个人简介

2005 – 2010, 理学博士，芝加哥大学化学系 2001 – 2005, 理学学士，中国科学技术大学化学系 工作经历 2014 - 至今，研究员（双聘），北京大学化学与分子工程学院 2013 - 至今，研究员，北京大学合成与功能生物分子中心 2012 - 至今，研究员，北京大学生命科学学院 2012 - 至今，研究员，北大清华生命联合中心 2010 – 2011，博士后，芝加哥大学生物化学与分子生物学系 第十六届霍英东青年教师基金，2018 王选青年学者奖，2017 Molecular Cell期刊 Best of Molecular Cell，2017 第十届“药明康德生命化学研究奖”学者奖，2016 中国化学会青年化学奖，2016 Nature Methods 期刊 Method of the Year， 2016 国家自然科学基金委优秀青年科学基金项目，2015 绿叶生物医药杰出青年学者奖，北京大学，2014 IUPAC Prize for Young Chemists, 2011 Chemistry Alumni Graduate Fellowship, 2009 学术任职 2017 - present, the Chinese Cell Biology Society 2013 – present, the RNA society 2013 – present, the Chinese Society of Biochemistry and Molecular Biology 2012 – present, the Chinese Crystallographic Society 2012 – present, the Chinese Chemical Society

研究领域

核酸表观遗传修饰对生命活动具有关键调控作用，也与包括癌症在内的多种人类重大疾病密切相关。我们综合运用表观遗传学、化学生物学、细胞生物学、生物化学和基因组学等多学科手段，揭示核酸表观遗传修饰的新通路、新功能与新机制。我们的研究兴趣包括：（1）RNA修饰和表观转录组学：我们绘制表观转录组的高清图谱，研究RNA修饰的功能和调控机制，从而在表观转录组学这一前沿领域发现一片“新大陆”。（2）DNA主动去甲基化：我们发展适用于单细胞测序和临床研究的表观基因组检测新技术，探索DNA表观遗传修饰作为疾病生物标志物的理论基础与临床意义。（3）蛋白质-核酸相互作用：整合化学合成、结构生物学与生物化学等多种技术手段，探索重要核酸修饰蛋白识别核酸底物的生化过程与分子机制。

实验室致力于DNA/RNA修饰及去修饰的生物学通路、功能和机制研究。为了实现这一目标，我们综合运用包括化学生物学、表观遗传学、核酸化学、细胞生物学、生物化学、基因组学和结构生物学等多学科手段，旨在揭示核酸表观遗传修饰的新颖功能和调控机制。

近期论文

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1. Shu X, Liu M, Lu Z, Zhu C, Meng H, Huang S, Zhang X, Yi C*. (2018) Genome-wide mapping reveals that deoxyuridine is enriched in the human centromeric DNA. Nat Chem Biol, 14: 680-87. 2. Li X, Xiong X, Zhang M, Wang K, Chen Y, Zhou J, Mao Y, Lv J, Yi D, Chen XW, Wang C, Qian SB, Yi C*. (2017) Base-Resolution Mapping Reveals Distinct m1A Methylome in Nuclear- and Mitochondrial-Encoded Transcripts. Mol Cell, 68: 993-1005. 3. Zhu C, Gao Y, Guo H, Xia B, Song J, Wu X, Zeng H, Kee K, Tang F*, Yi C*. (2017) Single-cell 5-formylcytosine landscapes of mammalian early embryos and ESCs at single-base resolution. Cell Stem Cell, 20: 720-31. 4. Li X, Xiong X, Wang K, Wang L, Shu X, Ma S, Yi C*. (2016) Transcriptome-wide mapping reveals reversible and dynamic N (1)-methyladenosine methylome. Nature Chemical Biology, 12:311-6. 5. Li X, Xiong X, Yi C*. (2016) Epitranscriptome sequencing technologies: decoding RNA modifications. Nature Methods, 14:23-31. (Review article for “Method of the Year 2016”) 6. Zhu C, Lu L, Zhang J, Yue Z, Song J, Zong S, Liu M, Stovicek O, Gao YQ*, Yi C*. (2016) Tautomerization-dependent recognition and excision of oxidation damage in base-excision DNA repair. PNAS, 113:7792-7. 7. Xia B, Han D, Lu X, Sun Z, Zhou A, Yin Q, Zeng H, Liu M, Jiang X, Xie W, He C*, Yi C*. (2015) Bisulfite-free, base-resolution analysis of 5-formylcytosine at the genome scale. Nature Methods, 12:1047-50. 8. Li X, Zhu P, Ma S, Song J, Bai J, Sun F, Yi C*. (2015) Chemical pulldown reveals dynamic pseudouridylation of the mammalian transcriptome. Nature Chemical Biology, 11:592–7.