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个人简介

史文聿 博士、副教授,2010年毕业于中央民族大学统计学专业,2017年毕业于中国科学院大学遗传学专业,先后在中国科学院微生物研究所和中国农业大学就职。主要从事微生物与宿主的互作关系解析、大数据挖掘和人工智能算法设计和大数据平台构建工作,擅长用数学工具解决生物学问题。 学习与工作经历 2022.10 至今 中国农业大学 生物学院 (副教授) 2017.09 - 2022.09 中国科学院微生物研究所 微生物资源与大数据中心 (助理研究员) 2011.09 - 2017.07 中国科学院大学 生命学院 中国科学院北京生命科学研究院 生物信息学 (博士) 2006.09 - 2010.07 中央民族大学 理学院 统计学 (学士) 承担项目及课题 自然基金青年项目,宏基因组功能基因的靶向挖掘算法研究,2019.01 – 2021.12,23 万元,课题负责人,完成 自然基金面上项目,基于宏基因组数据的微生物表型与生长条件精准预测算法研究,2022.01 – 2025.12, 58 万元,课题负责人,在研

研究领域

生物信息学、计算基因组学、微生物组学

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Dongmei Liu(#), Yifei Zhang, Guomei Fan, Dingzhong Sun, Xingjiao Zhang, Zhengfei Yu, Jinfeng Wang, Linhuan Wu, Wenyu Shi(*), Juncai Ma(*). IPGA: A handy integrated prokaryotes genome and pan‐genome analysis web service. iMeta, 2022: e55. Wenyu Shi(#), Guomei Fan, Zhihong Shen, Chuan Hu, Juncai Ma, Yuanchun Zhou, Zhen Meng, Songnian Hu, Yuhai Bi, Liang Wang, Haiying Yu, Siru Lin, Xiuqiang Sun, Xinjiao Zhang, Dongmei Liu, Qinlan Sun(*), Linhuan Wu(*). gcCov: Linked open data for global coronavirus studies[J]. Mlife, 2022, 1(1): 92-95. Wenyu Shi(#), Qinlan Sun(#), Guomei Fan, Sugawara Hideaki, Ohkuma Moriya, Takashi Itoh, Yuguang Zhou, Man Cai, Song-Gun Kim, Jung-Sook Lee, Ivo Sedlacek,David R. Arahal, Teresa Lucena, Hiroko Kawasaki, Lyudmila Evtushenko, Bevan S. Weir, Sarah Alexander, Dlauchy Dénes, Somboon Tanasupawat, Lily Eurwilaichitr, Supawadee Ingsriswang, Bruno Gomez-Gil, Manzour H. Hazbón, Marco A. Riojas, Chatrudee Suwannachart, Su Yao, Peter Vandamme, Fang Peng, Zenghui Chen, Dongmei Liu, Xiuqiang Sun, Xinjiao Zhang, Yuanchun Zhou, Zhen Meng, Linhuan Wu(*), Juncai Ma(*). gcType: A High-quality 10K type strain genome database for microbial phylogenetic and functional research, Nucleic Acids Research, 2021, 49(D1): D694-D705. Wenyu Shi(#), Heyuan Qi(#), Qinglan Sun, Guomei Fan, Shuangjiang Liu, Jun Wang, Baoli Zhu, Hongwei Liu, Fangqing Zhao, Xiaochen Wang, Xiaoxuan Hu, Wei Li, Jia Liu, Ye Tian, Linhuan Wu(*), Juncai Ma(*). gcMeta: a Global Catalogue of Metagenomics platform to support the archiving, standardization and analysis of microbiome data, Nucleic Acids Research, 2019, 47(D1): D637-D648. Jinfeng Wang(#), Jiayong Zheng(#), Wenyu Shi(#), Nan Du, Xiaomin Xu, Yanming Zhang, Peifeng Ji, Fengyi Zhang, Zhen Jia, Yeping Wang, Zhi Zheng, Hongping Zhang, Fangqing Zhao(*). Dysbiosis of maternal and neonatal microbiota associated with gestational diabetes mellitus. Gut, 2018, 67(9): 1614-1625. Wenyu Shi(#), Peifeng Ji(#), Fangqing Zhao(*). The combination of direct and paired link graphs can boost repetitive genome assembly, Nucleic Acids Research, 2017, 45(6): e43-e43.

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