个人简介
学习经历：
1997年9月～2001年7月 天津大学理学院应用物理学专业 本科
2001年9月～2004年3月 天津大学理学院生物物理学专业 硕士 导师：张春霆 院士
2004年3月～2007年3月 天津大学理学院生物物理学专业 博士 导师：张春霆 院士
工作经历：
2007年4月～2009年6月 天津大学理学院应用物理系 讲师
2009年7月～2015年6月 天津大学理学院应用物理系 副教授
2015年7月～至今 天津大学理学院应用物理系 教授
2014年～至今 天津大学理学院应用物理系 博士生导师
科研项目：
1.主持国家重点研发计划课题，课题名称为“大肠杆菌基因组的理性设计与化学合成 ”（课题编号： 2018YFA0903702），课题经费1091万，执行期限为2019 .7-2024.6，课题负责人。
2.主持国家自然科学基金（面上基金），项目名称为“人类复制起始点系统化特征提取及全基因组预测分析”（项目编号：32270692），资助经费54万元（直接经费），执行期限为2023.1-2026.12，负责人，在研。
3.主持国家自然科学基金（科学部主任基金），项目名称为“真核生物全基因组范围复制起始点的预测”（项目编号：10747150），资助经费2万元，执行期限为2008.1-2008.12，负责人，已结题。
4.主持国家自然科学基金（青年基金），项目名称为“微生物基因组复制起始区的系统化识别及功能性分析”（项目编号：30800642），资助经费16万元，执行期限为2009.1-2011.12，负责人，已结题。
5.主持国家自然科学基金（面上基金），项目名称为“上千种细菌基因组复制起始区的规律提取及应用”（项目编号：31171238），资助经费60万元，执行期限为2012.1-2015.12，负责人，已结题。
6.主持教育部新世纪优秀人才支持计划项目（项目编号：NCET-12-0396），资助经费50 万元，执行期限为2013.1-2015.12，负责人，已结题。
7.主持国家自然科学基金（面上基金），项目名称为“酿酒酵母全基因组复制起始点的系统化分析及识别”（项目编号：31571358），资助经费57万元（直接经费），执行期限为2016.1-2019.12，负责人，已结题。
8.参加国家自然基金（重大研究项目），项目名称为“人与其它高等真核生物全基因组中的Isochore结构研究” (项目编号：90408028)，资助经费40万元，执行期限为2005.1-2007.12，主要参与人，已结题。
荣誉和奖励：
1.1997年-2006年，先后荣获“刘永龄奖学金”、“宝钢教育基金优秀学生奖”、“武田奖学金”、“荣智健奖学金”、“三星奖学金”，并获“天津大学学生科技英才”、“天津大学跨世纪优秀青年”等荣誉称号，并当选为天津大学第七次党代会代表。
2. 2006年6月，荣获第三届天津大学-南开大学研究生学术节优秀成果评选一等奖。
3. 2006年8月，荣获由共青团中央、全国青联、全国学联、全国少工委联合设立的，专门用于鼓励青少年科技创新的“中国青少年科技创新奖”。
4. 2006年12月，荣获第五届"天津大学学生科学奖"。
5. 2009年全国优秀博士学位论文提名论文及2009年天津市优秀博士学位论文。
6. 2011年，2015年&2016年获本科生毕业设计（论文）优秀指导教师称号。
7. 2012年入选教育部“新世纪优秀人才支持计划”。
8. 2012年天津大学十佳杰出青年（教工）评选中荣获优秀教书育人奖。
9. 2012年入选天津大学首批“北洋青年骨干教师“。
10. 2014年入选天津大学“北洋青年学者计划“。
11.2014年入选天津市创新型人才培养工程第三层次人选。
12.2015年入选天津市创新型人才培养工程第二层次人选。
主讲课程：
《大学物理》、《生物信息学》、《生物物理导论》、《生物信息学导论》（研究生）
近期论文
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Database Resources of the National Genomics Data Center, China National Center for Bioinformation in 2023
Nucleic Acids Research
2023 | Journal article
DOI: 10.1093/NAR/GKAC1073
WOSUID: WOS:000898953100001
CONTRIBUTORS: Xue, Yongbiao; Bao, Yiming; Zhang, Zhang; Zhao, Wenming; Xiao, Jingfa; He, Shun-min; Zhang, Guoqing; Li, Yixue; Zhao, Guoping; Chen, Runsheng et al.
Investigation of escape mechanisms of SARS-CoV-2 Omicron sub-lineages and exploration of potential antibodies for XBB.1
Journal of Infection
2023-10 | Journal article
DOI: 10.1016/j.jinf.2023.07.014
CONTRIBUTORS: Bo Sun; Feng Gao
G4Bank: A database of experimentally identified DNA G-quadruplex sequences
Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences
2023-09 | Journal article
DOI: 10.1007/s12539-023-00577-9
CONTRIBUTORS: Hong-Sheng Zhong; Mei-Jing Dong; Feng Gao
LSA-ac4C: A hybrid neural network incorporating double-layer LSTM and self-attention mechanism for the prediction of N4-acetylcytidine sites in human mRNA
International Journal of Biological Macromolecules
2023-09 | Journal article
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Part of ISSN: 0141-8130
CONTRIBUTORS: Fei-Liao Lai; Feng Gao
Editorial: Insights in evolutionary & genomic microbiology: 2022
Frontiers in Microbiology
2023-08-21 | Journal article
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CONTRIBUTORS: Ernesto Perez-Rueda; Feng Gao
Was Wuhan the early epicenter of the COVID-19 pandemic?—A critique
National Science Review
2023-03-21 | Journal article
DOI: 10.1093/nsr/nwac287
CONTRIBUTORS: Yanan Cao; Lingling Chen; Hua Chen; Yupeng Cun; Xiaofeng Dai; Hongli Du; Feng Gao; Fengbiao Guo; Yalong Guo; Pei Hao et al.
Auto-Kla: a novel web server to discriminate lysine lactylation sites using automated machine learning
Briefings in Bioinformatics
2023-03-19 | Journal article
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CONTRIBUTORS: Fei-Liao Lai; Feng Gao
RBD-ACE2 binding properties in five SARS-CoV-2 variants of concern with new perspectives in the design of pan-coronavirus peptide inhibitors
Journal of Infection
2023-02 | Journal article
DOI: 10.1016/j.jinf.2022.09.011
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DoriC 12.0: an updated database of replication origins in both complete and draft prokaryotic genomes
Nucleic Acids Research
2023-01-06 | Journal article
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CONTRIBUTORS: Mei-Jing Dong; Hao Luo; Feng Gao
Editorial: Insights in Evolutionary and Genomic Microbiology: 2021
Frontiers in Microbiology
2022 | Journal article
DOI: 10.3389/FMICB.2022.915593
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CONTRIBUTORS: Yero, Daniel; Jia, Baolei; Gao, Feng
GC-Profile 2.0: an extended web server for the prediction and visualization of CpG islands
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2022 | Journal article
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Identification and characterization of a central replication origin of the mega-plasmid pSCATT of Streptomyces cattleya
Microbiological Research
2022 | Journal article
DOI: 10.1016/J.MICRES.2022.126975
WOSUID: WOS:000794027500008
CONTRIBUTORS: Li, Peng; Zhang, Jinqi; Deng, Zixin; Gao, Feng; Ou, Hong-Yu
Ori-Finder 2022: A Comprehensive Web Server for Prediction and Analysis of Bacterial Replication Origins
Genomics, Proteomics & Bioinformatics
2022-10 | Journal article
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Part of ISSN: 1672-0229
CONTRIBUTORS: Mei-Jing Dong; Hao Luo; Feng Gao
Ori-Finder 2022: A Comprehensive Web Server for Prediction and Analysis of Bacterial Replication Origins
2022-08-11 | Preprint
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CONTRIBUTORS: Meijing Dong; Hao Luo; Feng Gao
High-quality pan-genome of Escherichia coli generated by excluding confounding and highly similar strains reveals an association between unique gene clusters and genomic islands
Briefings in Bioinformatics
2022-07-18 | Journal article
DOI: 10.1093/bib/bbac283
CONTRIBUTORS: Tong Yang; Feng Gao
EK1 with dual Q1004E/N1006I mutation: a promising fusion inhibitor for the HR1 domain of SARS-CoV-2
Journal of Infection
2022-04 | Journal article
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An Effective Preprocessing Method for High-Quality Pan-Genome Analysis of Bacillus subtilis and Escherichia coli
Methods in Molecular Biology
2021 | Journal article
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An overview of potential inhibitors targeting non-structural proteins 3 (PLpro and Mac1) and 5 (3CL(p)(ro)/M-pro) of SARS-CoV-2
Computational and Structural Biotechnology Journal
2021 | Journal article
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Data-driven identification of SARS-CoV-2 subpopulations using PhenoGraph and binary-coded genomic data
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2021 | Journal article
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CONTRIBUTORS: Zhi-Kai Yang; Lingyu Pan; Yanming Zhang; Hao Luo; Feng Gao
Database Resources of the National Genomics Data Center, China National Center for Bioinformation in 2021
Nucleic Acids Research
2021 | Journal article
DOI: 10.1093/NAR/GKAA1022
WOSUID: WOS:000608437800003
CONTRIBUTORS: Xue, Yongbiao; Bao, Yiming; Zhang, Zhang; Zhao, Wenming; Xiao, Jingfa; He, Shunmin; Zhang, Guoqing; Li, Yixue; Zhao, Guoping; Chen, Runsheng et al.
Toward a high-quality pan-genome landscape of Bacillus subtilis by removal of confounding strains
Briefings in Bioinformatics
2021 | Journal article
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Evidence for a chromosome origin unwinding system broadly conserved in bacteria
Nucleic Acids Research
2021-07-21 | Journal article
DOI: 10.1093/nar/gkab560
CONTRIBUTORS: Simone Pelliciari; Mei-Jing Dong; Feng Gao; Heath Murray
京公网安备 11010802027423号