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个人简介

邓显豹,男,博士,中国科院武汉植物园副研究员,2013年国家优秀自费留学生奖学金获得者。2008-2013年在芬兰赫尔辛基大学农林科学系获得农学博士学位。之后,继续在赫尔辛基大学做博士后研究,其中2014年2月至4月,在美国纽约州立大学布法罗分校做访问博士后。2014年8月回国到中国科学院武汉植物园工作。 在国外学习和工作期间,主要从事病毒介导的RNA沉默技术(VIGS)在非模拟植物上的开发及应用研究。主要的研究成果包括:1) 揭示了烟草脆裂病毒(TRV)在植物中进行RNA沉默的机理 (Deng et al., 2013, Molecular Plant-Microbe Interactions);2) 以非洲菊为基础,为非模拟植物开发了基于TRV的RNA沉默技术,用于快速便捷的研究植物的基因功能 (Deng et al., 2012, Plant Biotechnology Journal);3) 研究了植物中参与花青素合成的查尔酮合成酶 (CHS) 基因家族的功能分化。发现GCHS4在非洲菊花瓣中存在典型的转录后调节现象,并对可能的调节环节进行了推测验证 (Deng et al., 2014, New Phytologist);4) 对植物界中Type III PKS基因家族的形成及功能演化做了深刻详细的研究 (Deng et al., in preparation). 2014.08-现在 中国科学院武汉植物园,副研究员 2013.12-2014.07 芬兰赫尔辛基大学,博士后 2014.02-2014.04 美国纽约州立大学布法罗分校,访问博士后 2008.01-2013.11 芬兰赫尔辛基大学植物育种学,博士 2004.09-2007.12 芬兰赫尔辛基大学园艺系,硕士 1995.09-1999.07 中国农业大学园艺系,本科 获奖及荣誉: 2013年国家优秀自费留学生奖学金 承担科研项目情况: 1. 国家自然科学基金外国青年学者研究基金,“莲基因发掘与功能分析”,20万,已结题,重要参与人员。 2. 中国科学院知识创新工程项目,“莲生物学与遗传育种”,26万,在研,主持。

研究领域

莲生物碱合成和调控的分子机制研究。 莲是我国栽培面积最大、最重要的水生经济作物,其周身器官,特别是叶片和莲心,富含具有重要医疗保健价值的苄基异喹啉类生物碱。荷叶碱和莲心碱分别是荷叶和莲心中生物碱的主要成分,其分子结构、药理活性、分离工艺已有深入研究,但其生物合成和调控途径至今尚不明确。本研究拟在我们最近绘制的‘中国古代莲’基因组序列框架图的基础上,发掘参与莲荷叶碱合成的结构基因,并通过基因表达、酶活检测、VIGS基因沉默等研究,分析候选基因的功能,构建莲荷叶碱的生物合成途径。同时,通过比较高、低荷叶碱含量莲品种的叶片转录组差异,结合前期开展的莲荷叶碱含量QTL定位研究结果,鉴定控制莲叶片荷叶碱合成的调控基因,揭示莲荷叶碱合成与积累的分子机理。

近期论文

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1. Pietiäinen M, Kontturi J, Paasela T, Deng X, Ainasoja M, Nyberg P, Hotti H and Teeri TH. 2016. Two polyketide synthases are responsible for 4-hydroxy-5-methylcoumarin biosynthesis in Gerbera hybrida. Plant Journal, accepted. 2. Ogutu C, Fang T, Yan L, Wang L, Huang L, Wang X, Ma B, Deng X, Owiti A, Nyende A, Han Y. 2016. Characterization and utilization of microsatellites in the Coffea canephora genome to assess genetic association between wild species in Kenya and cultivated coffee. Tree Gnetics & Genomes, 12:54. 3. Vimolmangkang S, Deng X, Owiti A, Ogutu C, Meelaph T, and Han Y. (2016) Evolutionary origin of the NCSI gene subfamily encoding norcoclaurine synthase is associated with the biosynthesis of benzylisoquinoline alkaloids in plants. Scientific Reports, 6: 26323. 4. Deng X, Zhu L, Fang T, Gu C, Sornkanok V, Yang D, Ogutu C, Liu Y, Han Y. (2016) Analysis of isoquinoline alkaloid composition and wound-induced variation in Nelumbo using HPLC-MS/MS. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 64, 1130-1136. 5. Gu C, Liao L, Zhou H, Wang L, Deng X, and Han Y. (2015) Constitutive Activation of an Anthocyanin Regulatory Gene PcMYB10.6 Is Regulated to Red Coloration in Purple-Foliage Plum. PLOS ONE, 0135159. 6. Deng X, Bashandy H, Ainasoja M, Kontturi J, Pietiäinen M, Laitinen RAE, Albert VA, Valkonen JPT, Elomaa P, Teeri TH. 2014. Functional diversification of duplicated chalcone synthase genes in anthocyanin biosynthesis of Gerbera hybrida. New phytologist, 201: 1469-1483. 7. Deng X, Kelloniemi J, Haikonen T, Vuorinen AL, Elomaa P, Teeri TH, Valkonen JPT. 2013. Modification of Tobacco rattle virus RNA1 to serve as a VIGS vector reveals that the 29K movement protein is an RNA silencing suppressor of the virus. Molecular Plant-Microbe Interactions 26: 503–514. 8. Deng X, Elomaa P, Nguyen CX, Hytönen T, Valkonen JPT, Teeri TH. 2012. Virus-induced gene silencing for Asteraceae--a reverse genetics approach for functional genomics in Gerbera hybrida. Plant Biotechnology Journal 10: 970–978. 9. Xia Y, Deng X*, Zhou P, Shima K, Teixeira da Silva, JA. 2006. The World floriculture industry: dynamics of production and markets. Floriculture, Ornamental and Plant Biotechnology: Advances and Topical Issues (1st edition), chapter 4, pp 336-347. Edited by J.A. Teixeira da Silva. Global Science Books, London, UK.(Corresponding Author) 10. Zhou P, Luukkanen O, Tokola T, Deng X, and Li JY. (2006). ­­Eucalypts ─ eucalypts pulp and paper industry in China-sustainable management. The Eucalyptus in a New Century, vol 2, pp32-41. Edited by Y.J. Xie. China Forestry Press, Beijing, China.

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