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个人简介

教育经历 2001/09-2005/07 中国科学技术大学 获化学理学学士 2005/09-2010/07 中国科学院上海有机化学研究所 获有机化学博士学位 工作经历 2010/07-2013/05 中国科学院上海有机化学研究所 助理研究员 2013/05-2019/09 中国科学院上海有机化学研究所 副研究员 2019/10-至今 复旦大学药学院 副研究员

研究领域

研究和发展基于结构药物分子设计中的关键理论和方法,包括:建立评价蛋白-配体打分函数性能的方法体系CASF,研究蛋白-配体亲合性计算中的关键因素,发展新一代打分函数,开发全新药物分子设计新方法等。 研究蛋白-蛋白相互作用界面的特征作用模式,发展调控蛋白-蛋白作用体系的小分子设计新策略,并应用于实际的靶标体系中。 以分子模拟为手段研究与重大疾病相关的药物靶标与小分子化合物的相互作用,辅助先导化合物的发现和优化。

近期论文

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Li, Y.*; Zhang, Z.; Wang, R. HydraMap v.2: Prediction of hydration sites and desolvation energy with refined statistical potentials. J. Chem. Inf. Model. 2023, 63, 4749-4761. Gong, Q.; Wang, H.; Zhou, M.; Zhou, L.; Wang, R.; Li, Y.* B-cell lymphoma-2 family proteins in the crosshairs: small molecule inhibitors and activators for cancer therapy. Med. Res. Review 2023, in press. Ma, Q.; Zhu, L.; Zhang, Z.; Xiong, Y.; Li, Y.*; Lei, X. Synthesis, biological evaluation, and molecular modeling of ORM-10921 and its analogs as a2c-adrenoceptor antagonists. Arch Pharm, 2023, 356, 2300125. Liu, H.; Su, M.; Lin, H.*; Wang, R.*; Li, Y.* Public data set of protein-ligand dissociation kinetic constants for quantitative structure-kinetics relationship studies. ACS Omega 2022, 22, 18985-18996. Li, Y.; Fan, W.; Gong, Q.; Tian, J.; Zhou, M.; Li, Q.; Uwituze, L. B.; Zhang, Z.*; Hong, R.*; Wang, R. X.* Structure-Based Optimization of 3-Phenyl-N-(2-(3-phenylureido)ethyl)thiophene-2-sulfonamide Derivatives as Selective Mcl-1 Inhibitors. J. Med. Chem. 2021, 64, 10260-10285. Zhang L.; Yao, D.; Zhou, F.; Zhang, Q.; Xia, Y.; Wang, Q.; Qin, A.; Zhao, J.; Li, D.; Li, Y.*; Zhou, L.*; Cao, Y.* Sci. Bull. 2021, 66, 1550-1558. Li, Y.*; Sun, Y.; Song, Y.; Dai, D.; Zhao, Z.; Zhang, Q.; Zhong, W.; Hu, L. A.; Ma, Y.; Li, X.*; Wang, R.* Fragment-based computational method for designing GPCR ligands. J. Chem. Inf. Model. 2020, 60, 4339-4349. Li, Y.*; Gao Y.; Holloway, M. K.; Wang, R.* Prediction of the Favorable Hydration Sites in a Protein Binding Pocket and Its Application to Scoring Function Formulation. J. Chem. Inf. Model. 2020, 60, 4359-4375.

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