个人简介
丁涛博士于2006年于中国科学技术大学生命科学学院获得学士学位;2012年于俄克拉荷马州立大学获得生物化学与分子生物学博士学位;2012年12月至2014年3月在密歇根大学从事博士后研究工作,导师为国际著名微生物组学专家Patrick Schloss教授。2014年4月至2018年在纽约大学完成博士后研究工作,导师为国际著名系统生物学家,麦克阿瑟天才奖获得者Elodie Ghedin教授。
研究领域
实验室的主要研究兴趣为微生态学和微生物组学,和基于菌群和宿主相互作用的系统生物学。主要研究方向包括: (1) 微生物组在传染性或慢性疾病(特别是呼吸道疾病)中的动态和功能机制; (2)呼吸道微生物组与肠道微生物组(肠道菌群)之间的协同机制,以及针对宿主免疫的协同应答; (3)基于微生态学和微生物组学大数据的生物信息学和建模等。
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1. Ding T, Schloss P. D. (2014) Dynamics and associations of microbial community types across the human body. Nature (May 15, 2014. doi: 10.1038/nature13178). 2. Ding T, Melcher U. (2016) Influences of Plant Species, Season and Location on Leaf Endophytic Bacterial Communities of Non-Cultivated Plants. PLoS ONE 11(3): e0150895. doi:10.1371/journal.pone.0150895 3. Ding T, Melcher U, Palmer MW. (2013) Community Terminal Restriction Fragment Length Polymorphisms Reveal insights into the Diversity and Dynamics of Plant-associated Bacteria. BMC Microbiology 2013, 13:1 4. Doherty M, Ding T, Koumpouras C, Telesco S, Monast C, Das A, Brodmerkel C, and Patrick Schloss. (2018) Fecal microbiota signatures are associated with response to Ustekinumab therapy among Crohn's Disease patients. mBio 9:e02120-17 5. Grote A, Voronin D, Ding T, Twaddle A, Unnasch TR, Lustingman S, Ghedin E. (2017) Defining Brugia malayi and Wolbachia symbiosis by stage-specific Dual RNA-seq. PLoS Negl Trop Dis. s 11(3): e0005357. 6. Scheets K, Blinkova O, Melcher U, Palmer MW, Wiley GB, Ding T, Roe BA. (2011) Detection of members of the Tombusviridae in the Tallgrass Prairie Preserve, Osage County, Oklahoma, USA. Virus Res. Sep;160(1-2):256-63. 7. Muthukumar V, Melcher U, Pierce M, Wiley GB, Roe BA, Palmer MW, Thapa V, Ali A, Ding T. (2009) Non-cultivated plants of the Tallgrass Prairie Preserve of northeastern Oklahoma frequently contain virus-like sequences in particulate fractions. Virus Res. 41(2):169-73.