个人简介
2022年6月于清华大学获博士学位，师从张奇伟教授。2022年9月加入复旦大学类脑智能科学与技术研究院，担任青年副研究员。自2017年以来，主要研究方向为空间多组学计算方法的开发及在大脑和疾病中的应用。专注“空间生物信息学“这一方向，以第一作者开发多个计算生物学方法，并应用于生物学和医学问题。研究成果入选Nature Methods亮点文章并专题评论。受国自然、上海市科委、上海市教委等科研/人才项目资助。获中国生物信息学十大进展、周传奖、世界人工智能大会青年优秀论文奖等奖项。
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Z Yuan*, Q Zhou*, L Cai*, et al., Y Chen#, X Zhang# & MQ Zhang#. SEAM is a spatial single nuclear metabolomics method for dissecting tissue microenvironment. Nature Methods18, 1223–1232 (2021).
Z Yuan*#, W Pan*, X Zhao, F Zhao, X Li, Y Zhao, MQ Zhang# & J Yao#. SODB facilitates comprehensive exploration of spatial omics data. Nature Methods20, 387–399 (2023).
Z Yuan*#, Y Li*, M Shi, F Yang, J Gao, J Yao# & MQ Zhang#. SOTIP is a versatile method for microenvironment modeling with spatial omics data. Nature Communications13, 7330 (2022).
Z Yuan*#. MENDER: Fast and scalable tissue structure identification in Spatial Omics Data. Nature Communications15, 207 (2024).
S Lin*, F Zhao, Z Wu, J Yao, Y Zhao# &Z Yuan#. Streamlining spatial omics data analysis with Pysodb. Nature Protocols(2023).
Z Yuan*#& J Yao#. Harnessing Computational Spatial Omics to Explore the Spatial Biology Intricacies. Seminars in Cancer Biology(2023).
T Guo*,Z Yuan*, Y Pan, J Wang, F Chen, MQ Zhang#, X Li#. SPIRAL: integrating and aligning spatially resolved transcriptomics data across different experiments, conditions, and technologies. Genome Biology24, 241 (2023).
学术兼职
独立担任Nature Methods、Nature Metabolism、Cell Systems、Nature Communications、Cell Reports、Genome Biology等期刊审稿人
京公网安备 11010802027423号