周济 - 南京农业大学

个人简介

周济，南京农业大学作物表型组学交叉研究中心特聘教授。主持中国国家自然基金委项目、中英牛顿农业科技、欧洲地平线2020（子项负责人）及英国国家重大研究项目（设计将来小麦，子项负责人）等多项中英科研项目。现任英国国家表型联盟（PhenomUK）核心委员（全英共9名）、英国生物科学理事会（BBSRC，相当于我国自然科学基金委）评审委员会委员，中国生物物理学会表型组学分会委员会委员。2019年以生物信息学家身份获选英国皇家生物学会会士（FRSB）。其研究涵盖了从细胞到群体的多尺度作物表型检测，最具影响的研究成果包括CropQuant分布式田间表型采集和分析系统、基于物联网的自动化作物表型数据管理分析平台CropSight、基于经济型无人机的大规模稻麦表型信息分析软件AirSurf和AirMeasurer、基于机器学习的种子萌发活力自动分析设备SeedGerm、基于背包式激光雷达的田间三维小麦表型分析系统CropQuant-3D、以及高通量细胞表型筛选系统的系列分析算法如CellArchitect，Endomembrane Quantifier和PDQuant等，为植物形态学、作物遗传育种和关键主效基因挖掘等提供大数据支撑和关键研究基础。现任Horticulture Research、The Crop Journal、Plant Phenomics等期刊学术编辑。2011年于英国东安格利亚大学获得计算机科学博士学位后，在Nature、Plant Cell、Nature Plants、New Phytologist、Plant Physiology、Horticulture Research和GigaScience等国际著名学术期刊撰写发表学术论文26篇，专著章节3个，i10-index超过21。授权中英发明专利3项，与先正达和拜耳等跨国企业开展创新合作，截止2020年底与欧美企业完成的专利转化和企业横向研发等经费超过人民币300万。2021年获拜耳作物科学全球G4-Ag资助（全球资助率低于1%）。大学开始受教育经历： 2006年10月-2011年7月，英国东安格利亚大学计算机科学专业（由英国最大保险集团Aviva-Norwich Union和东安格利亚大学国际学生奖学金共同资助），计算机科学博士（博士导师：Prof Andrew J Bangham 和Dr Pam J Mayhew）。 2003年9月-2005年7月，英国东安格利亚大学信息系统专业，信息系统硕士（硕士导师：Dr Pat Barrow）。 1995年9月-1999年7月，上海市工程技术大学计算机控制专业，工程学学士。科研经历（博士后）： 2020年1月-至今，英国立农业植物研究所（www.niab.com/about/ people/dr-ji-zhou）、剑桥作物研究中心（与剑桥大学共建，cropsciencecentre.org/staff/ji-zhou），研发部门主管、创新实验室主任。 2017年10月-至今，南京农业大学作物表型组学交叉研究中心，特聘教授、实验室主任、博导。 2016年11月，英国东安格利亚大学（University of East Anglia）计算机科学学院；副教授（计算机视觉、机器学习）、博导；2020年4月后转为荣誉教授（research-portal.uea.ac.uk/en/persons/ji-zhou）。 2014年11月-2019年11月，厄尔汉姆研究中心（Earlham Institute）与约翰英纳斯研究中心（John Innes Centre）双聘，英国生物科学理事会专属科研机构；2017年10月后结束双聘，转为厄尔汉姆研究中心与南农大中英双聘，研究员、实验室主任、博导。 2011年3月-2014年10月，英国塞恩斯伯里实验室（The Sainsbury Laboratory，TSL），生物信息博士后研究员，诺维奇科研院，资深博士后。业界经历： 2005年8月-2009年3月，英国Aviva保险集团，IT解决方案部（IT solutions）及投资部（e-Brokers），系统分析师、资深软件项目顾问。 2002年7月-2003年7月，新加坡英华美集团（上海分部），IT双语培训师、多媒体软件开发工程师。 1999年8月-2002年7月，上海市育才高级中学，ICT教师、多媒体软件工程师。

研究领域

主要从事全生育期稻麦表型组研究，通过结合计算机视觉、田间遥感和机器学习等技术手段构建多尺度作物表型采集技术和核心分析算法，领导和开发了基于人工智能算法的多组学数据融合分析平台，与多个世界级实验室合作一起探索关键农艺表型与基因组信息的关联

近期论文

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Yang W*, Doonan JH, Hawkesford MJ, Pridmore T, Zhou J*. (2021), State-of-the-Art Technology and Applications in Crop Phenomics. Frontiers in Plant Science, 12: 2226-2231. Z Yulei, S Gang, D Guohui, et al., Zhou J*. (2021), Large-scale field phenotyping using backpack LiDAR and CropQuant-3D to measure structural responses in wheat. Plant Physiology, July (online). Colmer J, O'Neill CM, Wells R, Bostrom A, Reynolds D, et al., Penfield S*, Zhou J*. (2020), SeedGerm: a cost‐effective phenotyping platform for automated seed imaging and machine‐learning based phenotypic analysis of crop seed germination. New Phytologist, 228(2): 778-793. 徐凌翔, 陈佳玮, 丁国辉, 卢伟, 丁艳锋, 朱艳, 周济*. 室内植物表型平台及性状鉴定研究进展和展望[J]. 智慧农业, 2020, 2(1): 23-42. Alkhudaydi T*, Reynolds D, Griffiths S, Zhou J*, De La Iglesia B. (2019). An exploration of deep learning based phenotypic analysis to detect spike regions in field conditions for UK bread wheat. Plant Phenomics (736876): 1-17. Bauer A, Bostrom A, Ball J, Applegate C, Laycock S, Kirwan J, Zhou J*. (2019). Combining computer vision and deep learning to enable ultra-scale aerial phenotyping and precision agriculture: a case study of lettuce production. Horticulture Research, 6(1):1-12. Reynolds D, Baret F, et al., Zhou J*, Tardieu F* (2019). What is cost-efficient phenotyping – optimizing costs for different scenarios. Plant Science. 282(May): 14-22. Reynolds D, Ball J, Bauer A, Griffiths S, Zhou J*. (2019). CropSight: a scalable open data and distributed data management system for crop phenotyping and IoT based crop management. GigaScience. 8(3):1-11. 周济*, Tardieu F, Pridmore T, 等. 植物表型组学: 发展、现状与挑战[J]. 南京农业大学学报, 2018, 41(4): 580-588. Watson A, Ghosh S, Williams M, et al (2018). Speed breeding: a powerful tool to accelerate crop research and breeding. Nature Plants, 4(1): 23-29. Zhou J*, Applegate C, et al. (2017). Leaf-GP: An Open and Automated Software Application for Measuring Growth Phenotypes for Arabidopsis and Wheat. Plant Methods, 13:117. Faulkner C#, Zhou J#, Evrard A, et al., Robatzek S. (2017). An automated quantitative image analysis approach for identifying microtubule patterns. Traffic, 11(2): 683-93. Bevan M. W., Uauy C., Wulff B. B. H., Zhou J., Krasileva K., Clark M. D. (2017). Genomic innovation for crop improvement. Nature, 543:346–354. Zhou J, Spallek, T., Faulkner, C., Robatzek, S. (2013). CalloseMeasurer: a novel software solution to measure callose deposition and callose patterns. Plant methods, 8: 49. Beck, M. #, Zhou J#, et al., Robatzek, S. (2012). Spatio-temporal cellular dynamics of Arabidopsis flagellin receptor reveal activation status-dependent endosomal sorting. Plant Cell, 24: 4205–19.

学术兼职

兼任英国国立农业植物研究所（National Institute of Agricultural Botany，NIAB）、剑桥作物研究中心（Cambridge Crop Science，与剑桥大学共建）数字科学部门主管（Head of Data Sciences）、创新实验室主任