杜立林 - 北京生命科学研究所 -

个人简介

杜立林博士北京生命科学研究所资深研究员教育经历 2001年耶鲁大学分子生物物理学与生物化学系博士 Ph.D., Department of Molecular Biophysics & Biochemistry (MB&B), Yale University, USA 1995年中国科学院上海生物化学研究所硕士 M.Sc., Shanghai Institute of Biochemistry, Chinese Academy of Sciences, China 1992年南开大学生物系学士 B.Sc., Department of Biology, Nankai University, China 工作经历 2021年6月- 北京生命科学研究所资深研究员 Investigator, National Institute of Biological Sciences, Beijing, China 2013年-2021年北京生命科学研究所高级研究员 Associate Investigator, National Institute of Biological Sciences, Beijing, China 2007-2013年北京生命科学研究所研究员 Assistant Investigator, National Institute of Biological Sciences, Beijing, China 2001-2007年美国斯克利普斯研究院博士后 Postdoctoral Research Associate, The Scripps Research Institute, La Jolla, CA, USA 研究概述 Research Description 生命体是由成千上万基因所控制的复杂系统，而这些基因是被亿万年的进化所塑造过的。深入理解生命现象需要在系统层次上对基因型如何决定表型有更深刻的认识，也需要更多地了解基因组进化的机制和规律。本实验室利用裂殖酵母开展研究。作为一种单细胞真核模式生物，裂殖酵母具有实验周期短、基因组紧凑、遗传学手段强大、多数基因与人类基因同源等优势，因而既是深入解析生命过程背后机理的完美研究对象，也是系统生物学研究的高效平台。我们近期的研究重点包括： 1. 违背孟德尔定律的自私杀手基因的作用机制和分子进化的研究 2. 基因必需性省却的方式和规律的研究 3. 自噬相关蛋白的机理研究

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Li J, Wang H-T, Wang W-T, Zhang X-R, Suo F, Ren J-Y, Bi Y, Xue Y-X, Hu W, Dong M-Q, Du L-L (2019). Systematic analysis reveals the prevalence and principles of bypassable gene essentiality. Nat. Commun. 10:1002 Liu X-M, Yamasaki A, Du X-M, Coffman VC, Ohsumi Y, Nakatogawa H, Wu J-Q, Noda NN#, Du L-L# (2018). Lipidation-independent vacuolar functions of Atg8 rely on its noncanonical interaction with a vacuole membrane protein. eLife 7:e41237 (#co-corresponding authors). Hu W, Jiang Z-D, Suo F, Zheng J-X, He W-Z, Du L-L (2017). A large gene family in fission yeast encodes spore killers that subvert Mendel’s law. eLife 6:e26057. Wei Y, Diao L-X, Lu S, Wang H-T, Suo F, Dong M-Q, Du L-L (2017). SUMO-targeted DNA translocase Rrp2 protects the genome from Top2-induced DNA damage. Mol. Cell 66:581–596. Liu X-M, Sun L-L, Hu W, Ding Y-H, Dong M-Q, Du L-L (2015). ESCRTs cooperate with a selective autophagy receptor to mediate vacuolar targeting of soluble cargos. Mol. Cell 59:1035-1042. Zhang J-M, Liu X-M, Ding Y-H, Xiong L-Y, Ren J-Y, Zhou Z-X, Wang H-T, Zhang M-J, Yu Y, Dong M-Q, Du L-L (2014). Fission yeast Pxd1 promotes proper DNA Repair by activating Rad16XPF and inhibiting Dna2. PLoS Biol. 12:e1001946. Qu M, Rappas M, Wardlaw CP, Garcia V, Ren J-Y, Day M, Carr AM#, Oliver AW#, Du L-L#, and Pearl LH# (2013). Phosphorylation-dependent assembly and coordination of the DNA damage checkpoint apparatus by Rad4(TopBP1). Mol. Cell 51: 723–736 (#co-corresponding authors). Sun L-L, Li M, Suo F, Liu X-M, Shen E-Z, Yang B, Dong M-Q, He W-Z, and Du L-L (2013). Global analysis of fission yeast mating genes reveals new autophagy factors. PLoS Genet. 9: e1003715. Zhou Z-X, Zhang M-J, Peng X, Takayama Y, Xu X-Y, Huang L-Z, and Du L-L (2013). Mapping genomic hotspots of DNA damage by a single-strand-DNA-compatible and strand-specific ChIP-seq method. Genome Res. 23: 705-715. Han TX, Xu X-Y, Zhang M-J, Peng X, and Du L-L (2010). Global fitness profiling of fission yeast deletion strains by barcode sequencing. Genome Biol. 11: R60.