朱维良 - 中国科学院上海药物研究所 -

个人简介

朱维良，现任中国科学院上海药物研究所研究员，博士生导师，课题组长。主要研究内容为计算机辅助药物设计、计算生物学及药物化学等，特别注重药物设计及计算生物学的方法发展和软件开发，并将计算模拟结果应用于活性化合物的发现及药物先导化合物的优化工作中，实现理论与实验研究互相促进，目的是提高药物设计的理论研究水平和药物分子设计与结构优化的效率。针对糖尿病、肿瘤及传染性疾病等重要疾病靶标蛋白开展药物设计及结构优化研究，发现了一系列活性化合物；针对具有显著药效的中草药活性成分，综合应用计算模拟结合药物化学及药理学技术开展创新药物研究；应用高通量计算模拟方法开展老药新用途研究。分别主持了十二？五国家重大新药创造专项子课题、十一？五及十二？五国家863课题、十？五国家科技攻关项目、国家自然科学基金、上海市科委基础重大等一系列科研课题。并先后与比利时UCB、辉瑞等国内外医药企业开展合作研究，课题组目前承担的国家及国内外合作科研项目10余项。共发表SCI研究论文120余篇，申请国家发明专利20多项，应邀在国内外学术大会上做报告30余次。教育经历 1995.9 – 1998.5 中国科学院上海药物研究所博士研究生 1986.9 - 1988.6 苏州大学化学系物理化学专业研究生 1979.9 - 1983.6 扬州师范学院化学系工作经历 2004.7 - 至今中国科学院上海药物研究所 1998.5 - 2004.7 新加坡理工学院 1988.7 - 1995.8 扬州大学农学院 1983.8 - 1986.8 扬州大学农学院

研究领域

1. 药物设计理论和方法研究 2. 生物大分子的结构与功能模拟及方法发展 3. 药物分子设计与先导化合物结构优化（药物设计概念验证研究）课题组特别注重药物设计及计算生物学的方法发展和软件开发，并将计算模拟结果应用于活性化合物的发现及优化工作中，具有理论模拟与实验验证相结合的特色。研究策略是在充分模拟靶标功能机制的基础上，深入研究靶标？配体之间的复杂相互作用，并开展概念验证，实现理论与实验研究互相促进，从而提高药物设计的理论研究水平和药物设计与结构优化效率。

近期论文

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Thermodynamics calculation of protein–ligand interactions by QM/MM polarizable charge parameters., Journal of biomolecular Structure & Dynamics, 2015, 通讯作者 Effects of drug-resistant mutations on the dynamic properties of HIV-1 protease and inhibition by Amprenavir and Darunavir., Scientific Reports, 2015, 通讯作者 A Comparative Study of Trypsin Specificity based on QM/MM Molecular Dynamics Simulation and QM/MM GBSA Calculation., Journal of biomolecular Structure & Dynamics, 2015, 通讯作者 Probing Origin of Binding Difference of inhibitors to MDM2 and MDMX by Polarizable Molecular Dynamics Simulation and QM/MM-GBSA Calculation, Scientific Reports, 2015, 通讯作者 Force fields and scoring functions for carbohydrate simulation, Carbohydrate Research, 2015, 通讯作者 Separation and peroxisome proliferator-activated receptor-c agonist activity evaluation of synthetic racemic bavachinin enantiomers., Bioorg. Med. Chem. Lett., 2015, 通讯作者 A quantum mechanics-based halogen bonding scoring function for protein-ligand interactions., Journal of molecular modeling, 2015, 通讯作者 Increasing the sampling efficiency of protein conformational transition using velocity-scaling optimized hybrid explicit/implicit solvent REMD simulation, J. Chem. Phys, 2015, 通讯作者 Like-Charge Guanidinium Pairing between Ligand and Receptor: An Unusual Interaction for Drug Discovery and Design?, J. Phys. Chem. B, 2015, 通讯作者 Pd-catalyzed a-selective C(sp3)–H acetoxylation of amides through an unusual cyclopalladation mechanism, ChemComm, 2015, 通讯作者 Redox-Neutral Rhodium-Catalyzed C[BOND]H Functionalization of Arylamine N-Oxides with Diazo Compounds: Primary C(sp3)[BOND] H/C(sp2)[BOND]H Activation and Oxygen-Atom Transfer, Angew. Chem. Int. Ed., 2015, 通讯作者 Binding Modes of Three Inhibitors 8CA, F8A and I4A to A-FABP Studied Based on Molecular Dynamics Simulation., Plos one, 2014, 通讯作者 Exploring Transition Pathway and Free-Energy Profile of Large-Scale Protein Conformational Change by Combining Normal Mode Analysis and Umbrella Sampling Molecular Dynamics, J. Phys. Chem B, 2014, 通讯作者 Novel fatty acid binding protein 4 (FABP4) inhibitors: Virtual screening, synthesis and crystal structure determination., European Journal of Medicinal Chemistry, 2014, 通讯作者 Discovery of N-substituted 3-arylisoquinolone derivatives as antitumor agents originating from O-substituted 3-arylisoquinolines via [2,3] or [3,3] rearrangement, European Journal of Medicinal Chemistry, 2014, 通讯作者 Halogen Bond: Its Role beyond Drug–Target Binding Affinity for Drug Discovery and Development, J. Chem. Inf. Model, 2014, 通讯作者 Two new sulfated sesquiterpenoids from Petasites tricholobus., Acta Pharmaceutica Sinica, 2014, 通讯作者 Multi-algorithm and multi-model based drug target prediction and web server, Acta Pharmacologica Sinica, 2014, 通讯作者 The conserved Lys-95 charged residue cluster is critical for the homodimerization and enzyme activity of human ribonucleotide reductase small subunit M2, J. Biol. Chem, 2014, 通讯作者 Mapping Central α-Helix Linker Mediated Conformational Transition Pathway of Calmodulin via Simple Computational Approach., J. Phys. Chem. B, 2014, 通讯作者