个人简介
学习经历 1989-1996 安徽农业大学 本科、硕士 1996-1999 中国科学院上海生物化学研究所 博士 主要工作经历与任职情况: 1999-2000 中国科学院上海生物化学研究所 研究助理 2000-2008 美国爱因斯坦医学院 博士后、研究助理 2008-2018 中国科学院上海植物生理生态研究所 研究员(百人计划,杰青) 2018- 武汉大学生命科学学院 教授 主要社会兼职: 2011-今 中国生物化学与分子生物学会RNA专业委员会委员 2014-2018 中国科学院植物生理生态研究所学位委员会副主任 2015-2018 中国科学院植物生理生态研究所学术委员会委员 2015-2018 中国科学院昆虫发育与进化生物学重点实验室副主任 2018-今 Science Bulletin生命科学副主编
研究领域
1)多种形式的RNA剪接发生机制,如alternative splicing, trans-splicing, back-splicing, minor splicing; 2)RNA剪接调控的发育、疾病机制,包括果蝇发育和人类神经、代谢、肿瘤等疾病; 3)内含子中高度保守基序的进化与功能; 4)剪接保真性与转录加工的耦联机制。
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1) Qiu C, Zhang Y, Fan YJ, Pang TL, Su Y, Zhan S*, Xu YZ* (2018). HITS-CLIP reveals sex-differential RNA binding and alterative splicing regulation of SRm160 in Drosophila. Journal of Molecular Cell Biology, in press. 2) Tang Q, Rodriguez-Santiago S, Wang J, Pu J, Yuste A, Gupta V, Moldón A, Xu YZ*, Query CC* (2016). SF3B1/Hsh155 HEAT motif mutations affect interaction with the spliceosomal ATPase Prp5, resulting in altered branch site selectivity in pre-mRNA splicing. Genes & Development 30(24): 2710-2723. 3) Gao JL, Fan YJ, Wang XY, Zhang Y, Pu J, Li L, Shao W, Zhan S, Hao J, Xu YZ* (2015). A conserved intronic U1 snRNP-binding sequence promotes trans-splicing in Drosophila. Genes & Development 29(7): 760-771. 4) Qiu C, Liu WY*, Xu YZ* (2015). Fluorescence labeling of short RNA by oxidation at the 3'-end. Methods in Molecular Biology 1297: 113-120. 5) Wang XY, Zheng ZZ, Song HS, Xu YZ* (2014). Conserved RNA cis-elements regulate alternative splicing of Lepidopteran doublesex. Insect Biochemistry and Molecular Biology 44(1), 1-11. 6) Zhang ZM, Yang F, Zhang J, Tang Q, Li J, Gu J, Zhou J*, Xu YZ* (2013). Crystal structure of Prp5p reveals interdomain interactions that impact spliceosome assembly. Cell Reports 5, 1269-1278. 7) Yang F, Wang XY, Zhang ZM, Pu J, Fan YJ, Zhou J, Query CC, Xu YZ* (2013). Splicing proofreading at 5' splice sites by ATPase Prp28p. Nucleic Acids Research 41(8), 4660-4670. 8) Shao W, Zhao QY, Wang XY, Xu XY, Li MW, Li X* and Xu YZ* (2012). Alternative splicing and trans-splicing events revealed by analysis of the Bombyx mori transcriptome. RNA 18(7), 1395-1407. 9) Shao W, Kim HS, Cao Y, Xu YZ*, Query CC* (2012). A U1–U2 snRNP interaction network during intron definition. Molecular and Cellular Biology 32(2), 470-478. 10) Xu YZ and Query CC (2007). Competition between the ATPase Prp5 and branch region-U2 snRNA pairing modulates the fidelity of spliceosome assembly. Molecular Cell 28(5), 838-849. 11) Xu YZ, Newnham CM, Kameoka S, Huang T, Konarska MM and Query CC (2004). Prp5 bridges U1 and U2 snRNPs and enables stable U2 snRNP association with intron RNA. The EMBO Journal 23(2), 376-385.