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个人简介

1992年9月至1996年7月,北京师范大学数学系计算机专业本科生,获理学学士;2005年9月至2008年7月,北京师范大学生命与科学学院生物信息学研究生,获理学硕士;2008年9月至2011年7月,北京师范大学生命与科学学院生物信息学研究生,获理学博士。现为北京师范大学生命科学学院教授,博士生导师。 讲授课程 《C语言程序设计》生命科学学院本科生课程 《Perl语言程序设计》生命科学学院本科生课程 《Perl语言程序设计》生命科学学院研究生课程 《Linux操作系统》生命科学学院研究生课程

研究领域

感兴趣的问题是基因组中信号的识别及其功能注释,具体设涉及的信号有:可变剪切信号、物种间保守信号和遗传变异信号; 所涉及的数据有基因组、转录组、表观遗传组和变异组上。具体研究内容: 可变剪切信号的识别及其功能注释 物种间保守序列的识别及其功能注释 遗传变异的识别及其功能注释

近期论文

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Sun, Y., Zhang, Q., Liu, B., Lin, K., Zhang, Z., and Pang, E.*, CuAS: a database of annotated transcripts generated by alternative splicing in cucumbers. BMC Plant Biol, 2020. 20(1): 119. Lai YT, Yeung CKL, Omland KE, Pang EL, Hao Y, Liao BY, Cao HF, Zhang BW, Yeh CF, Hung CM, Hung HY, Yang MY, Liang W, Hsu YC, Yao CT, Dong L, Lin K, Li SH(2019). Standing genetic variation as the predominant source for adaptation of a songbird. Proc Natl Acad Sci U S A, 2019, 116(6):2152-2157. Song H, Lin K, Hu J, Pang E(2018). An Updated Functional Annotation of Protein-Coding Genes in the Cucumber Genome. Frontiers in Plant Science, 2018, 9 :325. Sun Y, Hou H, Song H, Lin K, Zhang Z, Hu J, Pang E(2018). The comparison of alternative splicing among the multiple tissues in cucumber. BMC Plant Biol, 2018, 18(1):5. Pang E, Hao Y, Sun Y, Lin K(2016). Differential variation patterns between hubs and bottlenecks in human protein-protein interaction networks. BMC Evol Biol, 2016, 16(1):260. Cao, H., Pang, E., & Lin, K.(2016). Hierarchical Map of Orthologous Genomic Regions Reconstructed from Two Closely Related Genomes: Cucumber Case Study. The Plant Genome, 9(3). Pang, E., Wu, X., & Lin, K. (2016). Different evolutionary patterns of snps between domains and unassigned regions in human protein-coding sequences. Molecular Genetics & Genomics, 1-10. Wu, X.M., Pang, E.L., Lin, K. and Pei, Z.M. (2013) Improving the Measurement of Semantic Similarity between Gene Ontology Terms and Gene Products: Insights from an Edge- and IC-Based Hybrid Method. PLOS ONE, doi:10.1371/journal.pone.0066745. Guo, S.G., Zhang, J.G., Sun, H.H.,..., Tan, T., Pang E.L., Lin K.,..., Fei, Z.J. and Xu, Y. (2012) The draft genome of watermelon (Citrullus lanatus) and resequencing of 20 diverse accessions. Nature Genetics, doi:10.1038/ng.2470. [Online PDF] Pang, E.L., Tan, T. and Lin, K. (2012) Promiscuous domains: faci litating stability of the yeast protein-protein interaction network. Mol. BioSyst., doi:10.1039/C1MB05364G. Pang, E.L. and Lin, K. (2010) Yeast protein–protein interaction binding sites: prediction from the motif–motif, motif–domain and domain–domain levels. Molecular BioSystems, doi: 10.1039/C0MB00038H. 谭涛, 庞尔丽*. 近缘物种基因组共线性片段的识别及其应用. 北京师范大学学报(自然科学版)2013(1) 庞尔丽. 蛋白质结构域研究进展简述. 生物学通报 2013(3) 庞尔丽. 蛋白质相互作用研究进展简述. 生物学通报 2012(11) 庞尔丽. 支架式教学与计算机程序设计语言. 计算机时代 2012(12). 庞尔丽. C 语言程序设计中任务驱动下的协作学习. 计算机教育 2006(5)

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