个人简介
学习经历
1996年7月于合肥工业大学获工业电气自动化学士学位,2004年4月于合肥工业大学获控制理论与应用硕士学位,2009年6月于中国科学技术大学获模式识别与智能系统专业博士学位,2010年1月至2012年3月在美国范德比尔特大学(Vanderbilt University)生物医学信息学系从事博士后研究,职位是 Postdoc research fellow。
主持项目
国家自然科学基金面上基金,基于随机游走图和样本几何与标记信息的混合模型构造直推SVM的癌症转移复发分类,2016-2019。
国家自然科学基金面上基金,基于多组学数据融合与谱聚类随机行走模型挖掘二维致癌抑癌基因群失调网络算法研究, 2014-2017。
安徽省自然科学基金面上基金,结直肠癌复发转移分子标志物的网络化挖掘算法研究, 2014-2016。
合肥工业大学博士专项资金,蛋白质相互作用关系预测的核方法研究, 2009-2011。
参加项目
分别参加科技部863计划,科技部软科学计划与教育部基金项目。
研究领域
模式识别与人工智能, 主要包括机器学习与癌症大数据研究。
近期论文
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Shi, M. and Xu, G. Spectral clustering using Nyström approximation for the accurate identification of cancer molecular subtypes, Scientific Reports, 2017; 7, 4896.(通讯作者)
Shi, M. and He, J. ColoFinder: a prognostic 9-gene signature improves prognosis for 871 stage II and III colorectal cancer patients, Peerj, 2016; 4, e1804. (通讯作者)
Shi, M. and He, J. SNRFCB: sub-network based random forest classifier for predicting chemotherapy benefit on survival for cancer treatment, Molecular Biosystems, 2016; 12, 1214-1223. (通讯作者)
Shi M, Wu M, Pan P, Zhao R. Network-based sub-network signatures unveil the potential for acute myeloid leukemia therapy. Molecular bioSystems 2014. (通讯作者)
He J, Hu M, Shi M, Liu Y. Research on the measure method of complaint theme influence on online social network. Expert Systems with Applications 2014;41:6039-46.
Shi M, Beauchamp RD, Zhang B. A network-based gene expression signature informs prognosis and treatment for colorectal cancer patients. PloS one 2012;7:e41292.
Shi M, Zhang B. Semi-supervised learning improves gene expression-based prediction of cancer recurrence. Bioinformatics 2011;27:3017-23.
Shi M-G, Xia J-F, Li X-L, Huang D-S. Predicting protein–protein interactions from sequence using correlation coefficient and high-quality interaction dataset. Amino Acids 2010;38:891-99.
Shi M-G, Wu M, Huang D-S, Li X-L: Inferring protein interactions from sequence using support vector machine Neural Networks, 2009. IJCNN 2009. International Joint Conference on 2009:2903-07.
Shi M-G, Huang D-S, Li X-L. A protein interaction network analysis for yeast integral membrane protein. Protein and peptide letters 2008;15:692-99.
Shi M-G, Lyu MR, Lok T-M. Maximal-robustness-minimal-fragility controller: a compromise between robustness and fragility of biochemical networks Advanced Intelligent Computing Theories and Applications. With Aspects of Artificial Intelligenceed.: Springer, 2008:1012-21.
史明光, 陈无畏. 基于博弈论的 H2/H∞ 混合控制及其在汽车主动悬架中的应用. 控制理论与应用 2006;22:882-88.