倪挺 - 复旦大学 - 生命科学学院

个人简介

男，1977年出生，博士，研究员，博士生导师。2000年获北京大学生命科学学院生物化学及分子生物学系学士学位，2000-2006年硕博连读于北京大学生命科学学院并于2007年获植物学博士学位。2007-2010年在美国杜克大学基因组科学与政策研究所从事博士后研究。2010-2012年在美国国立卫生研究院(NIH)担任助理研究员(Research Fellow)。2012年受聘为复旦大学生命科学学院研究员。在Science、Nature、Nature Methods、Genome Research、Nucleic Acids Research、Aging Cell等杂志发表研究论文近50篇。目前以细胞衰老及癌变为研究体系，结合高通量测序、分子生物学、细胞生物学和生物信息学等手段研究复杂而多样化的转录组调控，特别是内含子保留和选择性多聚腺苷酸化这两种RNA加工成熟过程调控手段的功能、机制及生物学意义。先后主持国家科技部973计划课题和重点研发计划课题各1项、国家基金委重大研究计划培育项目1项及面上项目3项。教育经历 2007-2010年在美国杜克大学从事博士后研究 2000-2006年硕博连读于北京大学生命科学学院 2000年获北京大学生命科学学院学士学位工作经历 2010-2012年在美国国立卫生研究院(NIH)担任助理研究员 2012年起受聘为复旦大学生命科学学院教授 2022年起受聘为内蒙古大学生命科学学院及（2023年）生物医学研究院教授、副院长、博士生导师

研究领域

细胞衰老及癌变的转录组调控

近期论文

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Zhao Z#, Chen Y#, Cheng X, Huang L, Wen H, Xu Q, Zhou X, Zhang X, Chen J*, Ni T*. The landscape of cryptic antisense transcription in human cancers reveals an oncogenic noncoding RNA in lung cancer. Sci Adv. 2023 Apr 5;9(14):eadf3264. Zhao Z#, Xu Q#, Wei R, Huang L, Wang W, Wei G*, Ni T*. Comprehensive characterization of somatic variants associated with intronic polyadenylation in human cancers. Nucleic Acids Res. 2021 Oct 11;49(18):10369-10381. Zhao Z#, Xu Q, Wei R, Wang W, Ding D, Yang Y, Yao J, Zhang L, Hu YQ, Wei G*, Ni T*. Cancer-associated dynamics and potential regulators of intronic polyadenylation revealed by IPAFinder using standard RNA-seq data. Genome Res. 2021 Nov;31(11):2095-2106. Chen M#, Wei R#, Wei G, Xu M, Su Z*, Zhao C*, Ni T*. Systematic evaluation of the effect of polyadenylation signal variants on the expression of disease-associated genes. Genome Res. 2021 May;31(5):890-899. Wang W#, Tan H, Sun M, Han Y, Chen W, Qiu S, Zheng K*, Wei G*, Ni T*. Independent component analysis based gene co-expression network inference (ICAnet) to decipher functional modules for better single-cell clustering and batch integration. Nucleic Acids Res. 2021 May 21;49(9):e54. Yao J#, Ding D#, Li X, Shen T, Fu H, Zhong H, Wei G*, Ni T*. Prevalent intron retention fine-tunes gene expression and contributes to cellular senescence. Aging Cell. 2020 Dec;19(12):e13276. Chen M#, Lyu G#, Han M#, Nie H#, Shen T, Chen W, Niu Y, Song Y, Li X, Li H, Chen X, Wang Z, Xia Z, Li W, Tian XL, Ding C, Gu J, Zheng Y, Liu X, Hu J, Wei G*, Tao W*, Ni T*. 3' UTR lengthening as a novel mechanism in regulating cellular senescence. Genome Res. 2018 Feb 12;28(3):285-294. Shen T#, Li H, Song Y, Yao J, Han M, Yu M, Wei G*, Ni T*. Antisense transcription regulates the expression of sense gene via alternative polyadenylation. Protein Cell. 2018 Jun;9(6):540-552.