个人简介
2021.09-至今: 上海交通大学张江高等研究院,教授(兼)
2020.09-至今: 上海交通大学生命科学技术学院,教授
2012.01-2020.08:武汉大学药学院,教授
2011.01-2011.12:中科院上海有机化学研究所,副研究员
2008.11-2010.12:中科院上海有机化学研究所,助理研究员
2007.09-2008.10:美国麻省理工学院化学系,博士后
2002.09-2007.07:中科院上海有机化学研究所,博士
1998.09-2002.07:华东师范大学化学系,本科
研究领域
天然药物碳骨架的生物合成与编辑
对惰性碳的选择性活化是化学领域的难点和热点,亦是药物研发和生产领域的瓶颈。天然产物成药高度依赖于结构优化,然而由于骨架碳原子反应惰性及整体结构的复杂性,对天然产物碳骨架的结构修饰极具挑战,因此复杂天然产物碳骨架的成药性研究一直被认为是天然药物研发的“禁区”。对于结构相对简单的合成/半合成药物的生产,由于缺乏经济的、高立体选择性的骨架合成及直接的碳位点延伸方法,常需繁冗的反应步骤和高昂的生产成本实现药物的合成/半合成。因此,普适、高效的碳骨架修饰/合成方法,对天然药物研发和药物生产具有重要意义。聚酮、甾体和氮杂环涵盖了近7万种天然产物和一千多种天然/半合成/合成药物,是重要的化合物类群。本实验室长期致力于这三大类天然产物骨架的生物合成与编辑方法的开发与应用。通过解析天然产物骨架生物合成的普适性规律,综合酶工程,生物催化,结构生物学,合成生物学等多学科技术手段,对生物合成途径进行升级或再设计,发展出针对上述各类骨架的普适、高效的生物合成与编辑策略,用于拓展结构多样性和提高药物的生产效率,实现对三大类碳骨架资源及药物的深度开发和高效生产。
近期论文
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Fuzheng Song, Mengmeng Zheng, Junlin Wang, Huanhuan Liu, Zhi Lin, Bengbeng Liu, Zixin Deng, Qianghui Zhou*, Xudong Qu*. A modular chemoenzymatic approach to C14-functionalized steroids.Nature Synthesis 2023, DOI: 10.1038/s44160-023-00280-z.
Chenghai Sun, Wenya Tian, Zhi Lin*, Xudong Qu*.Biosynthesis of pyrroloindoline-containing natural products.Natural Product Reports 2022, 39, 1721-1765..
Xiaoli Yan, Jun Zhang, Hongqun Tan, Zhihao Liu, Kai Jiang, Wenya Tian, Mengmeng Zheng, Zhi Lin, Zixin Deng, Xudong Qu*. A pair of atypical KAS III homologues with initiation and elongation functions programs the polyketide biosynthesis in asukamycin.Angewandte Chemie International Edition 2022, e202200879
Mengmeng Zheng, Jun Zhang, Wan Zhang, Lu Yang, Xiaoli Yan, Wenya Tian, Zhihao Liu, Zhi Lin, Zixin Deng, Xudong Qu*. An atypical acyl-CoA synthetase enables efficient biosynthesis of extender units for engineering a polyketide carbon scaffold.Angewandte Chemie International Edition 2022, e202208734..
Haidong Peng, Yaya Wang, Yanan Zhang, Zixing Deng, Zhenghua Tian, Xudong Qu*.A dual role reductase from phytosterol catabolism enables efficient production of valuable steroid precursors.Angewandte Chemie International Edition 2021, 60, 5414-5420.
Lu Yang, Jinmei Zhu, Chenghai Sun, Zixin Deng, Xudong Qu*.Biosynthesis of plant tetrahydroisoquinolines alkaloids through an imine reductase route.Chemical Science 2020, 11, 364-371 (2019 Chemical Science HOT Article Collection).
Chenghai Sun, Zhenyao Luo (co-first author), Wenlu Zhang, Wenya Tian, Haidong Peng, Zhi Lin, Xiaoli Yan, Yanan Zhang, Zixin Deng, Bostjan Kobe*, Xinying Jia*, Xudong Qu*.Molecular basis of regio- and stereo-specificity in biosynthesis of bacterial heterodimeric ketopiperazines.Nature Communications 2020, 11, 6251.
Wenya Tian, Chenghai Sun (co-first author), Mei Zheng, Mingjia Yu, Yanan Zhang, Haidong Peng, Dongqing Zhu, Jeffery Harmer, Zixin Deng, Shilu Chen, Mohedi Mobli, Xinying Jia*, Xudong Qu*.Efficient biosynthesis of heterodimeric C3-aryl pyrroloindoline alkaloids.Nature Communications 2018, 9, 4428.
Chengcheng Chang, Rong Huang (co-first author), Yan Yan, Hongmin Ma, Zheng Dai, Benying Zhang, Wen Liu, Zixin Deng, Xudong Qu*.Uncovering the formation and selection of benzylmalonyl-CoA from the biosynthesis of splenocin and enterocin reveals a versatile way to introduce amino acids into Polyketide carbon scaffolds. Journal of the American Chemical Society 2015, 137, 4183-4190.