个人简介

学习、工作经历 2002年9月-2006年6月，山东农业大学，生命科学学院生物技术专业，获学士学位 2006年9月-2011年6月，中国农业大学，生物学院生物信息学专业，获博士学位 2011年7月至今，北京林业大学，生物科学与技术学院计算生物学与生物信息学学科，讲师

研究领域

1、组学数据整合和信息挖掘 2、蛋白质生物信息学

承担项目 1、胡杨应答盐胁迫转录组测序分析及基因表达调控网络的构建 国家自然科学基金青年项目 主持 2、毛白杨基因表达与生长动态的表型可塑性模型 高等学校博士学科点专项科研基金 主持 3、胡杨天然群体的遗传结构分析 北京林业大学科研启动基金 主持 4、整合基因网络的高效林木育种技术研究与示范 林业公益性行业科研专项重大项目 参与 5、森林植物发育生物学研究团队 北京林业大学科技创新计划项目 参与

近期论文

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发表文章情况 1、Jingna Si, Xiyang Zhao, Xinyin Zhao, Rongling Wu, Systematic functional genomics resource and annotation for Poplar, IET Systems Biology. 2015, Vol. 9, Iss. 4, pp. 164-171. 2、Jingna Si *, Rui Zhao and Rongling Wu, An Overview of the Prediction of Protein DNA-Binding Sites, International Journal of Molecular Sciences. 2015, 16, 5194-5215. 3、Jingna Si, Jin Chen, Rongling Wu, PFGD: A systematic functional genomics resource for Poplar. 2014 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine, p18-22. 4、JingNa Si, Tao Zhou, Wenhao Bo, Fang Xu and Rongling Wu, Genome-wide analysis of salt-responsive and novel microRNAs in Populus euphratica by deep sequencing, BMC Genetics. 2014, 15(Suppl 1): S6. 5、 JingNa Si, Zengming Zhang, Biaoyang Lin, Michael Schroeder and Bingding Huang, MetaDBSite: a meta approach to improve protein DNA-binding site prediction, BMC Systems Biology. 2010, 5(Suppl 1):S7. 6、 Jing-Na Si, Ren-Xiang Yan, Chuan Wang, Ziding Zhang and Xiao-Dong Su, TIM-Finder: A novel method to recognize TIM-barrel proteins. BMC Structural Biology. 2009, 9:73. 7、Ren-Xiang Yan, Jing-Na Si, Chuan Wang and Ziding Zhang, DescFold: A web server for protein fold recognition. BMC Bioinformatics. 2009, 10:416. 8、Chunfa Tong, Bo Zhang, Zhong Wang, Meng Xu, Xiaoming Pang, Jing-Na Si, MinRen Huang, Rongling Wu, Multiallelic epistatic model for an out-bred cross and mapping algorithm of interactive quantitative trait loci. BMC Plant Biology. 2011, 11:148. 9、Chuan Wang, Ren-Xiang Yan, Xiao-Feng Wang, Jing-Na Si, Ziding Zhang, Comparison of linear gap penalties and profile-based variable gap penalties in profile-profile alignments. Comput Biol Chem. 2011, 35(5):308-18.