赵文明 - 中国科学院大学

个人简介

招生专业 081203-计算机应用技术 081202-计算机软件与理论 071010-生物化学与分子生物学招生方向生物信息教育背景 2004-02--2006-06 北京航空航天大学硕士 1997-09--2001-07 西安工业学院学士学位 1997年9月-2001年7月西安工业大学计算机科学与技术专业学士学位 2006年2月-2008年6月北京航空航天大学计算机应用技术专业硕士学位工作简历 2011-12~现在, 北京基因组研究所, 高级工程师 2008-04~2011-11,北京基因组研究所, 生物信息工程师 2001-07~2004-06,北京华大基因有限公司, 助理工程师奖励信息（1）中国科学院关键技术人才, 院级, 2015 科研项目（ 1 ）组学大数据中心和知识库构建与服务技术, 参与, 国家级, 2015-06--2017-12 （ 2 ）多组学数据的存贮与访问平台建设, 主持, 部委级, 2014-07--2019-12 （ 3 ）分子模块辞海, 参与, 部委级, 2013-01--2018-12 （ 4 ）国际健康数据共享计划, 参与, 部委级, 2016-06--2021-06 参与会议（1）MethBank: DNA Methylation Data Bank 2017-03-25 （2）DoGSD: the dog and wolf genome SNP database 第七届全国生物信息学与系统生物学学术大会 2016-10-07 （3）BIG Data Center 第5届青年生物信息PI研讨会 2016-08-13 （4）The available resources for genomic data archive and analysis 2016-01-26 合作情况国际“万狗基因组计划”参与者项目协作单位中国科学院昆明动物所

研究领域

生物信息数据库；组学大数据；高性能计算

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（1） GSA: Genome Sequence Archive, Genomics Proteomics & Bioinformatics, 2017, 通讯作者（2） The BIG Data Center: from deposition to integration to translation, Nucleic Acids Res, 2017, 通讯作者（3） a Sorghum Genome SNP Database, Biotechnology for Biofuels, 2016, 第 2 作者（4）面向国际的生命组学大数据管理体系建设, Constructing the international database management system for omics big data, BIG Data Research, 2016, 第 1 作者（5） DoGSD: the dog and wolf genome SNP database, Nucleic Acids Res, 2015, 第 2 作者（6） Web resources for model organism studies, Genomics Proteomics Bioinformatics, 2015, 通讯作者（7） Transcriptome sequencing and characterization of Japanese scallop Patinopecten yessoensis from different shell color lines, PLoS One, 2015, 第 4 作者（8） Genomic characterization reveals insights into patulin biosynthesis and pathogenicity in Penicillium species, Mol Plant Microbe Interact, 2015, 第 7 作者（9） WBSA: web service for bisulfite sequencing data analysis, PLoS One, 2014, 通讯作者（10） Characterization and comparative profiling of ovarian microRNAs during ovine anestrus and the breeding season, BMC Genomics, 2014, 第 10 作者（11） wapRNA: a web-based application for the processing of RNA sequences, Bioinformatics, 2011, 第 1 作者（12） Population genetics in nonmodel organisms: II. natural selection in marginal habitats revealed by deep sequencing on dual platforms, PNAS, 2011, 第 3 作者（13） Population genetics in nonmodel organisms: II. natural selection in marginal habitats revealed by deep sequencing on dual platforms, Mol Biol Evol, 2011, 第 3 作者（14） BGI-RIS: an integrated information resource and comparative analysis workbench for rice genomics, Nucleic Acids Res, 2004, 第 1 作者