张法 - 北京理工大学 - 医学技术学院

个人简介

张法，博士，北京理工大学长聘教授，中科院计算所客座研究员，博士生导师。现任IEEE 计算生命科学专委会 (TCCLS)主席，中国计算机学会生物信息学专委会秘书长。主要从事生物信息学、多模态生物医学数据处理等方面的研究：研发了国内首款冷冻电镜三维重构软件-AuTOM，获2021年国际三维模型检索挑战赛冷冻电镜生物图像分类大赛全球第一名；开发了系列医学病理图像分类分级AI处理技术，相关研究成果已在多家医院应用。作为项目负责人和主要参与人承担了多项科技部重点研发专项、国家自然科学基金重点、国际合作重大和专项项目等项目。在Cell Research、Natural Communication、Sciences Advances、Briefing in Bioinformatics等国际期刊和ICCV、ISMB、MICCAI等顶级国际会议发表论文160余篇，获得MICCAI 2022 Best Paper。教育培训经历 2000.09-2005.06 中国科学院计算技术研究所博士 2002.09-2005.04 美国俄亥俄州立大学交换访问学生工作经历 2022.11-至今北京理工大学医学技术学院长聘教授 2005.07-2022.10 中国科学院计算技术研究所历任助理研究员、副研究员、研究员 2009.10-2010.02 西班牙胡安卡洛斯国王大学访问科学家所获奖励/荣誉 2022年国际会议MICCAI最佳论文奖 2021 年国际三维模型检索挑战赛(SHREC2021)冷冻电镜电子断层生物图像分类大赛，第一名 2021年度中科院计算所奖教金 2020 年中科院“先导杯”并行计算应用大奖赛优胜奖 2018 年、2012 年、2009 年中科院计算所优秀科研人员 2016 年“天河之星”优秀应用奖

研究领域

多模态生物医学数据分析、生物信息学、冷冻电镜三维重构

近期论文

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H Zhang, H Li, F Zhang*, P Zhu*. A strategy combining denoising and cryo-EM single particle analysis. Briefings in Bioinformatics, 2023, bbad148 Y Yu, P Ding, H Gao, G Liu, F Zhang*, B Yu*. Cooperation of local features and global representations by a dual-branch network for transcription factor binding sites prediction. Briefings in Bioinformatics, 2023, 24(2), bbad036 Z Peng, W Wang, R Han, F Zhang*, J Yang*. Protein structure prediction in the deep learning era, Current Opinion in Structural Biology, 2022, 77, 102495 B He, Y Zhang, F Zhang*, R Han*. Correction of image distortion in large-field ssEM stitching by an unsupervised intermediate-space solving network. Bioinformatics, 2022, 38 (20), 4797-4805 Y Hao, X Wan, R Yan, Z Liu, J Li, S Zhang*, X Cui*, F Zhang*. VP-Detector: A 3D multi-scale dense convolutional neural network for macromolecule localization and classification in cryo-electron tomograms. Computer Methods and Programs in Biomedicine, 2022, 221, 106871 Z Lv, Y Lin, R Yan, Y Wang*, F Zhang*. TransSurv: Transformer-based Survival Analysis Model Integrating Histopathological Images and Genomic Data for Colorectal Cancer. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2022, DOI: 10.1109/TCBB.2022.3199244 H Li, H Zhang, X Wan, Z Yang, C Li, J Li, R Han*, P Zhu*, F Zhang*. Noise-Transfer2Clean: Denoising cryo-EM images based on noise modeling and transfer. Bioinformatics, 2022, 38 (7), 2022–2029 C Liu, W Liu, S Wang*, H Li, Z Lv, F Zhang*, D Zhang, J Teng, T Zheng, D Li, M Zhang, P Xu, Q Gong*. Super-resolution nanoscopy by coherent control on nanoparticle emission. Science Advances, 2020, 6, eaaw6579 R Yan, F Ren, Z Wang, L Wang, T Zhang, Y Liu, X Rao*, C Zheng*, F Zhang*. Breast cancer histopathological image classification using a hybrid deep neural network. Methods, 2020, 173 (1), 52-60 F Xu, M Zhang, W He, R Han, F Xue, Z Liu, F Zhang*, J Lippincott-Schwartz*, P Xu*. Live cell single molecule-guided Bayesian localization super resolution microscopy. Cell research, 2017, 27 (5), 713-716

学术兼职

IEEE 计算生命科学专委会 (Technical Committee on Computational Life Sciences) ，主席中国计算机学会CCF生物信息专委会，秘书长中国生物物理学会冷冻电镜分会，理事中国人工智能学会CAAI生物信息学与人工生命专委会，常委国际期刊 International Journal of Data Mining and Bioinformatics，编委国际期刊 Journal of Computer Science and Technology 青年编委医学影像人工智能湖南省重点实验室，学术委员会委员西安市计算生物信息学重点实验室，学术委员会委员