个人简介
沈乾,长聘教轨副教授（博士生导师，独立PI）
个人简介：
2005.09 – 2009.06 浙江农林大学， 生物技术专业， 理学学士
2009.09 – 2015.09 上海交通大学， 生物医学工程（生物技术）专业，工学博士
2015.10 – 2019.10 上海交通大学， 园艺学流动站， 博士后
2018.04 – 2019.05 美国康奈尔大学， 生物技术中心， 访问学者
2020.06 – 至今 上海交通大学，农业与生物学院，PI, 博士生导师
本课题组拟综合运用分子生物学、基因组学、转录组学、代谢组、生物化学、基因编辑、多基因组装等相关技术和方法，开展植物合成生物学底盘改良，天然产物元件挖掘与设计、代谢通路模块装配集成与重构，天然产物转录调控等方面研究，最终改进植物高附加值天然产物的生物合成效率和其生产方式。
研究项目：
国家自然科学青年基金，项目编号：31600231 (主持), “甲基茉莉酸响应的bHLH类转录因子在青蒿素生物合成中的调控机制研究”. 01/2017- 12/2019
中国博士后科学基金一等资助，项目编号：2016M590356 (主持), “MYC类转录因子调控青蒿素生物合成的机制研究”. 05/2016- 08/2019
国家重大新药创制科技重大专项资助课题，项目编号：2017ZX09101002-003-002 (参与), “高产青蒿素的黄花蒿优良品系代谢工程育种研究” 01/2017-12/2020.
国家高技术研究发展（863）计划，项目编号：2011AA100605 (参与), “植物代谢产物生物反应器产品研发” 01/2011-12/2016
Bill & Melinda Gates Foundation，项目编号：OPP1199872 (参与) ，“Identification and functional characterization of putative enzymes involved in the artemisinin biosynthesis from Artemisia annua”。09/2018-12/2019
授权发明专利
一种青蒿bHLH类转录因子编码序列及克隆方法与应用，发明人：唐克轩、沈乾、赵彧、张婷婷、孙小芬，授权日：2020.03.06，专利号：ZL 201610680590.6
一种青蒿WRKY类转录因子编码序列及克隆方法与应用，发明人：唐克轩、沈乾、王蕾、江伟民、郝小龙、黎凌，授权日：2020.02.07，专利号：ZL 201610682275.7
一种青蒿bHLH类转录因子编码序列及克隆方法与应用，发明人：唐克轩、沈乾、赵彧、王玉亮，授权日：2020.02.07，专利号：ZL 201610680603.X
一种青蒿bZIP类转录因子编码序列及克隆方法与应用，发明人：唐克轩、沈乾、黄华仪、颜廷祥、陈明慧、何倩，授权日：2019.11.26，专利号：ZL 201610682249.4
一种青蒿bZIP类转录因子编码序列及克隆方法与应用，发明人：唐克轩、沈乾、马亚男、吕宗友、潘琪芳、唐岳立，授权日：2019.12.10，申请号：ZL 201610680529.1
一种青蒿bZIP类转录因子编码序列及克隆方法与应用，发明人：唐克轩、沈乾、赵彧、付雪晴、石璞、刘萌，授权日：2019.11.26，专利号：ZL 201610680579.X
一种青蒿MYC2转录因子蛋白编码序列及其应用，发明人：唐克轩、沈乾、陆续、付雪晴、颜廷祥、孙小芬、王国丰，授权日：2015.09.30，专利号：ZL 201310413155.3
转DBR2基因提高青蒿中青蒿素含量的方法，发明人：唐克轩、沈乾、陈韵斐、王涛、吴韶龑、陆续，授权日：2015.07.08，专利号：ZL 201210014227.2
一种调控基因在非分泌型腺毛中表达的启动子及其应用，发明人：唐克轩、陈俏、沈乾、付雪晴、石璞、孙小芬、颜廷祥，授权日：2017.12.29，专利号：ZL 201510727603.6
一种调控基因在非分泌型腺毛中表达的启动子及其应用，发明人：唐克轩、陈俏、沈乾、付雪晴、石璞、孙小芬、颜廷祥，授权日：2017.11.10，专利号：ZL 201510729014.1
欢迎对本课题组研究方向感兴趣的博士后，博士生，硕士生和本科生加盟！
研究领域
植物合成生物学和植物天然产物转录调控
植物合成生物学是一门综合生物学，生物化学，工程学，数学模型等多学科的技术，以工程化的方式来设计和解决生物学问题。近年来，合成生物学从单细胞的生物元器件和回路的研究，逐渐过渡到了多细胞的复杂体系。
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1. Hassani, D., Fu, X., Shen, Q., Khalid, M., Rose, J.K.C., and Tang, K. (2020). Parallel Transcriptional Regulation of Artemisinin and Flavonoid Biosynthesis. Trends in Plant Science 25, 466-476.
2. Shen Q, Huang H, Zhao Y, Xie L, He Q, Zhong Y, Wang Y, Wang Y, Tang k. (2019). The transcription factor AabZIP9 positively regulates the biosynthesis of artemisinin in Artemisia annua. Frontiers in Plant Science 10:1294.
3. Lv Z, Guo Z, Zhang L, Zhang F, Jiang W, Shen Q, Fu X, Yan T, Shi P, Hao X, et al. (2019). Interaction of AaTGA6 with salicylic acid signaling modulates artemisinin biosynthesis in Artemisia annua. Journal of Experimental Botany 70(15):3969-3979.
4. Kayani S, Shen Q, Ma Y, Fu X, Xie L, Zhong Y, Chen T, Pan Q, Li L, Rahman S, et al. (2019). The YABBY family transcription factor AaYABBY5 directly targets cytochrome P450 monooxygenase (CYP71AV1) and double bond reductase 2 (DBR2) involved in artemisinin biosynthesis in Artemisia annua. Frontiers in Plant Science 10: 1084.
5. Shen Q*, Zhang L*, Liao Z*, Wang S, Yan T, Shi P, et al. (2018). The genome of Artemisia annua provides insight into the evolution of Asteraceae family and artemisinin biosynthesis. Molecular Plant 11(6): 776-788.
6. Ma Y, Xu D, Li L, Zhang F, Fu X, Shen Q, Lyu, Wu Z, Pan Q, Shi P et al. (2018) Jasmonate promotes artemisinin biosynthesis by activating the TCP14-ORA complex in Artemisia annua. Science Advances 2018, 4(11):eaas9357.
7. Shi P, Fu X, Shen Q, Liu M, Pan Q, Tang Y, Jiang W, Lv Z, Yan T, Ma Y, et al. (2017). The roles of AaMIXTA1 in regulating the initiation of glandular trichomes and cuticle biosynthesis in Artemisia annua. New Phytologist 217(1): 261-276.
8. Yan T, Chen M, Shen Q, Li L, Fu X, Pan Q, Tang Y, Shi P, Lv Z, Jiang W, et al. (2017). HOMEODOMAIN PROTEIN 1 is required for jasmonate‐mediated glandular trichome initiation in Artemisia annua. New Phytologist 213(3): 1145-1155.
9. Chen M, Yan T, Shen Q, Lu X, Pan Q, Huang Y, Tang Y, Fu X, Liu M, Jiang W, et al. (2017). GLANDULAR TRICHOME-SPECIFIC WRKY 1 promotes artemisinin biosynthesis in Artemisia annua. New Phytologist 214(1): 304-316.
10. Shen Q*, Lu X*, Yan T, Fu X, Lv Z, Zhang F, Pan Q, Wang G, Sun X, Tang K. (2016). The jasmonate-responsive AaMYC2 transcription factor positively regulates artemisinin biosynthesis in Artemisia annua. New Phytologist 210(4): 1269-1281.（ESI高被引论文）
11. Shen Q, Yan T, Fu X, Tang K. (2016). Transcriptional regulation of artemisinin biosynthesis in Artemisia annua L. Science Bulletin 61(1): 18-25. (封面论文)
12. Tang K, Shen Q, Lu X, Zhang F. (2016). Improving artemisinin content in Artemisia annua by transcription factor regulation. Pushing the boundaries of scientific research: 120 years of addressing global issues (Science/AAAS, Washington, DC, 2016) This is a sponsored supplement. Science 351(6278): p.48-51.
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