1. CRISPR系统调控基础研究：细菌长期处于获取外源基因增强其环境适应性和激活CRISPR适应性免疫防控有害核酸入侵的两难抉择。调查细菌响应外界信号协调CRISPR适应性免疫和水平基因转移之间的关系，不仅有助于深化对细菌进化规律的认识，而且为拓展CRISPR系统应用范围和开发新一代基因编辑和调控技术提供基础。 2. 微生物药物高效智造：结合CRISPR和高通量筛选技术，实现代谢途径精准调控和关键代谢酶改造，开发高效生产的工程菌和活菌治疗新药。 3. 细菌耐药防控：细菌耐药问题日趋严重，预计2050年将导致超千万人死亡。探索利用CRISPR技术防控细菌耐药传播的新策略，为人类可持续发展提供保障。