方向东 - 中国科学院大学

个人简介

招生专业 0710Z1-基因组学 1001Z1-精准医学 0710J3-生物信息学招生方向基因组大数据与精准医学研究细胞分化的表观遗传调控网络基因组学成果转化与应用教育背景 1996-09--1999-07 第一军医大学人体解剖学和组织胚胎学博士 1992-09--1995-07 第一军医大学免疫学硕士 1986-09--1992-07 第一军医大学临床医学本科工作经历 2009-01~现在, 中国科学院北京基因组研究所研究员，博士生导师 2000-05~2009-01,美国华盛顿大学医学院, 博士后、讲师、研究助理教授教授课程基因组学分析技术与原理基因组学中的核心技术生物医学大数据基因组学前沿基因组学奖励信息（1）《基因组学前沿》国科大生命学院优秀课程, 院级, 2013 （2）中国科学院知识创新工程“****”择优支持, , 院级, 2010 （3）上海市科学技术进步奖, 三等奖, 省级, 1999 （4）广东省科学技术进步奖, 二等奖, 省级, 1995 专利成果（ 1 ）用于检测人肝癌细胞标志物的引物和探针及其检测试剂盒, 发明, 2015, 第 1 作者, 专利号: 201310551809.9 （ 2 ） 2. 一种特异性抑制MAGEA1基因表达的小干扰RNA及其应用, 发明, 2018, 第 1 作者, 专利号: ZL201510958851.1 （ 3 ） 4. 一种特异性抑制CTGF基因表达的小干扰RNA及其应用, 发明, 2018, 第 1 作者, 专利号: ZL201510958362.6 （ 4 ） 5. 一种特异性抑制TWIST1基因表达的小干扰RNA及其应用, 发明, 2018, 第 1 作者, 专利号: ZL201510959113.9 发表著作（1）分子诊断与肿瘤个性化治疗原则, 北京: 科学出版社, 2017-01, 第 5 作者（2）转录组学与精准医学, 上海：交通大学出版社, 2017-12, 第 1 作者（3）微生物组学与精准医学, Microbiome and Precision Medicine, 上海交通大学出版社, 2017-12, 第 5 作者科研项目（ 1 ）高通量细胞分选多模式检测仪器在血液干细胞分化研究中的应用, 主持, 国家级, 2011-10--2016-09 （ 2 ）中国科学院“引进国外杰出人才”择优支持, 主持, 部委级, 2011-01--2012-12 （ 3 ）肿瘤个体化治疗方法及其相关的基因组和系统生物学研究, 主持, 部委级, 2012-05--2014-12 （ 4 ）利用高通量组学平台和系统生物学分析技术筛选肿瘤干细胞的特异性标记物和治疗靶点, 主持, 部委级, 2012-06--2015-05 （ 5 ）肿瘤的个体化RNA干扰治疗, 参与, 国家级, 2012-05--2015-04 （ 6 ）生物大数据表述索引、搜索与存储访问关键技术研发, 主持, 国家级, 2015-01--2018-12 （ 7 ）转录因子KLFs调控干细胞红系分化的分子网络机制, 主持, 国家级, 2015-01--2018-12 （ 8 ）精准医学大数据处理和利用的标准化技术体系建设, 主持, 国家级, 2016-01--2020-12 （ 9 ）染色质构象调控lncRNA在造血干细胞红系分化中的作用机制研究, 主持, 国家级, 2017-01--2020-12 （ 10 ）精准医学基础支撑数据库群, 主持, 国家级, 2016-07--2020-12

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（1） Platform-independent approach for cancer detection from gene expression profiles of peripheral blood cells., Briefings in Bioinformatics, 2019, 通讯作者（2） GliomaDB: a Web server for integrating glioma Omics data and interactive analysis., Genomics Proteomics Bioinformatics, 2019, 通讯作者（3）基因编辑技术及其在基因治疗中的应用, 遗传, 2019, 通讯作者（4） Photodynamic therapy for genital warts causes activation of local immunity, J Cutan Med Surg, 2019, 通讯作者（5） Knockdown of SSATX, an alternative splicing variant of the SAT1 gene, promotes melanoma progression., Gene, 2019, 通讯作者（6） TRIM44 is indispensable for glioma cell proliferation and cell cycle progression through AKT/p21/p27 signaling pathway., J Neurooncol, 2019, 通讯作者（7） Big data and the brain: peeking at the future, Genomics Proteomics Bioinformatics, 2019, 通讯作者（8） MOBCdb: a comprehensive database for integrating multi-omics data on breast cancer for precision medicine., Breast Cancer Res Treat, 2018, 通讯作者（9）基因编辑在镰状细胞贫血症治疗中的研究进展., 发育医学电子杂志, 2018, 通讯作者（10）组学时代下机器学习方法在临床决策支持中的应用., 遗传, 2018, 通讯作者（11） KLF1和KLF9对K562细胞红系分化的协同调控作用., 遗传, 2018, 通讯作者（12） Transcriptome analysis of monozygotic twin brothers with childhood primary myelofibrosis., Genomics Proteomics Bioinformatics, 2017, 通讯作者（13） GSA: Genome Sequence Archive., Genomics Proteomics Bioinformatics, 2017, 通讯作者（14） The mechanism and clinical significance of long noncoding RNA-mediated gene expression via nuclear architecture., Hereditas, 2017, 通讯作者（15） Research progress on liquid biopsy in oncology and its clinical applications., Hereditas, 2017, 通讯作者（16） MicroRNA 200a inhibits erythroid differentiation by targeting PDCD4 and THRB., Brit J Haematol, 2017, 通讯作者（17） Biological databases for hematology research., Genomics Proteomics Bioinformatic, 2016, 通讯作者（18） Global transcriptome analysis for identification of interactions between coding and noncoding RNAs during human erythroid differentiation., Front Med, 2016, 通讯作者（19） Transcriptome analysis reveals a ribosome constituents disorder involved in the RPL5 downregulated zebrafish model of Diamond-Blackfan anemia., BMC Med Genomics, 2016, 通讯作者（20） MAGE-A1 promotes melanoma proliferation and migration through C-JUN activation., Biochem Biophys Res Commun, 2016, 通讯作者（21） Regulation of ALAS2 by miR-218 during iron metabolism and erythroid differentiation., Int J Mol Sci, 2015, 通讯作者（22） Integrated analysis of gene expression and microRNA regulation in three leukemia-related lymphoblastic cell lines, Gene, 2015, 通讯作者（23） Knockdown of transcription factor forkhead box O3 (FOXO3) suppresses erythroid differentiation in human cells and zebrafish, Biochem Biophys Res Commun , 2015, 通讯作者（24） Insulin-like growth factor binding protein 5 (IGFBP5) functions as a tumor suppressor in human melanoma cells, Oncotarget, 2015, 通讯作者（25） Characterization of miRNomes in acute and chronic myeloid leukemia cell lines., Genomics Proteomics Bioinformatics, 2014, 通讯作者（26） Whole transcriptome RNA-seq analysis: the tumorigenesis and metastasis of melanoma, Gene, 2014, 通讯作者（27） Systematic transcriptome analysis of the zebrafish model of Diamond-Blackfan anemia induced by RPS24 deficiency, BMC Genomics , 2014, 通讯作者（28） Few de novo single nucleotide variations in exomes of human cord blood induced pluripotent stem cells. , PLoS One, 2013, 通讯作者（29） Dynamic transcriptomes of human myeloid leukemia cells., Genomics, 2013, 通讯作者（30） Comprehensive characterization of erythroid-specific enhancers in the genomic regions of human Krüppel-like factors., BMC Genomics, 2013, 通讯作者（31） Epigenetic modifications and chromosome conformations of the beta-globin locus throughout development. , Stem Cell Rev , 2013, 第 1 作者（32） Long-term cultured mesenchymal stem cells frequently develop genomic mutations but do not undergo malignant transformation. , Cell Death Dis, 2013, 通讯作者（33） Dynamic transcriptomes during human erythroid differentiation and development., Genomics, 2013, 通讯作者（34） Assessment of hematopoietic failure due to RPL11 deficiency in a zebrafish model of Diamond-Blackfan anemia by deep sequencing., BMC Genomics, 2013, 通讯作者（35） Influence of carbon monoxide on growth and apoptosis of human umbilical artery smooth muscle cells and vein endothelial cells. , Int J Biol Sci , 2012, 通讯作者（36） The higher structure of chromatin in the LCR of the beta-globin locus changes during development, J Mol Biol, 2009, 第 1 作者（37） Cooperativeness of the higher chromatin structure of the beta-globin locus revealed by the deletion mutations of HS3 of the LCR., J Mol Biol, 2007, 第 1 作者（38） Synergistic and additive properties of the beta-globin LCR revealed by 5'HS3 deletion mutations: Implication for LCR chromatin architecture., Mol Cell Biol, 2005, 第 1 作者（39） Developmentally specific role of the CCAAT box in regulation of human gamma-globin gene expression., J Biol Chem, 2004, 第 1 作者（40） Developmental specificity of recruitment of TBP to the TATA box of the human gamma-globin gene., Proc Natl Acad Sci USA, 2002, 第 1 作者（41） The interaction of the calcium- and integrin-binding protein (CIBP) with the coagulation factor VIII., Thromb Res, 2001, 第 1 作者（42）甲型血友病诊断和治疗进展., 自然杂志, 1993, 第 1 作者

学术兼职

2012-12-31-今,《发育医学电子杂志》, 主编 2011-03-31-今,《遗传》, 编委 2010-01-01-今,Genomics Proteomics Bioinformatics, 副主编