个人简介

潘玉春，山东省栖霞市人。现任浙江大学动物科学学院长聘教授、博士生导师。 1983年毕业于山东农业大学动物科学专业并获学士学位，1986年毕业于东北农业大学动物遗传育种专业并获硕士学位，同年留校任教，1991年获博士学位，1992年升副教授，1993年赴菲律宾国际养猪培训中心（ITCPH）访问学习，1996年升教授，2001年末调到上海交通大学，2006～2007年在美国North Carolina State University访问学习，2020年初调到浙江大学。 多年以来，一直从事动物遗传育种人才培养、科学研究以及社会服务工作。主讲课程包括本科生的生物统计学、家畜育种学，硕士生的数量遗传学，博士生的统计基因组学等。主要研究方向有二：一是统计组学与生物信息学；二是功能组学与设计育种学。研究领域包括整体组学（Holo-Omics）分析方法、遗传资源管理以及猪、牛遗传改良。迄今为止，先后主持、参加各类课题60余项（其中主持国家自然科学基金10项、973课题1项、863课题1项、948课题2项、畜禽良种攻关课题1项以及上海市科委、农委课题8项），发表文章170多篇（其中SCI文章70余篇)，出版专著、译著、教材8部，获发明专利8项、软件著作权18项，获上海市科技进步二等奖1项、教育部科技进步二等奖2项、农业部中华科技二等奖1项、农业部科技进步三等奖1项、农牧渔业丰收三等奖1项以及第5届遗传学应用于家畜生产世界大会（5thWCGALP）颁发的'青年科学奖（Young Scientist Scholarship）”。此外，还组建了“华东种猪遗传评估中心”，开发了“中国地方猪品种登记网络平台”，参与了遗传资源保护、猪新品种/配套系的审定以及《全国生猪遗传改良计划》启动后的各种技术培训、核心场遴选与现场指导工作。 （实验室招收硕士研究生、博士研究生及博士后，欢迎联系） 人才培养 一、主讲课程 1.本科生：生物统计学；家畜育种学 2.硕士生：数量遗传学 3.博士生：统计基因组学 二、招生方向 1.统计组学与生物信息学 2.功能组学与设计育种学 三、在读学生（姓名/入学时间/类别/论文题目） 1.吴芬，2019.9，博士，/ 科学研究 长期以来，一直从事动物遗传育种研究，尤其是在两个方向：一是统计组学与生物信息学；二是功能组学与设计育种学。研究对象主要是猪、牛等重要食源动物。 二、前期工作 1.针对动物杂交试验，提出了正反交循环部分双列杂交试验设计方法，并对各种动物杂交试验系统地构建和开发了基于最优线性无偏预测（BLUP）的分析方法、软件。 2.针对远交群体的基因组变异检测问题，开发了简化基因组测序平台GGRS1.0和与之相配套的基因型填补方法iBLUP。在此基础上，结合低深度全基因组重测序与基因型填补技术，进一步将其升级成全基因组基因型判型技术平台GGRS2.0。 3.针对复杂性状遗传机制解析相关统计方法的假阳性、假阴性率高和基因组预测的准确度低、运算速度慢等关键问题，开发了高效的关联分析与基因组预后系列模型，主要包括候选基因集关联分析方法(CGSA)、旨在提高计算速度和统计效能的GWAS方法(SUPER)、旨在降低噪音与提高统计效能的经验贝叶斯统计方法(EB)等。 4.针对地方猪种资源鉴别、评价、保护、利用问题，配合农业部与全国畜牧总站开发了“中国地方猪品种登记”网络平台；分析了江、浙、沪、鲁、皖、滇等40个品种、品系、类群的群体基因组结构与功能特异性，在一定程度上揭示了其种质特性，并挖掘了一系列功能性基因；对系统保种理论的实际应用开展了相关研究，提出了保种-选种指数，并进一步强调了管理（包括避免盲目引种、杂交等）的重要性及其具体做法；开展了基于浦东白猪、金华猪的两个配套系的培育。 5.针对引进品种猪的遗传改良，建立了“华东种猪遗传评估中心”，并对实践中的生产性能测定、经济（育种）重要性确定及生长与免疫的遗传相关机制等问题进行了深入研究。 6.针对奶牛育种问题，初步建立了“上海奶牛基因组选择体系”，包括参考群体、统计分析平台及基因型分型平台。 三、在研课题 1.国家自然科学基金面上项目“太湖流域地方地方猪种基因组保护方法研究（31772552）”，2018-2021，主持。 2.国家自然科学基金面上项目“猪基因组杂交育种方法研究（31972534）”，2020-2023，主持。 3.国家自然科学基金专项项目“非洲猪瘟疫情下我国猪种种质资源保护研究（31941007）”，2020-2022，主持。 4.农业农村部畜禽良种联合攻关项目“地方猪种种质自主创新联合攻关”，2019-2022，首席科学家 二、近期学术报告 1.Genomic conservation and application of pigs in the Taihu region of China.PAG ASIA,2015.7.15，新加坡。 2.基于基因组SNP的猪地方品种保护、选择以及利用。第一届猪业科技大会，2015.9.19，厦门。 3.太湖流域地方品种猪基因组变异及其功能研究。日本养猪学会103回会议，2015.10.9，日本岐阜。 4.在猪遗传改良中存在的几个问题。农业部第一期种猪生产性能测定培训班，2018.4.9，武汉。 5.地方猪种开发中的五大关系。沙子岭猪特色产业发展高峰论坛，2018.12.20，湘潭。 6.非洲猪瘟笼罩下的种猪繁育。农业农村部首届畜禽种业高峰论坛，2019.9.18，青岛。 7.地方猪种遗传资源保护及其创新开发。农业农村部首届畜禽种业高峰论坛，2019.9.18，青岛。 8.猪基因组保护:优先序列。第三届中国猪业科技大会，2019.9.20，青岛。 9.中国优质肉猪创新开发，沙子岭猪特色产业发展论坛，2020.1.15，湘潭。

研究领域

统计组学与生物信息学；功能组学与设计育种学

一是基于整体组学（Holo-Omics）数据的关联分析、选择方法与软件研发；二是基于整体组学数据的地方猪种遗传资源鉴别、评价、保护以及利用；三是引进猪种的常规育种与设计育种；四是奶牛的基因组选择。

近期论文

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（*通讯作者） 1.Z.Wang,Q.Chen,Y.Yang,R.Liao,J.Zhao,Z.Zhang,Z.Chen,X.Zhang,M.Xue,H.Yang,Y.Zheng,Q.Wang*and Y.Pan*,2015:Genetic diversity and population structure of six Chinese indigenous pig breeds in the Taihu Lake region revealed by sequencing data.Animal Genetics,09/2015;46(6). 2.Rongrong Liao,Zhen Wang,Qiang Chen,Yingying Tu,Zhenliang Chen,Qianshan Wang,Changsuo Yang,Xiangzhe Zhang,Yuchun Pan*,2015:An Efficient Genotyping Method in Chicken Based on Genome Reducing and Sequencing.PLoS ONE 10(8):e0137010. 3.X.X.Xie,Y.F.Ma,Q.S.Wang,Z.L.Chen,R.R.Liao and Y.C.Pan*,2015:Yeast CUP1 protects HeLa cells against copper-induced stress.Brazilian Journal of Medical and Biological Research,00(00):1-6,http://dx.doi.org/10.1590/1414-431x20153848 4.Qishan Wang,Julong Wei,Yuchun Pan and Shizhong Xu,An Efficient Empirical Bayes Method for Genome-wide Association Studies.Journal of Animal Breeding and Genentics,2015,1-11,doi:10.1111/jbg.12191. 5.R.Liao,X.Zhang,Q.Chen,Z.Wang,Q.Wang,C.Yang and Y.Pan*,2016:Genome-wide association study reveals novel variants for growth and egg traits in Dongxiang blue-shelled and White Leghorn chickens.Animal Genetics,47(5):588-596.DOI:10.1111/age.12456 6.Z.Wang,Q.Chen,R.Liao,Z.Zhang,X.Zhang,X.Liu,M.Zhu,W.Zhang,M.Xue,H.Yang,Y.Zheng,Q.Wang and Y.Pan*,2016:Genome-wide genetic variation discovery in Chinese Taihu pig breeds using next generation sequencing.Animal Genetics,DOI:10.1111/age.12465 7.Z.Zhang,Z.Wang,Y.Yang,J.Zhao,Q.Chen,R.Liao,Z.Chen,X.Zhang,M.Xue,H.Yang,Y.Zheng,Q.Wang and Y.Pan*,2015:Identification of pleiotropic genes and gene sets underlying growth and immunity traits:a case study on Meishan pigs.Animal,1-8,DOI:10.1017/S1751731115002761 8.Q.Xiao,Z.Zhang,H.Sun,Q.Wang*and Y.Pan*,2016:Pudong White pig:a unique genetic resource disclosed by sequencing data.Animal,1-8,DOI:10.1017/S1751731116002494 9.Q.Xiao,Z.Zhang,H.Sun,H.Yang,M.Xue,X.Liu,W.Zhang,Y.Zhen,M.Zhu,Q.Wang*and Y.Pan*,2017:Genetic variation and genetic structure of five Chinese indigenous pig populations in Jiangsu Province revealed by sequencing data.Animal Genetics,DOI:10.1111/age.12560 10.Zhe Zhang,Peipei Ma,Qiumeng Li,Qian Xiao,Hao Sun,Babatunde Shittu Olasege,Qishan Wang*and Yuchun Pan*,2018:Exploring the Genetic Correlation Between Growth and Immunity Based on Summary Statistics of Genome-Wide Association Studies.FRONTIERS IN GENETICS,doi:10.3389/fgene.2018.00393 11.Zhe Zhang,Qian Xiao,Qian-qian Zhang,Hao Sun,Jiu-cheng Chen,Zheng-cao Li,Ming Xue,Pei-pei Ma,Hong-jie Yang,Ning-ying Xu,Qi-shan Wang*&Yu-chun Pan*,2018:Genomic analysis reveals genes affecting distinct phenotypes among different Chinese and western pig breeds.SCIENTIFIC REPORTS,(2018)8:13352 12.H.Sun,Z.Wang,Z.Zhang,Q.Xiao,S.Mawed,Z.Xu,X.Zhang,H.Yang,M.Zhu,M.Xue,X.Liu,W.Zhang,Y.Zhen,Q.Wang*and Y.Pan*,2018:Genomic signatures reveal selection of characteristics within and between Meishan pig populations.ANIMAL GENETICS,49,119-126 13.Zhenliang Chen,Yunqiu Yao,Peipei Ma,Qishan Wang*,Yuchun Pan*,2018:Haplotype-based genome-wide association study identifies loci and candidate genes for milk yield in Holsteins.PLOS ONE,13(2):e0192695 14.Hao Sun,Babatunde Shittu Olasege,Zhong Xu,Qingbo Zhao,Peipei Ma,Qishan Wang,Shaoxiong Lu*and Yuchun Pan*,2018:Genome-Wide and Trait-Specific Markers:A Perspective in Designing Conservation Programs.FRONTIERS IN GENETICS,9:389 15.Suo-Yu Zhang,Babatunde Shittu Olasege,Deng-Ying Liu,Qi-Shang Wang,Yu-Chun Pan*,Pei-Pei Ma*,2018:The genetic connectedness calculated from genomic information and its effect on the accuracy of genomic prediction.PLOS ONE,13(7):e0201400. 16.Qing-bo Zhao,Rong-rong Liao,Hao Sun,Zhe Zhang,Qi-shan Wang,Chang-suo Yang,Xiang-zhe Zhang*and Yu-chun Pan*,2018:Identifying Genetic Differences Between Dongxiang Blue-Shelled and White Leghorn Chickens Using Sequencing Data.G3-GENES GENOMES GENETICS,8(2):469-476 17.Z.Wang,H.Sun,Q.Chen,X.Zhang,Q.Wang and Y.Pan*,2018:A genome scan for selection signatures in Taihu pig breeds using next-generation sequencing.Animal,1-9 18.Hao Sun,Zhe Zhang,Babatunde Shittu Olasege,Zhong Xu,Qingbo Zhao,Peipei Ma,Qishan Wang*,Yuchun Pan*,2018:Application of partial least squares in exploring the genome selection signatures between populations.Heredity(Edinb),1-4 19.Zhe Zhang,Qianqian Zhang,Qian Xiao,Hao Sun,Hongding Gao,Yumei Yang,Jiucheng Chen,Zhengcao Li,Ming Xue,Peipei Ma,Hongjie Yang,Ningying Xu,Qisha Wang*and Yuchun Pan*,2018:Distribution of runs of homozygosity in Chinese and Western pig breeds evaluated by reduced-representation sequencing data.ANIMAL GENETICS,49(6):579-591 20.Zhong Xu,Hao Sun,Zhe Zhang,Qingbo Zhao,Babatunde Shittu Olasege,Qiumeng Li,Yang Yue,Peipei Ma,Xiangzhe Zhang,Qishan Wang*and Yuchun Pan*,2019:Assessment of autozygosity derived from runs of homozygosity in Jinhua pigs disclosed by sequencing data.Frontiers in Genetics,10:274,28 March 2019 21.Zhong Xu,Hao Sun,Zhe Zhang,Cheng-Yue Zhang,Qing-bo Zhao,Qian Xiao,Babatunde Shittu Olasege,Pei-Pei Ma,Xiang-Zhe Zhang,Qi-Shang Wang*,and Yu-Chun Pan*,2019:Selection signature reveals genes associated with susceptibility loci affecting respiratory disease due to pleiotropic and hitchhiking effect in Chinese indigenous pigs.Asian-Australasian Journal of Animal Sciences,Vol.00,No.00:1-10 Month 2020 22.Suoyu Zhang,Jinxin Zhang,Babatunde Shittu Olasege,Peipei Ma,Xiaotian Qiu,Hong Gao,Changcun Wang,Yuan Wang,Qin Zhang,Hongjie Yang,Zhigang Wang,Xiangdong Ding*,Yuchun Pan*,2019:Estimation of genetic parameters for reproductive traits in connectedness groups of Duroc,Landrace and Yorkshire pigs in China.Journal of Animal Breeding and Genetics 2019;00:1-12. 23.Qing-bo Zhao,Hao Sun,Zhe Zhang,Zhong Xu,Babatunde Shittu Olasege,Pei-pei Ma,Xiang-zhe Zhang,Qi-shan Wang*and Yu-chun Pan*,2019:Exploring the Structure of Haplotype Blocks and Genetic Diversity in Chinese Indigenous Pig Populations for Conservation Purpose.Evolutionary Bioinformatics,15:1-8 24.B.S.Olasege,S.Zhang,Q.Zhao,D.Liu,H.Sun,Q.Wang,P.Ma*and Y.Pan*,2019:Genetic parameter estimates for body conformation traits using composite index,principal component,and factor analysis.J.Dairy Sci.https://doi.org/10.3168/jds.2018-15561 25.XU ZHONG,SUN HAO,ZHANG ZHE,ZHAO Qing-bo,Babatunde Shittu Olasege,LI Qiu-meng,YUE Yang,MA Pei-pei,ZHANG Xiang-zhe,WANG Qi-shan*,PAN Yu-chun*,2019:Genome-wide detection of selective signatures in a Jinhua pig population.Journal of Integrative Agriculture,18(0):2-10 26.Dengying Liu,Zhenliang Chen,Zhe Zhang,Hao Sun,Peipei Ma,Kai Zhu,Guanglei Liu,Qishan Wang,and Yuchun Pan*,2019:Detection of genome-wide structural variations in the Shanghai Holstein cattle population using next-generation sequencing.Asian-Australasian Journal of Animal Sciences,Vol.32,No.3:320-333 March 2019 https://doi.org/10.5713/ajas.18.0204

学术兼职

1.国家畜禽遗传资源委员会：自1996年成立国家畜禽遗传资源委员会以来，历任猪专业委员会秘书、委员、副主任委员、主任委员。2012年起又担任了大委员会的委员。参与了全国畜禽遗传资源规划、管理及新品种/配套系的审定，并担任农业农村部指定的多家国家级猪遗传资源保种场联系专家。 2.全国生猪遗传改良计划：作为“农业部全国猪育种协作组”专家，参与了《全国生猪遗传改良计划》的制定及其启动后的大量技术培训和核心场遴选工作，并具体担任农业农村部指定的多家国家级核心育种场联系专家。 3.国家畜禽良种联合攻关专家指导委员会：担任委员并兼地方猪种种质自主创新联合攻关组首席科学家。 4.中国畜牧兽医学会：担任动物遗传育种分会副理事长、信息技术分会副理事长、养猪分会副理事长。