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个人简介

徐永东,博士,副教授,硕士生导师,2007年毕业于哈尔滨工业大学计算机应用技术专业获得博士学位,同年就职于哈尔滨工业大学(威海)计算机学院,2008年被聘为副教授,2014-2016年在美国Oklahoma大学公派留学。国家自然基金评审专家,中国计算机学会会员,目前从事微生物组学、基因组学、自然语言处理、机器学习等领域的研究,承担了两项国家自然基金项目,一项科技部重点研发计划子课题,一项国家242信息安全计划项目,一项山东省优秀中青年科学家奖励基金,参与多项国家级省部级项目。发表论文40余篇,软件著作权6项。 教育经历 2002-2007 计算机应用技术 哈尔滨工业大学 博士 2000-2002 机械电子工程 哈尔滨工业大学 硕士 1991-1995 流体传动及控制 大连铁道学院 本科 工作经历 2007-现在 副教授 哈尔滨工业大学(威海)计算机学院

研究领域

1. 生物信息学 1)微生物组学数据分析:利用深度学习等各类机器学习算法,以及大数据网络分析方法,研究微生物群落多样性分析,物种相互作用网络拓扑结构、关键节点、动态演化分析,该方向的研究进展将在生命科学领域的疾病分析,包括人体肠道菌群与肥胖症、二型糖尿病关系分析;海洋环境监测领域的深海微生物分析以及酿酒过程中的窖池菌群分析等实际工业项目中进行应用实践。本方向与美国University of Oklahoma,古井贡酒集团等有着交流与合作。 2)生物信息大数据云平台与数据分析技术: 本课题主要研究全新大规模并行计算分析的方法,对生物信息大数据Pipeline 进行系统的分析,一方面揭秘生命的奥秘,另一方面为针对我国人类健康精准医疗提供重要支持。 2. 自然语言处理 1)生物医学文献挖掘:本课题利用自然语言处理方法,以生物医学文献为对象,研究基因、疾病、药物、表型等实体以及实体关系挖掘,并构建知识图谱对上述信息进行存储和推理。本课题是与哈尔滨医科大学的合作研究项目。 2)金融领域文本挖掘:本课题通过对金融领域论坛、贴吧文本等信息的分析,对投资者的情绪指数进行有效的挖掘和量化,构建有效的金融市场预测模型。 3)基于电子病历的疾病辅助诊断:本课题通过对特定疾病的电子病历文本挖掘,构建基于深度学习的电子病历分类系统。

近期论文

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The complicated substrates enhance the microbial diversity and zinc leaching efficiency in sphalerite bioleaching system. Applied Microbiology & Biotechnology X Yunhua , X Yongdong , D Weiling , L Yili , F Fenliang, etc. 2015 期刊名称 Applied Microbiology & Biotechnology 期卷 99 (23) :10311-22 Identifying Keystone Species in the Microbial Community Based On Cross-sectional Data 通讯作者 2018 期刊名称 Current Gene Therapy 期卷 18(5):296-306

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