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中国经济增长中资本-产出分析 樊瑛、袁强、方福康，北京师范大学学报（自然科学版）第34卷，第1期，131-134（1998）
分阶段的Solow经济增长模型 陈家伟、樊瑛、方福康，北京师范大学学报（自然科学版）第34卷，第3期，352-355（1998）
数字地球与经济复杂性研究 方福康、樊瑛，中国图像图形学报 第4卷（A版），1-5（1999年4月增刊）
R&D部门的最优投资 董洪光、樊瑛、方福康，北京师范大学学报（自然科学版）第36卷，第1期，66-69（2000）
论包含技术进步的经济增长理论 董洪光、樊瑛、方福康，北京师范大学学报（自然科学版）第36卷，第3期，325-328（2000）
一个包含有R&D的两部门动力学模型 董洪光、樊瑛、方福康，北京师范大学学报（自然科学版）第36卷，第5期，654-659（2000）
一个“J”动力学模型 陈清华、樊瑛、王大辉，北京师范大学学报（自然科学版）第38卷，第4期，470-474（2002）
Dension因素分析法和中国经济增长 陈清华、樊瑛、方福康，北京师范大学学报（自然科学版）第38卷，第4期，486-491（2002）
陈清华，樊瑛，方福康。一种多部门经济增长因素分析方法。北京师范大学学报（自然科学版），2003，39（3）：335-339
樊瑛、狄增如、方福康，经济波动的内生动力学模型 北京师范大学学报（自然科学版），2004年，第40卷，第2期，276-279。
樊瑛、狄增如、方福康，包含人力资本的宏观经济增长模型 北京师范大学学报（自然科学版）2004年，第40卷，第3期，417-421。
樊瑛、张鹏，中国人力资本对经济增长的作用的计量 北京师范大学学报（自然科学版）2004年，第40卷，第6期，788-790。
Ying Fan, Menghui Li, Jiawei Chen, Liang Gao, Zengru Di, Jinshan Wu. Network of econophysicists: a network to investigate the development of econophysics. International Journal of Modern Physics B，Vol.18, Nos.17-19(2004) 2505-2511.
Menghui Li, Ying Fan, Jiawei Chen, Liang Gao, Zengru Di, Jinshan Wu. Weighted networks of scientific communication:the measurement and topological role of weight. Physic A,350(2005) 643-656
张鹏、李梦辉、吴金闪、狄增如、樊瑛 科学家合作网络的聚类分析 复杂系统与复杂性科学 2005年，第2卷，第2期，30-34。
Peng Zhang, Menghui Li, Jinshan Wu, Zengru Di ,Ying Fan*. The analysis and dissimilarity comparison of community structure. Physica A, 367, 577-585(2006).
Menghui Li, Dahui Wang, Ying Fan, Zengru Di,Jinshan Wu. Modelling weighted networks using connection count. New J. Phys. 8 72. (2006).
Ying Fan, Menghui Li, Zengru Di. Increasing returns to scale dynamics of industrial structure and size distribution of firms. Journal of Systems Science and Systems Engineering, Volume 15, Issue 1, March 2006, Pages 19-33.
Menghui Li, Ying Fan*, Dahui Wang, Daqing Li, Jinshan Wu, Zengru Di. Small-world effect induced by weight randomization on regular networks, Physics Letters A, 364 (2007) 488–493.
Daqing Li, Menghui Li, Jinshan Wu, Zengru Di, Ying Fan* .Enhancing Synchronizability by Weights Randomization on Regular Networks, Eur. Phys. J. B 57, (2007) 423–428.
Ying Fan, Menghui Li, Peng Zhang, Jinshan Wu ,Zengru Di. Accuracy and precision of methods for community identification in weighted networks, Physica A, 377 (2007) , 363-372.
Ying Fan, Menghui Li, Peng Zhang, Jinshan Wu, Zengru Di. The Effect of Weight on Community Structure of Networks, Physica A, 378, (2007) 583-590.
Menghui Li, Jinshan Wu, Dahui Wang, Tao Zhou, Zengru Di and Ying Fan*,, Evolving model of weighted networks inspired by scientific collaboration networks, Physica A, 375, (2007), 355-364.
贾炜、蔡维、樊瑛* 一个关于中国股票市场和宏观经济相互关系的实证分析，北京师范大学学报（自然科学版）2007年，第43卷，第1期，93-96
Lei Chai, Jiawei Chen,Zhanggang Han,Zengru Di, Ying Fan*.Emergence of Specialization from global optimizing evolution in a multi-agent system. ICCS 2007,part IV,LNCS 4490.PP.98-105,2007(Y.Shi et al. (Eds), Springer-Verlag Berlin Heidelberg 2007)(IDS Number: BGH52)
Wang Dahui, Wei Ziqiang, Fan Ying. Hysteresis phenomena of the intelligent driver model for traffic flow, Physical Review E 75,1(2007)
Li MH, Wu JS, Fan Y, et al. Econophysicists collaboration networks: Empirical studies and evolutionary model,3rd Workshop on Econophysics and Sociophysics of Markets and Networks, MAR 12-15, 2007，ECONOPHYSICS OF MARKETS AND BUSINESS NETWORKS : 173-182, 2007.( IDS Number: BGW45)
聂玉超 狄增如 樊瑛，《关于最大熵期权定价的应用分析》北京师范大学学报（自然科学版）43（6）(2007) 689-691 Nie Yuchao, Di Zengru, Fan Ying*, Application analysis of maximum entropy on option pricing, Journal of Beijing Normal University(Natural Science), Vol.43,No.6, 689-691(2007) (in Chinese).
Yanqing Hu, Hongbin Chen, Peng Zhang, Menghui Li, Zengru Di, and Ying Fan*, Comparative definition of community and corresponding identifying algorithm, Phys. Rev. E 78, 026121 (2008)
Peng Zhang, Jinliang Wang, Xiaojia Li, Menghui Li, Zengru Di, Ying Fan*, Clustering coefficient and community structure of bipartite networks, Physica A 387, (2008), 6869-6875 .
李晓佳，张鹏，狄增如，樊瑛，复杂网络中的社团结构，复杂系统与复杂性科学，第5卷，第3期，19-42，（2008）
樊瑛，索丽娜，沈晓松，胡延庆， 复杂网络视角下NYSE市场投资结构特性研究，北京师范大学学报(自然科学版),44（1）, 103-105 (2008）
Hu YQ, Li MH Zhang P, Fan Y , Di ZR, Community detection by signaling on complex networks, PHYSICAL REVIEW E Volume: 78，016115 (2008)
杨华，聂玉超，张洪斌，樊瑛*，基于复杂网络的快递网络性质分析，北京师范大学学报(自然科学版),45（1），101-103 (2009）
王进良，张鹏，狄增如，樊瑛*，《北师大图书借阅系统的网络分析》 情报学报2009 28(1): 023
陈宏斌，樊瑛，方锦清，狄增如，二元随机网，物理学报，2009 58(3)1383-1390
Hua Yang,Yuchao Nie,Hongbin Zhang,Zengru Di,Ying Fan*,Insight to the express transport network,Computional Physics Communication 180,(2009), 1511-1515
王洋，狄增如，樊瑛，二分网络的比较性定义，复杂系统与复杂性科学，第6卷，第4期，40-44，（2009）
Xiaojia Li, Yanqing Hu Menghui Li Zengru Di, Ying Fan*, Detecting Community Structure by Coherent Oscillation of Excitable Systems, Physica A，389, （2010）：Pages 164-170
Jie Cheng, Yanqing Hu, Zengru Di, Ying Fan*, Local adaptive mechanism and hierarchic social entropy in opinion formation on complex networks,, Computer Physics Communications 180,(2010), ?-?（通讯作者，SCI）
吴亚晶 张鹏 狄增如 樊瑛， 二分网络研究，复杂系统与复杂性科学，第7卷，第1期，1-12，（2010）
夏昊 王洋 狄增如 樊瑛 对北大Maze网基于复杂网络理论的实证研究 北京师范大学学报（自然科学版） 2010年，第46卷，第5期，647-650
吴亚晶 狄增如 樊瑛，基于资源分布矩阵的二分网聚类方法 北京师范大学学报（自然科学版） 2010年，第46卷，第5期，643-646
J. Zhou, A. Zeng*, Y. Fan*, and Z. Di, “Identifying important scholars via directed scientific collaboration networks,” Scientometrics, vol. 114, no. 3, pp. 1327–1343, Mar. 2018.
Wu Z, Di Z, Fan Y*. An Asymmetric Popularity-Similarity Optimization Method for Embedding Directed Networks into Hyperbolic Space. Complexity (2020) 2020(5):1–16.
Li, L , Fan Y*, Zeng A*, Di Z 2021. "Understanding the Anticontagion Process and Reopening of China during COVID-19 via Coevolution Network of Epidemic and Awareness," Complexity, vol. 2021, pages 1-11, May.
Zeng, A. , Fan, Y. , Di, Z. , Wang, Y. , & Havlin, S. . Fresh teams are associated with original and multidisciplinary research. Nature Human Behaviour.
教材及译著
复杂系统的理论基础 欧阳莹之著 田宝国、周亚、樊瑛译 上海科技教育出版社（2002）
运筹学 樊瑛编著21世纪高等教育教材 东北财经大学出版社（2006）
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