS Letters）。

研究领域

生物大数据挖掘、高维数据分析、统计模式识别、生物信息学、时间序列分析

近期论文

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Jiang, X., X. Hu, and W. Xu, Microbiome Data Representation by Joint Nonnegative Matrix Factorization with Laplacian Regularization. Computational Biology and Bioinformatics, IEEE/ACM Transactions on, 2015. Xu, W., et al., Visualization of genetic disease-phenotype similarities by multiple maps t-SNE with Laplacian regularization. BMC medical genomics, 2014. 7(Suppl 2): p. S1. Jiang, X., et al., Selecting Protein Families for Environmental Features Based on Manifold Regularization. Nanobioscience, IEEE Transactions on, 2014. 13(2): p. 104-108. Jiang, X., et al., Predicting Microbial Interactions using Vector Autoregressive Model with Graph Regularization. Computational Biology and Bioinformatics, IEEE/ACM Transactions on, 2014. Jiang, X. and X. Hu, Inferring microbial interaction networks based on consensus similarity network fusion. Science China Life Sciences, 2014. 57(11): p. 1115-1120. Jiang, X., et al., Comparison of dimensional reduction methods for detecting and visualizing novel patterns in human and marine microbiome. NanoBioscience, IEEE Transactions on, 2013. 12(3): p. 199-205. Bartram, A., et al., Exploring links between pH and bacterial community composition in soils from the Craibstone Experimental Farm. FEMS Microbiology Ecology, 2013. 87(2): p. 403-415. Jiang, X., J.S. Weitz, and J. Dushoff, A non-negative matrix factorization framework for identifying modular patterns in metagenomic profile data. Journal of Mathematical Biology, 2012. 64(4): p. 697-711. Jiang, X., et al., Functional Biogeography of Ocean Microbes Revealed through Non-Negative Matrix Factorization.PLoS ONE, 2012. 7(9): p. e43866.