个人简介

主要学习、工作、出国经历 2006-09 – 2010-11: 香港大学生物化学系-博士后，香港 1994-09 – 1998-07: 西北大学生物学系-学士，西安 1999-09 – 2006-07: 中科院上海生命科学研究院上海生物化学与细胞生物学研究所-硕博连，上海 2010-12 – 2012-09: 思路迪生物医药（上海）有限公司-科学顾问，上海 2012-10 – 2015-12: 思路迪生物医药（上海）有限公司-基因组学事业部负责人，上海 2016-01 – 现在: 北京哲源科技有限责任公司-联合创始人，联席CEO，深圳 2019-07 – 现在: 中科院计算技术研究所西部高等计算研究院-副研究员，重庆

研究领域

癌症与衰老的系统生物学，癌症的遗传决定，肿瘤细胞微进化，肿瘤与免疫系统之间的关系。

代 表 性 成 果 简 介 1. 搭建生物医学领域的自动化知识图谱，例如识别特异性实体、表型相关基因、信号通路、构建以基因为核心的三元关系、为深入开发新方法搭建标准化人机接口。2. 建立伴随诊断的方法：找到化学药、靶向药（有靶点无标志物）和免疫药的明确目标人群。3. 找到特定类型肿瘤的规律（病因以及进化方向），发现新的药物靶点（一致性进化方向、特定信号通路），助力新药研发。4. 开发了一种新的计算策略，用于识别和评估由调节DNA序列组织的各种转录因子中不同合作者的量化功能。5. 建立了多种用于癌症精准医学的NGS分析流程，如WGS，WES和Gene panel（370+基因），提供遗传变异信息，如种系/体细胞突变谱，CNV和融合基因。6. 完成了iTransition算法，模拟当某个基因的表达被操纵时细胞状态如何相互转换。7. 建立了一种新的快速方法，理解ChIP-seq数据、或从较长的基因组区域（500kb）中精确发现新的调控元件的序列模式。 应用、鉴定成果、专利（专利号）类型、等级本人排名公开时间患病风险预测方法、电子设备及存储介质发明专利1/52020-06-21获得细胞内确定性事件的方法、电子设备及存储介质发明专利1/52020-06-21一种知识驱动的自动化文献统计挖掘方法发明专利1/52021-01-09

近期论文

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发表论文名称发表刊物本人排名是否通讯发表时间TWIRLS, a knowledge‐mining technology, suggests a possible mechanism for the pathological changes in the human host after coronavirus infecDrug Development Research13/13是(2020-07)A breast one-patient panel of heterogeneous genomes reveals genetic alterations driving DCIS into invasive lesionsFuture Oncology8/8是(2019-05)Super-resolution imaging of a 2.5 kb non-repetitive DNA in situ in the nuclear genome using molecular beacon probeseLife4/11否(2017-05)Cell Culture System for Analysis of Genetic Heterogeneity Within Hepatocellular Carcinomas and Response to Pharmacologic AgentsGastroenterology8/22否(2017-01)STAT 1 facilitates oestrogen receptor α transcription and stimulates breast cancer cell proliferationJournal of cellular and molecular medicine7/14否(2018-10)RNF 168 facilitates oestrogen receptor ɑ transcription and drives breast cancer proliferationJournal of Cellular and Molecular Medicine12/17否(2018-07)SMURF1 facilitates estrogen receptor ɑ signaling in breast cancer cellsJournal of Experimental & Clinical Cancer Re15/18是(2018-02)SHARPIN Facilitates p53 Degradation in Breast Cancer CellsNeoplasia9/13否(2016-12)