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个人简介

个人经历 1994.9 - 1998.7 中山大学,本科,主修微生物,副修计算机 1998.9 - 2001.7 中山大学,硕士,主修生物化学与分子生物学 2004.1 - 2007.4 密歇根大学 (University of Michigan - Ann Arbor),博士,主修进化基因组学 2007.7 - 至今中山大学生命科学院教授 2012.1 - 至今 教育部长江学者特聘教授

研究领域

1. 基因复杂系统的运行与演化规律:主要以酵母细胞为模式系统,研究基因突变如何影响基因表达网络,进而导致细胞表型的改变。 2. 发育过程的细胞谱系:一个受精卵如何发育成各种脏器组成的多细胞个体是一个令人着迷的问题。我们利用果蝇,斑马鱼和小鼠为研究对象,尝试通过追踪发育过程中的体细胞突变来构建完整的一个多细胞个体的细胞谱系树,从而更清楚认识不同组织,器官或细胞类群的发育学关系。 3. 肿瘤演化:肿瘤发生,发展和转移本质上是由突变驱动的细胞演化事件,因此从随机演化而非定向发育的角度能更好认识这一过程。基于这一理念,我们分析公共数据库中的海量肿瘤组学数据,并结合具体临床样本和小鼠模型研究,尝试寻找更有效的肿瘤预防和治疗的思路和方法。

近期论文

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1. Piaopiao Chen,Dandan Wang, Han Chen, Zhenzhen Zhou, and Xionglei He. The nonessentiality of essential genes in yeast provides therapeutic insights into a human disease. Genome Res. 2016 Oct; 26(10):1355-1362. 2. Xionglei He. The Biology Complicated by Genetic Analysis. Mol Biol Evol. 2016 June 13; 33(9): 2177–2181. 3. Xionglei He, Li Liu. Toward a prospective molecular evolution. Science. 2016 May 13;352(6287):769-70. 4. Han Chen, Xionglei He. The Convergent Cancer Evolution toward a Single Cellular Destination. Mol Biol Evol. 2016 Jan;33(1):4-12. 5. Han Chen, Fangqin Lin, Ke Xing, and Xionglei He. The reverse evolution from multicellularity to unicellularity during carcinogenesis. Nat Commun. 2015 Mar 9; 6:6367. 6. Han Chen, Ke Xing, Xionglei He. The dJ/dS ratio test reveals hundreds of novel putative cancer drivers. Mol Biol Evol. 2015 Aug; 32(8):2181-5. 7. Ke Xing and Xionglei He. Reassessing the “duon” hypothesis of protein evolution. Mol Biol Evol. 2015 Apr; 32(4):1056-6. 8. Fangqin Lin, Ke Xing, Jiangzhi Zhang, and Xionglei He. Expression reduction in mammalian X chromosome evolution refutes Ohno's hypothesis of dosage compensation. PNAS. 2012 Jul 17; 109(29):11752-7. 9. Xiaoshu Chen, Zhidong Chen, Han Chen, Zhijian Su, Jianfeng Yang, Fangqin Lin, Suhua Shi, and Xionglei He. Nucleosomes suppress spontaneous mutations base-specifically in eukaryotes. Science. 2012 March 9; 335:1235-1238. 10. Yuanyan Xiong, Xiaoshu Chen, Zhidong Chen, Xunzhang Wang, Suhua Shi, Xueqin Wang, Jianzhi Zhang, and Xionglei He. RNA sequencing shows no dosage compensation of the active X-chromosome. Nature Genetics. 2010 Dec; 42(12):1043-1047.

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