个人简介
王起山,男,1980年生。浙江大学动物科学学院教授、博士生导师。
2008年于上海交通大学生物技术专业获博士学位,并留校工作。2011年晋升副高,2016年晋升教授,2020年初调入浙江大学。2011年在美国Cornell大学访问学习(访问学者),与Zhiwu Zhang博士和Ed Buckler教授合作开发了高效的GWAS统计算法SUPER及GWAS软件平台GAPIT。2014年在美国加州大学(Riverside)访问学习(访问学者),与Shizhong Xu教授合作开发了显著降低假阳性率的GWAS的统计算法EB,同时与美国NOBLE基金会等3方合作开发了考虑基因互作效应的全基因组预测(GP)分析平台PEPIS。
多年以来,一直从事动物遗传育种人才培养、科学研究以及社会服务工作。迄今为止,先后主持国家自然科学基金项目4项、主持国家科技支撑计划子课题、农业部联合攻关计划子课题、上海市种业发展项目、上海市科技兴农项目等科研项目多项。在《Bioinformatics》、《Plos Computational Biology》、《BMC Genomics》、《Animal Genetics》、《Journal of Animal Breeding and Genetics》等杂志发表SCI论文50余篇、授权专利和软件著作权10余项。荣获2018年度教育部科技进步二等奖,上海市科技进步二等奖。
人才培养
一、主讲课程
1.本科生:动物育种学;群体遗传学
2.硕士生:实验设计与R语言;数量遗传学
3.博士生:SAS统计分析;统计基因组学;线性模型
二、招生方向
1.统计组学与生物信息学
2.功能组学与设计育种学
三、在读学生(姓名/入学时间/类别/论文题目)
科学研究
一、基础研究
主要围绕复杂性状遗传机制解析开展探索性的研究,以生物大数据的统计方法、平台开发为重点,包括构建高效的GWAS和GS/GP方法、开发便捷易用的统计分析平台等。近期主要研究开发的方法平台主要有:⑴基于经验贝叶斯的GWAS模型(EB),该方法能显著降低噪音并提高统计效能;⑵互补且性状特异的分子亲缘系数矩阵的GWAS方法(SUPER),该方法能大大提高计算速度,使计算时间由样本量的3次方变成了线性,并且能以较小的样本量检测到常规方法难以检测的效应较小的基因位点;⑶针对动物有复杂群体结构和纵向表型测定数据等特点,开发了基于随机回归模型的单倍体型关联分析算法,为动物复杂性状候选基因的高效筛选提供了新思路和方法,也丰富了动物动态复杂性状关联分析的理论体系。
二、应用研究
以动物种质创新和遗传资源的鉴定、评估、保护、开发以及利用工作为重点,包括BLUP遗传评估和基于开发的方法、平台开展分子保种、育种工作。特别是针对江、浙、沪20个地方品种的遗传多样性和进化关系,开展了深入的生物信息学分析,包括群体有效含量、等位基因丰度、群体分化系数等,对这些品种的濒危程度、现行保种模式的有效性、品种划分的合理性等从分子水平上有了全面把握,同时检测筛选了用于品种鉴别的特异标记343个。有关技术方法对国家每年保种经费下拨决策提供了依据。
研究领域
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一是统计组学与生物信息学;二是功能组学与设计育种学。
学术兼职
兼任全国生猪遗传改良计划专家组专家、农业农村部全国地方猪品种登记专家组秘书、上海生猪产业技术体系岗位科学家、中国畜牧兽医学会动物遗传育种分会理事。