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个人简介

张坤,博士,研究员,博士生导师,动物科技系副系主任,动物遗传繁育研究所副所长。2000年9月至2004年7月就读于中国农业大学动物科技学院,获学士学位;2004年9月至2007年7月就读于中国农业大学生物学院李宁教授实验室,进行研究生阶段学习;2007年8月至2011年7月就读于美国佛罗里达大学动物科学系,获博士学位;2011年7月至2013年7月在美国麻塞诸塞大学Amherst分校从事博士后研究;2013年8月至2015年7月在美国密歇根州立大学动物科学系任助理教授;2015年8月加入浙江大学动物科学学院并入选浙江大学“百人计划”。 主要从事动物早期胚胎发育的分子机理以及基因编辑技术在动物育种上的应用等研究。2017年,率先在国内获得抗蓝耳病基因编辑猪;2018年,在国际上率先获得抗传染性胃肠炎病毒基因编辑猪。迄今,在Development、the FASEB Journal、Epigenetics、Developmental Biology、Biology of Reproduction、Reproduction等主流杂志共发表论文30余篇; 欢迎保送或报考本实验室! 实验室新闻 2020年11月,实验室获得浙江省自然科学基金重点项目(LZ21C170001)资助! 2020年9月,实验室获得国家自然科学基金面上项目(32072731)资助! 2020年6月28日,祝贺罗磊博士获得第67批博士后基金资助! 2020年3月,恭喜2017级硕士生王乐烽通过答辩,以优异成绩毕业。 2019年12月24日,实验室最新成果“The nucleolar protein NOP2 is required for nucleolar maturation and ribosome biogenesis during preimplantation development in mammals”发表于The FASEB Journal。链接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1096/fj.201902623R 2019年12月5日,在学院2019年“MY TEAM,MY TEACHER,MY TAG”文明实验室评比活动中,实验室获得一等奖(排名第一),创建主题:安全,让实验更美好! 2019年10月28日,祝贺党燕娜同学顺利通过博士生中期考核,获评优秀;祝贺赵盼盼同学荣获2019年度博士生岗位助学金资助。 2019年10月21日,祝贺胡冰洁同学荣获2019级博士研究生新生奖学金。 2019年9月13日,实验室最新成果“Essential roles of Hdac1 and 2 in lineage development and genome-wide DNA methylation during mouse preimplantation development.”被Epigenetics杂志接收。Preprint版本链接:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/662767v1 2019年8月30日,实验室论文“Aminopeptidase N-null neonatal piglets are protected from transmissible gastroenteritis virus but not porcine epidemic diarrhea virus”被Scientific Reports接收,该工作是和江苏农业科学院兽医研究所李彬研究员团队以及安徽农业大学动物科技学院张运海教授团队等合作完成。链接:https://www.nature.com/articles/s41598-019-49838-y 2019年8月26日,实验室最新成果“Sin3a regulates the developmental progression through morula-to-blastocyst transition via Hdac1”发表于The FASEB Journal。链接:https://www.fasebj.org/doi/pdf/10.1096/fj.201901213R 2019年7月,欢迎实验室第一位博士后罗磊博士加入。 2019年7月17-24日,张坤研究员与赵盼盼前往美国加州San Jose参加SSR年会并展示实验室2项研究工作。 2018年8月19日,实验室获得国家自然科学基金面上项目(31872348)资助! 2018年3月30号,张坤实验室2015级硕士研究生王涵,顺利毕业。 2017年3月28日,实验室研究论文“WDR5 in porcine preimplantation embryos:expression,regulation of epigenetic modifications and requirement for early development”被Biology of Reproduction杂志接受!联合培养博士生丁彪为共同第一作者,张坤研究员为共同通讯作者。 2017年3月22日,张坤研究员前往北京奶牛中心参观访问,并做学术交流。 2017年3月4日,张坤研究员参加了由中国畜牧兽医学会举办的首届“青年拔尖人才”学术论坛并做报告(题目:奶牛繁殖与早期胚胎发育)。 2017年1月14日,张坤研究员受邀参加首届瓯江生殖论坛并做大会报告:辅助生殖技术对基因组印记的影响,主办方:温州医科大学附属第二医院生殖中心。 2016-09-10:Welcome our new lab member-Zhao Panpan. 2016-08-21:We have been awarded a NSFC grant. 2016-5-06:Accepted publication:our paper titled'CHD1 Regulates Deposition of Histone Variant H3.3 During Bovine Early Embryonic Development'has been accepted by Biology of Reproduction on May-06-2016;Dr.Zhang is both the first author and corresponding author. 2016-1-29:Accepted publication:our review paper titled'Advances in genetic engineering of domestic animals'has been accepted by Frontiers of Agricultural Science and Engineering;One figure was also chose as the cover picture.Dr.Shaohua Wang is the first author,Dr.Zhang and Dr.Dai are corresponding authors. 实验室成员 张坤研究员、博导、副系主任、副所长 王华南讲师、博士 王少华博士 罗磊博士后(毕业于安徽农业大学) 赵盼盼2016级硕博联读生(毕业于西北农林科技大学) 党燕娜2017级博士生(毕业于西北农林科技大学) 李爽2017级硕士生(毕业于西北农林科技大学) 史延2018级直博生(毕业于西北农林科技大学) 王紫曾晨2018级硕士生(毕业于浙江大学) 胡冰洁2019级直博生(毕业于西南大学) 肖列英2019级硕士生(毕业于四川农业大学) 邱金龙2019级硕士生(毕业于山东农业大学) Kassim Yassin 2020级博士生 邹瑜2017级本科生 已毕业或已离职人员: 丁彪2015级博士(联合培养),2016.9-2017.6,现就职于安徽蚌埠医学院附属医院 王涵2015级硕士2015.9-2018.3,现就职于江苏南京外国语学校淮安分校 罗磊2016级博士(联合培养)2016.7-2019.6,浙江大学博士后 蒋润泽2015级本科生,现就职于浙江嘉兴市南湖区市场监督局 韦涛2015级本科生 刘通技术员、硕士2015.11-2019.7,安徽农业大学博士生 王乐烽2017级硕士生(毕业于浙江大学),现就职于浙江大学医学院附属妇产科医院 庄子杨2016级本科生,待业 教学与课程 本科生课程: 17195290,动物基因工程,春季(主讲) 17120940,动物科学前沿与创新创业,冬季(主讲) 研究生课程: 1713006,动物繁殖学研究进展,秋季(主讲) 1741012,动物繁殖理论与生物技术,秋季(主讲) 奖励荣誉 1 Lalor Foundation Merit Award(2012年Society for the Study of Reproduction(SSR)年会) 2 Trainee Research Award Finalist(2012年SSR年会) 3 Larry Ewing Memorial Trainee Travel Fund(LEMTTF)from SSR(2011和2012年) 4 USDA NIFA NRI Merit Award from SSR(2011年SSR年会) 5国家优秀自费留学生奖学金(2010-2011年度) 6 2008年度,参与完成的成果“体细胞克隆猪和转基因体细胞克隆猪技术平台的建立与应用”,获得神农中华农业科技奖一等奖(第十五完成人) 7佛罗里达大学校友奖学金(2007年-2011年) 博士后与学生荣誉: 1.在学院2019年“MY TEAM,MY TEACHER,MY TAG”文明实验室评比活动中,实验室获得一等奖(排名第一),创建主题:安全,让实验更美好! 2.赵盼盼2016级硕博联读生:岗位助学金 3.党燕娜2017级博士生:新生奖学金 4.王乐烽2017级硕士生:国家奖学金 5.胡冰洁2019级直博生:新生奖学金 6.罗磊博士获得第67批博士后基金资助。 出版著作 1张坤,李世杰.第九章动物克隆原理与进展.(高级动物基因工程,科学出版社,李宁主编) 工作研究项目 浙江大学“百人计划”,2015-2021 国家自然科学基金面上项目(31672416),2017-2020 中央高校基本科研业务费,2017-2018 国家自然科学基金面上项目(31872348),2019-2022

研究领域

1.动物早期胚胎发育 繁殖效率低是奶牛养殖业面临的严峻挑战之一(杨利国2009,Sartori et al.2010,Spencer 2013)。母牛每次发情后,第一次人工授精后的怀孕率约为40%,而高产奶牛的怀孕率更低(Wiltbank et al.2016)。大量数据表明早期胚胎死亡(Early embryo death)是引起奶牛不孕的主要原因之一。近年来的研究显示约37%的奶牛胚胎在受精后1周内死亡(Sartori et al.2010,Wiltbank et al.2016)。此外,胚胎工程技术的应用虽然极大地推动了奶业的发展,但是关键的繁殖技术比如体外受精(IVF)和体细胞克隆技术(SCNT)的效率仍然非常低。目前主要的观点认为,这是由于早期胚胎中染色质重编程不完全造成的(Su et al.2011,Matoba et al.2014)。我们实验室主要通过基因芯片、转录组测序和胚胎显微注射结合RNA干扰等技术,筛选了多个影响早期胚胎发育的关键基因,利用RNA干扰、基因过表达、基因编辑或化学抑制剂处理等干扰基因功能的策略,希望揭示这些基因在早期胚胎发育过程中的功能及作用机制。 2.动物基因编辑 基因编辑技术是近年来迅速发展起来的能够让人们对目标基因进行特定“编辑”的新兴技术,实现了对特定的DNA片段进行特定改造的目的。基因编辑动物在育种、人类疾病模型、异种器官移植、生物反应器等领域展现出极广泛的应用前景。

近期论文

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Lei Luo#, Yanna Dang#, Yan Shi#, Panpan Zhao, Yunhai Zhang(通讯) and Kun Zhang(通讯). SIN3A regulates porcine early embryonic development by modulating CCNB1 expression. Fron Cell Dev Bio In press Huanan Wang#, Lefeng Wang#, Zizengchen Wang#, Yanna Dang, Yan Shi, Panpan Zhao and Kun Zhang(通讯). The nucleolar protein NOP2 is required for nucleolar maturation and ribosome biogenesis during preimplantation development in mammals. The FASEB Journal. 2019. Online Panpan Zhao#, Huanan Wang#, Han Wang#, Yanna Dang, Lei Luo, Shuang Li, Yan Shi, Lefeng Wang, Shaohua Wang, Jesse Mager, and Kun Zhang(通讯). Essential roles of Hdac1 and 2 in lineage development and genome-wide DNA methylation during mouse preimplantation development. Epigenetics. Accepted. Lei Luo, Shaohua Wang, Lin Zhu, Baochao Fan, Tong Liu, Lefeng Wang, Panpan Zhao, Yanna Dang, Pei Sun, Jianwen Chen, Yunhai Zhang, Xinjian Chang, Zhengyu Yu, Huanan Wang, Rongli Guo, Bin Li (通讯), and Kun Zhang (通讯). Aminopeptidase N-null neonatal piglets are protected from transmissible gastroenteritis virus but not porcine epidemic diarrhea virus. Scientific Reports. 2019 Accepted Panpan Zhao, Shuang Li, Huanan Wang, Yanna Dang, Lefeng Wang, Tong Liu, Shaohua Wang, Xinhong Li, and Kun Zhang (通讯). Sin3a regulates the developmental progression through morula-to-blastocyst transition via Hdac1. The FASEB Journal. 2019 In Press Zhang K(通讯), Wang H, Rajput SK, Folger JK and Smith GW. Characterization of H3.3 and HIRA expression and function in bovine early embryos. Molecular Reproduction and Development. 2018 Feb; 85(2):106-116. Wallingford MC, Hiller J, Zhang K, Mager J. YY1 is required for post-transcriptional stability of SOX2 and OCT4 proteins. Cellular Reprogramming. 2017 Aug;19(4):263-269. Ding B#, Cao ZB#, Hong RY, Li H, XY Zuo, Luo L, Li YS, Huang WP, Li WY, Zhang K (通讯)and Zhang YH(通讯). WDR5 in porcine preimplantation embryos: expression, regulation of epigenetic modifications and requirement for early development. Biology of Reproduction. 2017 Apr 1;96(4):758-771. (# equal contribution) Hand JM, Zhang K, Wang L, Koganti PP, Mastrantoni K, Rajput SK, Ashry M, Smith GW, Yao JB. Discovery of a novel oocyte-specific Krüppel-associated box domain-containing zinc finger protein required for early embryogenesis in cattle. Mechanisms of Development. 2017 Apr;144(Pt B):103-112. Cui W, Dai XP, Marcho C, Han ZB, Zhang K, Tremblay K, and Mager J . Towards Functional Annotation of the Preimplantation Transcriptome: An RNAi Screen in Mammalian Embryos. Scientific Reports. 2016 Nov 21;6:37396. Zhang K(通讯), Rajput SK, Wang SH, Folger JK, Knott JG, and Smith GW. CHD1 Regulates Deposition of Histone Variant H3.3 During Bovine Early Embryonic Development. Biology of Reproduction. 2016 Oct;94(6):140 Yang QE, Ozawa Manabu, Zhang K, Johnson SE, Ealy AD. The requirement for protein kinase C delta (PRKCD) during preimplantation bovine embryo development. Reproduction, Fertility and Development, 2016 Mar;28(4):482-90. Wang SH, Zhang K(通讯), Dai YP(通讯). Advances in genetic engineering of domestic animals. Frontiers of Agricultural Science and Engineering. 2016 March; 3(1):1-10; Cover Picture Cui W, Pizzollo J, Han Z, Marcho C, Zhang K, Mager J. Nop2 is required for mammalian preimplantation development. Molecular Reproduction and Devevlopment. 2016 Feb;83(2):124-31. Zhang K, Rajput SK, Lee KB, Wang DL, Huang JC, Folger JK, Knott JG, Zhang JZ, and Smith GW. Evidence Supporting a Role for SMAD2/3 in Bovine Early Embryonic Development: Potential Implications for Embryotropic Actions of Follistatin. Biology of Reproduction. 2015 Oct;93(4):86 Zhang K(通讯)and Smith GW. Maternal control of early embryogenesis in mammals. 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Functional role of the bovine oocyte-specific protein JY-1 in meiotic maturation, cumulus expansion and subsequent embryonic development. Biology of Reproduction 2014 Mar 27;90(3):69 Zhang K, Dai X, Trask MC and Mager J. Depletion of Suds3 reveals an essential role in early lineage specification. Developmental Biology, 373(2):359-72 (2013) Cover picture Zhang K, Harversat JM, Mager J. CTR9/PAF1c regulates molecular lineage identity, histone H3K36 trimethylation and genomic imprinting during preimplantation development. Developmental Biology, 383(1):15-27 (2013). Zhang K, Ealy AD. Disruption of FGF signaling in COCs impacts oocyte maturation and developmental competence in vitro. Domestic Animal Endocrinology, 42(4):230-8 (2012) Zhang K, Ealy AD. Supplementing fibroblast growth factor 2 during bovine in vitro maturation promotes subsequent embryonic development. Open Journal of Animal Sciences, 2(2): 119-26 (2012) Zhang K, Hansen PJ, Ealy AD. Fibroblast growth factor 10 enhances bovine oocyte maturation and developmental competence in vitro. Reproduction 140: 815-826 (2010) Yang QE, Fields SD, Zhang K, Ozawa M, Johnson SE and Ealy AD. FGF2 promotes primitive endoderm development in bovine blastocysts. Biology of Reproduction 85(5):946-53 (2011) Zhang K, Ma YF, Wang SH, Lou YK, Wei HX, Sun XZ, Sun GJ, Zhao YH, Li Y, Dai YP, Zhang L, Li N. Effects of Leptin supplementation in in vitro maturation medium on meiotic maturation of oocytes and preimplantation development of parthenogenetic and cloned embryos in pigs. Animal Reproduction Science 101(1-2):85-96 (2007) Zhang K, Wei HX, Zhang YH, Wang SH, Li Y, Dai YP and Li N. Effects of Ghrelin on in vitro development of porcine in vitro fertilized and parthenogenetic embryos. Journal of Reproduction and Development 53(3):647-53 (2007) Zhang K, Zhang YH, Pan DK, Ma YF, Wei HX, Zhang J, Li XY, Wang SH, Li Y, Dai YP and Li N. Seasonal influence on the development of parthenotes and cloned embryos in pigs. Progress in Natural Sciences 17(10): 1172-1176 (2007) Wang SH, Zhang K, Ding FR, Zhao R, Li S, Li R, Xu LL, Song C, Dai YP, and Li N. A novel promoterless gene targeting vector to efficiently disrupt prnp gene in cattle. Journal of Biotechnology 163(4):377-85 (2013) Wang SH, Lv XQ, Zhang K, Lin TH, Liu XF, Yuan J, Dai YP, Li N. Knockdown of the prion gene expression by RNA interference in bovine fibroblast cells. Molecular Biology Report 37:3193–3198 (2010) Ma YF, Li Y, Wei HX, Li QY, Fang R, Zhao R, Zhang K, Xue K, Lou YK, Dai YP, Lian LS and Li N. Effects of chemical activation and season on birth efficiency of cloned pigs. Science in China C: Life Sciences 52(7):657-64 (2009) Wang SH; Sun XZ; Ding FR; Zhang K; Zhao R; Li S; Tang B; Li R; Zhang L; Liu Y; Li J; Gao FL; Wang HP; Wang LL; Dai YP, Li N. Removal of selectable marker gene from fibroblast cells in transgenic cloned cattle by transient expression of CRE recombinase and subsequent effects on recloned embryo development. Theriogenology 72(4): 535-541 (2009) Wei HX, Zhang K, Ma YF, Li Y, Li QY, Dai YP and Li N. Stage-dependent effect of Leptin on development of porcine embryos derived from parthenogenetic activation and transgenic somatic cell nuclear transfer. Journal of Reproduction and Development 55(2):99-104 (2009) Dang YN, Zhang K(通讯). Factors affecting early embryonic development in cattle: relevance for bovine cloning. Frontiers of Agricultural Science and Engineering. Accepted. 王少华,赵盼盼,刘通,丁彪,罗磊,曹祖兵,张运海,张坤(通讯). 利用CRISPR/Cas9n技术生产抗蓝耳病的基因编辑克隆猪. 浙江大学学报(农业与生命科学版).已接受 王涵,赵盼盼,张坤(通讯). 哺乳动物着床前胚胎中细胞系的分化以及调控机制. 浙江大学学报(农业与生命科学版).已接受

学术兼职

目前担任中国畜牧兽医学会动物繁殖学分会理事、Animal Reproduction Science、浙江大学学报《农业与生命科学版》编委。

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