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个人简介

个人简介 高琳,女,博士,二级教授,博士生导师,省级重点学科学术带头人。 西安交通大学计算数学专业学士、西北大学计算数学专业硕士、西安电子科技大学雷达信号处理国家重点实验室电路与系统专业博士学位。2004-2005年受CSC资助赴加拿大UniversityofGuelph做访问学者;2015年5月访问UniversityofMichign大学,2016年3-4月作为高级研究学者,受CSC“博士生导师短期出国交流项目”资助,访问UniversityofPennsylvania,在此期间,访问了哈佛医学院。 在科研方面,先后主持2项国家自然科学基金重点项目,作为参与单位主持自然基金重点项目一项,重大研究计划培育项目一项及延续资助项目,两项国家自然科学基金面上项目,教育部博士点学科基金,国家留学回国人员基金及多项省部级项目。在教学方面,曾荣获校“永新”、“贝尔”、“华为”、等奖教金、“陕西省师德标兵”称号、西安电子科技大学“十佳师德标兵”称号。 近年来,一直从事计算机、数学与生物学科的交叉研究工作,主要研究方向包括数据挖掘与机器学习,计算生物信息学,图论与组合优化算法及应用等。在国内外核心期刊和国际会议发表学术论文100余篇。 2011年,发起创办了西部地区第一个"计算生物信息学研究所"。依托西电信息学科优势,“计算机科学与技术”一级学科博士学位授权点和博士后流动站的支撑,用信息和系统的观点研究面向生物数据分析、挖掘和模式发现的基础理论和关键技术,开发生物数据分析软件平台,培养学科交叉型研究人才。 二、国内外合作与交流 1、国内合作与交流 项目合作与博士生合作培养:哈尔滨工业大学,山东大学,中科院数学与系统科学研究院,中科院计算技术研究所,中科院生物物理所,中科院上海生科院 2、国际合作与交流 博士生合作培养,项目合作,访问学者合作交流:UniversityofPennsylvania,HarvardUniversity医学院,UniversityofMichign,UniversityofBritishColumbia,香港浸会大学,UniversityofGuelph,UniversityofIowa 三、科研项目 [1]国家自然基金面上项目:三维基因组结构模式挖掘方法研究 No.618731982019.1~2022.12项目负责人 [2]国家重点研发计划重点专项:精准医学大数据的有效挖掘与关键信息技术研发 No.SQ2018YFC0900022018.7~2020.12项目负责人 [3]国家自然科学基金重点项目:基于网络模型的癌症相关模式挖掘理论与方法 No.615320142016.1~2020.12项目负责人 [4]国家自然科学基金重大研究计划-延续项目:基于非编码RNA调控网络的复杂疾病致病模式发现研究 No.915301132016.1~2016.12项目负责人 [5]国家自然科学基金重点项目:基于高通量RNA-seq数据转录组拼接的关键技术与算法研究 No.614320102015.1~2019.12项目负责人 [6]国家自然科学基金重大研究计划项目:复杂疾病恶化过程相关模式发现理论与方法研究 No.911300062012.1-2014.12项目负责人 [7]国家自然科学基金重点项目:生物网络数据分析与挖掘中相关理论与关键技术 No.609330092010.1-2013.12项目负责人 [8]国家自然科学基金项目:第六届系统生物学国际研讨会 No.612103060322012.8~9项目负责人 [9]高等学校博士学科点专项科研基金:基于图挖掘的蛋白质网络功能模块识别算法 No.2008070100132009.1-2011.12项目负责人 [10]国家自然科学基金资助项目:生物分子网络数据分析中相关图问题及其算法研究 No.605740392006.1-2008.12项目负责人 [11]国家自然科学基金资助项目:基于自装配的分子计算模型及算法研究 No.304704142005.1-2005.12项目负责人 [12]教育部留学回国人员科研启动基金:生物网络的模体发现算法研究 2007.1-2008.12项目负责人 [13]陕西省科技攻关项目:基于H.254的新一代视频会议系统 No.2004K05-G302004.1-2005.12项目负责人 [14]陕西省自然科学研究计划项目:DNA计算:自装配模型及算法研究 No.2003F092004.1-2004.12项目负责人 [15]陕西省自然科学研究计划项目:DNA分子生物计算理论及其在决策和组合优化问题中的应用 No.2001X052002.1-2003.12项目负责人 [16]太原卫星发射基地项目:多测速设备远程智能诊断方法及技术研究 2009.12-2010.6项目负责人 [17]西门子公司:基于贝叶斯网络的告警事件关联分析 2010.1-2010.6项目负责人 荣誉获奖 教学获奖 1.2016博士生马小科获“陕西优秀博士学位论文”,“西安电子科技大学优秀博士学位论文” 2.2016博士生王炳波获“西安电子科技大学优秀博士学位论文” 3.2015博士生郭杏莉获“陕西省优秀博士学位论文”,“西安电子科技大学优秀博士学位论文” 4.2014高琳获年度“西安电子科技大学研究生优秀导师” 5.2013博士生鱼亮获“陕西省优秀博士学位论文”,“西安电子科技大学优秀博士学位论文” 6.2006高琳陕西省教育工会“陕西省师德标兵”称号 7.2006高琳西安电子科技大学“十佳师德标兵”称号 8.2001高琳西安电子科技大学获第四届校级青年教师讲课竞赛三等奖 9.2000高琳西安电子科技大学计算机学院讲课竞赛一等奖 10.1999高琳西安电子科技大学“华为”奖教金三等奖 11.1998高琳西安电子科技大学“永新”奖教金三等奖 科研获奖 2015生物网络数据挖据理论方法及应用研究电子学会自然科学二等奖 2014生物网络数据分析与挖掘中相关理论与关键技术西安电子科技大学优秀科研成果奖 科研团队 教师团队 姓名职称E-mail研究方向 高琳教授lgao@mail.xidian.edu.cn ComputationalBioinformatics Dataminingandapplication Graphandoptimizationalgorithm 鱼亮副教授lyu@xidian.edu.cnDrugtargetdiscovery 郭杏莉副教授xlguo@mail.xidian.edu.cnNon-codingRNAanddisease 王炳波副教授bingbowang@xidian.edu.cnComplexnetwork 覃桂敏副教授gmqin@mail.xidian.edu.cnMotifdiscoveryinbiologicalnetwork 邓岳副教授anfdeng@163.comNetworkbaseddiseasegenediscovery 王玙副教授cheerwangyu@163.comCommunitystrucyureanalysisincomplexnetwok 黄晓太博士后111333ideal@163.comComplexdiseaseingenomics 贾松卫博士后swjia@xidian.edu.cnCommunitystrucyureanalysisincomplexnetwok 博士研究生 宋菲ronasong@163.com 王培卓wangpeizhuo_37@163.comComplexnetworkanalysisanditapplications 胡宇轩772437602@qq.comComplexdiseaseandtherapy 叶育森ccyeyusen@sina.comRNA-Seqdataanalysis 温潇williamxiao@live.cnlncRNAanddiseaseasscoiation 段然duanran9013@126.comIntergrationofomicsdata 张晨星595449306@qq.comIdentificationofcelltypes 王卫兵1457227271@qq.com3Dgenomeanalysis 樊奭琛fanshichen_jdi@foxmail.com3Dgenomeanalysis 硕士研究生 2016级 李玉峰290140398@qq.comIntergration 王宏达hongdawang@stu.xidian.edu.cnIntergrationofomicsdata 高伟1597927632@qq.comncRNAforcanceranalysis 张晨星595449306@qq.comcanceranalysisingenomics 龚倩华violetgong@163.comcanceranalysisingenomics 兰小明244672930@qq.com methodsfornetworkanalysis 已经毕业博士生 李凤lifeng_10_28@163.com 石凯shikai1030@yahoo.com.cn桂林理工大学计算机学院 邓岳Ianfdeng@163.com西电软件学院 贾松卫swjia@xidian.edu.cn西电软件学院 张馨东dyh5415@163.com 吴昊wuhao_f4@nwsuaf.edu.cn西北农林科技大学信息学院 杨晓飞yangxiaofeihe@163.com西安交通大学电信学院 王玙cheerwangyu@163.com西电经济管理学院 王炳波bingbowang@xidian.edu.cn西电计算机学院 马小科maxiaoke8218@163.com西电计算机学院 张恩利yuleeo@163.com部队 郭杏莉xlguo@mail.xidian.edu.cn西电计算机学院 豆增发jssdzf@126.com电子部二十所 鱼亮lyu@xidian.edu.cn西电计算机学院 赵建邦Zjb9797@163.com西北农林科技大学信息学院 孙鹏岗psun@mail.xidian.edu.cn西电计算机学院 付立东fulidong2005@163.com西安科技大学计算机学院 覃桂敏gmqin@mail.xidian.edu.cn西电软件学院 已经毕业研究生 2015级 李省li_xing_00@163.com 何睿杰rjhe93@163.com 王莹jinxishanshenhua@qq.com 杨柳liu_yangyl@163.com 徐海福985778242@qq.com 2014级 申琳18710600256@163.com腾讯 贾成龙jiachenglong1991@qq.com华为深圳 梁飞翔1554572969@qq.com美团北京 2013级 肖非615210282@qq.com阿里巴巴 王铜932766703@qq.com华为 张军雁172840448@qq.com浪潮集团 张嘉慧1264052951@qq.com中国农业银行 谈琼琼1006388513@qq.com搜狗 郑经龙zjl721@126.com去哪儿网 杨佳朋iGabon@163.com网易 2012级 王羽695791323@qq.com上海615所 张卉宁grass1219@126.com西安市高新区教育局 刘华liuhuaapple@163.com阿里巴巴集团 张献鹏1054995146@qq.com中兴通讯 梁博lb19880512@qq.com百度 房金飞461144783@qq.com交通银行 2011级 刘亚盟liuyamengone@163.com腾讯 邵海珠shaohaizhu88@126.com腾讯 张青芳gogozqf@yeah.net高德地图 杨晓飞ngxiaofeihe@163.com读博 2010级 杨建业yangjianye0@163.com去哪儿网 刘笑逸253630388@qq.comIGT 吉烁amanda_211@126.com读博 刘永轩xuk318@126.com亚马逊 党合萱dang_hx1987@126.com阿里 邓琨dkxiaobai@163.com百度 陈喆xschenzhezhtx@yahoo.com.cn百度 周慧琪68292544@qq.com百度 2009级 王丹阳sunshinein@qq.com腾讯 李佳佳liudingzhijiajia@163.com中兴 熊站营xiongzhanying@gmail.com华为 王刚magicwangxd@qq.com中信证券 魏春水562573715@qq.com腾讯 孔垂亮morrain1987@foxmail.com中控集团 廖至峰78088371@qq.com腾讯 2008级 呼加璐jialu.hu@fu-berlin.de德国读博 宋佳songjia3000@163.com 百度 陈新chafall@163.com 江西省银监局 吴胜wusheng24@163.com交通银行总行 孙玲riplotus@163.com德国读博 李奎greatgreen@163.com华为 靳二辉jinerhui1984@163.com 百度 赵雪霞zhaoxuexia000@163.com 中兴 2007级 张汉珍zhzmailbox@126.com 杭州淘宝 詹海萍helenazhan@163.com 建设银行总行 崔力强249084150@qq.com 西安斯特沃克 杨常清surcarles@163.com 肖伟甲topweijia@yahoo.com.cn 上海万得资讯 牛为秋mynamefmm@163.com北京搜狐 刘杰sqliujie@126.com西安中兴 王蓓金Peiking23@126.com西电计算机学院 张明ddxyzm@163.com西安中兴 张道广Hard-workingboy@163.com 郭伟Gw110511@163.com北京兴唐通信科技有限公司 吴振华Wzhkknd@tom.com 2006级 周敬77531989@qq.com中兴通讯 刘文艳xd_lwy@126.com 华为公司 侯青敏xiaoqing1691@126.com 大唐软件 张守霞sxzhang19840622@qq.com 中兴通讯 梁多勇liangduoyong2003@163.com华为公司 谢孝青xiexiaoqing110@126.com大唐软件 陈熠Tccy19841013@126.com 杭州中兴科技 2005级 周晓锋zxfax@163.com 华为公司 韩明伟mingweihan@126.com 部队 陈培毅chenpeiyi9@163.com华为公司 王慧蕴Why19810811@163.com 华为公司 2004级 吴晓成tjaiwxc@163.com631研究所 尹金荔yinjinli@hotmail.com华为公司 汪军锋sunlitww@hotmail.com中兴科技 2003级 曾艳zengyanzi@163.com 西安邮电学院 王科平keping_w@126.com中兴科技 马春芝ma402@163.com华为公司 陈茂laomaolaile@hotmail.com 北京大唐电信 孙柯柯sunkeke@gmail.com上海32研究所 课程教学 目前本人承担的教学任务: 研究生教学 计算生物信息学导论自2006年起每年的秋季,48学时双语 2009年获研究生院研究型课程建设项目资助 图的挖掘技术及应用 0312209 自2008年起每年的春季,32学时双语 本科生教学 概率论与数理统计2014年至今48课时 数据挖掘2007-2013年起每年的秋季,26+8课时 算法设计与分析, 数值分析,概率论, 线性代数,组合数学 2008年及以前的课程 关于研究生招生的信息: 对学生的要求是: 课程方面:数学基础,如概率与数理统计,线性代数等;算法设计与分析,数据结构等计算机课程。 能力方面:良好的编程和动手能力,英语阅读和书写能力,同学之间的协调合作能力。 自我激励:具有学习的能动性,善于思考,善于提问,就感兴趣的问题积极讨论,深入钻研。 今后我们将继续招收博士研究生,硕士研究生;并在原有的基础上,招收博士后,欢迎有志于从事科研工作的人员报考。祝所有报考的学生都能取得好的成绩!同时也谢谢你们的关注!

研究领域

数据挖掘基础与应用 1、数据挖掘、机器学习理论与方法 2、图挖掘技术及社交网络数据分析 3、动态数据挖掘 生物数据分析及在疾病中的应用 1、生物数据网络建模与高效分析算法 2、复杂疾病模式挖掘与分析方法 3、长非编码RNA(LncRNA)分析 图论与组合优化算法及应用 1、图结构划分算法及复杂网络拓扑结构特征分析 2、组合优化算法

近期论文

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2019 [1]YuxuanHu,LinGao*,etal.Optimalcontrolnodesindisease-perturbednetworksastargetsforcombinationtherapy.NatureCommunications2019,10:2180IF=12.353 [2]YusenYe,LinGao*,ShihuaZhang*.CIRCLETCirculartrajectoryreconstructionuncoverscell-cycleprogressionandregulatorydynamicsfromsingle-cellHi-Cmaps.AdvancedScience2019:1900986IF=15.804 [3]YusenYe,LinGao*,ShihuaZhang*.MSTD:anefficientmethodfordetectingmulti-scaletopologicaldomainsfromsymmetricandasymmetric3Dgenomicmaps.AdvancedScienceNucleicAcidsResearch(IF=11.561) [4]RanDuan,LinGao*etal.CEPIM:acomparisonandevaluationplatformforintegrationmethodsincancersubtyping.FrontiersinGenetics2019,10:966,0814 [5]LiangYu,ShunyuYao,LinGao*,YunhongZha.Conserveddiseasemodulesextractedfrommultil[ant]ayerheterogeneousdiseaseandgenenetworksforunderstandingdiseasemechanismsandpredictingdiseasetreatments.FrontiersinGenetics2019,9:745 [6]LiangYu,LinGao.Humanpathway-baseddiseasenetwork.IEEE/ACMTransactionsonComputationalBiologyandBioinformatics2019,16(4):1240~1249 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学术兼职

计算机学会生物信息学专业委员会副主任,人工智能学会生物信息学与人工生命专业委员会副主任,运筹学会计算生物信息学分会常务理事,细胞生物学学会生物信息学与系统生物学分会理事。陕西省学位委员会学科评议组第三届成员,西安电子科技大学第八界学术委员会委员。国家科学技术奖评审专家,国家重大专向评审专家,第十三届、十四届国家自然基金委员会信息学部评审组专家,863项目答辩评审专家。国家自然基金、博士点基金、博士后基金、留学回国人员基金等通讯评审专家,《FrontiersinBioinformaticsandComputationalBiology》编委。APBC,ISBRA,IEEEISB等多个国际会议PC。

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