个人简介
教育经历 1996-2000年 河南师范大学生物科学学院,生物学学士 2000-2003年 东北师范大学生命科学院遗传与细胞研究所,遗传学硕士 2003-2006年 中国科学院北京基因组研究所,遗传学博士 工作经历 2006-2007年 中国科学院北京基因组研究所,北京,研究助理 2007-2008年 杜塞尔多夫大学计算机系,德国,博士后 2008-2013年 欧洲分子生物学实验室,德国,博士后 2014-2016年 瑞士生物信息学研究所/日内瓦大学医学院,瑞士,博士后 2016年-至今 华中科技大学生命科学与技术学院,生物信息与系统生物学系,教授,博士生导师
研究领域
系统生物学和转化医学。主要包括:1)通过家系分析和GWAS发现新的与肿瘤及自身免疫病致病相关的遗传因素;2)用机器学习方法整合/发现基因突变或表达signature,以建立可用于疾病风险预测和诊断的数学模型;3)通过整合公共数据库中的疾病组学数据发现致病新机制;4)开发可用于肿瘤/自身免疫病研究、药物研发的生物信息学方法/工具
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1.Chen, W.H., et al., Energy efficiency trade-offs drive nucleotide usage in transcribed regions. Nat Commun, 2016. 7: p. 11334. (共同通讯作者) 2.He, Z., et al., Evolview v2: an online visualization and management tool for customized and annotated phylogenetic trees. Nucleic Acids Res, 2016. (共同通讯作者) 3.Chen, W.H., van Noort, V., Lluch-Senar, M., Hennrich, M.L., JA, H.W., Yus, E., Alibes, A., Roma, G., Mende, D.R., Pesavento, C. et al. (2016) Integration of multi-omics data of a genome-reduced bacterium: Prevalence of post-transcriptional regulation and its correlation with protein abundances. Nucleic Acids Res, 44, 1192-1202. 4.Lluch-Senar, M., Delgado, J., Chen, W.H., Llorens-Rico, V., O'Reilly, F.J., Wodke, J.A., Unal, E.B., Yus, E., Martinez, S., Nichols, R.J. et al. (2015) Defining a minimal cell: essentiality of small ORFs and ncRNAs in a genome-reduced bacterium. Molecular systems biology, 11, 780. (共同第一作者) 5.Chen, W.-H., et al., Human Monogenic Disease Genes Have Frequently Functionally Redundant Paralogs. PLoS Comput Biol, 2013. 9(5): p. e1003073. 6.Schonknecht, G., Chen, W.H., Ternes, C.M., Barbier, G.G., Shrestha, R.P., Stanke, M., Brautigam, A., Baker, B.J., Banfield, J.F., Garavito, R.M. et al. (2013) Gene transfer from bacteria and archaea facilitated evolution of an extremophilic eukaryote. Science, 339, 1207-1210. (共同第一作者) 7.Chen, W.H., Minguez, P., Lercher, M.J. and Bork, P. (2012) OGEE: an online gene essentiality database. Nucleic Acids Research, 40, D901-906. 8. Chen, W.-H., Trachana, K., Lercher, M.J. and Bork, P. (2012) Younger Genes Are Less Likely to Be Essential than Older Genes, and Duplicates Are Less Likely to Be Essential than Singletons of the Same Age. Molecular Biology and Evolution, 29, 1703-1706..