王炳波 - 西安电子科技大学 - 计算机科学与技术学院

个人简介

个人简介教育背景： 2009.09-2014.04西安电子科技大学计算机应用技术博士学位 2002.09-2005.07厦门大学计算机应用技术硕士学位 1997.09-2001.07长安大学计算机科学与技术学士学位工作经历： 2016.06-西安电子科技大学计算机学院副教授 2005.07-2014.06西安理工大学计算机科学与工程学院讲师关注问题一：复杂网络控制控制相关的计算方法可以通过分析复杂系统下蕴含的网络的结构特征来解释许多复杂系统的动态行为过程，获取系统级别的干预策略，已经成功的应用于生化反应网络、调控网络的分析。我们将结合计算方法、控制理论以及网络科学来开发复杂系统动态行为分析的工具。关注问题二：网络医学人类疾病的基于网络的方法—网络医学时代已经开始。我们将人类复杂疾病理解为生物网络结构的紊乱，结合网络科学和系统生物学来研究疾病的致病机理，探索基于网络靶标的全新治疗策略。本科教学数据仓库与数据挖掘科学研究在高琳教授主持的“计算生物信息学研究所”工作，先后参与了国家自然科学基金重点和重大培育项目。主要开展了生物分子网络的模块挖掘、复杂网络可控性分析和致病基因预测算法的研究，完成了生物分子网络数据的全局比对和有向网络控制显著性分析以及有向网络鲁棒性分析等工作。第一作者发表SCI论文4篇，其中JCR二区2篇，三区2篇，已投稿1篇。研究成果发表在：《ScientificReports》、《EurophysicsLetters》、《J.Stat.Mech.》、《ProteomeScience》、《BMCSystemBiology》等期刊上。支撑项目国家自然科学基金青年基金项目：有向生物网络中可控性相关子图模式发现算法研究，No.61303122，2014.1-2016.12主持人中央高校基本科研业务费资助项目：生物分子网络中有向子图模式挖掘算法研究，No.XJS14027，2014.9-2016.9主持人国家自然科学基金重点项目：生物网络数据分析与挖掘中相关理论与关键技术，No.60933009，2010.1-2013.12主要完成人国家自然科学基金重大研究计划项目：复杂疾病恶化过程相关模式发现理论与方法研究，No.91130006，2012.1-2014.12主要完成人国家自然科学基金青年基金项目：长非编码RNA功能预测网络模型与算法研究，No.61303118，2014.1-2016.12主要参与人学术活动 [1]第九届国际生物信息学研讨会(IBW2011)，七月11-13，2011，西安 [2]第六届IEEE计算系统生物学国际会议(ISB2012)，八月18-20，2012，西安 [3]全国生物信息学联合会议,五月26-27，2012，西安 [4]第十七届AnnualInternationalConferenceonResearchinComputationalMolecularBiology(RECOMB2013)，四月7-10，2013，北京 [5]第十届中国网络科学论坛，四月9-12，2014，北京 [6]第十届全国复杂网络大会(CCCN2014)，十月17-19，2014，长沙成果一：网络节点显著性分析拓扑结构中心性是复杂网络分析的核心内容之一。在考虑节点之间的方向性特异的连接与系统的动态控制功能行使的关系时，衡量一个节点从结构控制的角度来干预网络的能力大小就是非常具有实际应用价值的。本文基于能控子空间和能观子空间，给出了节点的控制范围中心性以及支配能力中心性度量指标。发现网络中节点的控制范围以及支配能力的分布是由节点的度分布来决定的；度大的节点也并不一定就是干预网络动态过程时应该优先选择的驱动节点。这为干预网络提供了策略上的指导和帮助。成果二：功能子图挖掘目前有向网络数据的聚类分析仍十分具有挑战性。从节点在控制、支配有向网络的能力出发，定义控制范围相似性以及支配能力相似性度量指标，来分析有向网络里节点在动态控制功能行使时行为的相似程度。在真实数据上的实验中，利用该指标在术语网络以及代谢网络中都检测出了具有显著功能特征的子图结构。成果三：网络结构鲁棒性优化如何在蓄意攻击下提高网络控制功能的鲁棒性，对于优化有向网络的拓扑结构就具有重要意义。提出了一个控制鲁棒性结构度量指标。更进一步，通过分析拓扑结构属性与动态控制过程的关系，将优化网络的控制鲁棒性问题转化为提高控制路径的传递性问题。从而，给出了一个高效的复杂网络拓扑结构优化算法，能有效地保护复杂系统中的控制路径，减缓蓄意攻击对其的破坏速度。成果四：全局网络比对方法比对不同物种的蛋白质网络，发现保守的相互作用关系，对于识别进化上的保守路径和蛋白质复合体具有重要意义。采用网络中拓扑结构上的中心节点构建种子节点对，分别从每个种子节点对开始，用成员相似性指标来度量邻居节点与当前种子组成功能模块的可能性，这样以模块为单位来展开比对过程，保证了功能模块的完整性尽量不被启发式的搜索过程所破坏，有效地解决了大多传统全局网络比对算法存在的，初始种子选择在很大程度上影响比对结果的问题。

研究领域

1．复杂网络数据分析 2．数据挖掘 3．计算生物信息学

近期论文

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[1]BingboWang,LinGao,YongGao,YueDeng,YuWang.Controllabilityandobservabilityanalysisforvertexdominationcentralityindirectednetworks.ScientificReports,4:5399,2014.【SCIIF=5.078】 [2]BingboWang,LinGao,YongGao.Maintainthestructuralcontrollabilityundermaliciousattacksondirectednetworks.EurophysicsLetters,101,58003,2013.【SCIIF=2.171】 [3]BingboWang,LinGao,YongGao.Controlrange:acontrollability-basedindexfornodesignificanceindirectednetworks.JournalofStatisticalMechanics:TheoryandExperiment,04,ppP04011,2012.【SCIIF=1.727】 [4]BingboWang,LinGao.Seedselectionstrategyinglobalnetworkalignmentwithoutdestroyingtheentirestructuresoffunctionalmodules.ProteomeScience,10(Suppl1),ppS16,2012.【SCIIF=2.49】 [5]BingboWangandLinGao.GlobalNetworkAlignmentBasedonMultipleHubSeeds.IEEEInternationalConferenceonBioinformaticsandBiomedicine(IEEEBIBM2011)Nov.12-15,pp234,Atlanta,2011. [6]YueDeng,LinGaoandBingboWang.ppiPre:Predictingprotein–proteininteractionsbycombiningheterogeneousfeatures.BMCSystemBiology,7(Suppl2):S8,2013.【SCIIF=3.148】 [7]XiaofeiYang,BingboWang.ANetworkBasedMethodforAnalysisoflncRNA-DiseaseAssociationsandPredictionoflncRNAsImplicatedinDiseases.PlosOne,9(1),e87797,2014.【SCIIF=3.534】

学术兼职

中国计算机学会会员中国细胞生物学会会员《IETControlTheory&Applications》、《PhysicaA》杂志审稿人