个人简介
招生专业
071007-遗传学
071002-动物学
071004-水生生物学
招生方向
原生动物基因组学，四膜虫基因工程
原生动物学，进化生物学，
原生动物功能基因组学，分子毒理学
教育背景
1999-09--2002-06 中国科学院水生生物研究所 博士
1996-09--1999-06 武汉大学 硕士
1992-09--1996-06 武汉大学 学士
工作简历
2018-09~现在, 中国科学院水生生物研究所, 副所长，研究员
2007-01~2008-12,美国罗切斯特大学, 高级访问学者
2004-07~2005-01,美国加州大学圣巴巴拉分校, 高级访问学者
2002-07~2018-08,中国科学院水生生物研究所, 助理研究员，副研究员，研究员
教授课程
高级水生生物学
高级水生生物学浮游动物周丛生物
水生生物生命科学前沿与进展
奖励信息
（1） 水生模式生物的功能蛋白质组学研究, 二等奖, 省级, 2019
（2） 中国动物学会青年科技奖, , 其他, 2009
专利成果
（ 1 ） 含HSP70启动子和GFP的四膜虫转基因载体及制备方法和应用, 发明, 2011, 第 2 作者, 专利号: ZL200910062093.X
（ 2 ） 一种嗜热四膜虫的高密度发酵方法, 发明, 2016, 第 1 作者, 专利号: ZL201410024085.7
（ 3 ） CYP5013C2蛋白及其编码基因以及表达CYP5013C2蛋白的四膜虫, 发明, 2015, 第 1 作者, 专利号: ZL201310124935.6
（ 4 ） 来源于四膜虫的TpyArsM蛋白及其编码基因和应用, 发明, 2015, 第 1 作者, 专利号: ZL201410001904.6
（ 5 ） 几丁质酶的四膜虫表达载体及其在表达几丁质酶中的应用, 发明, 2012, 第 3 作者, 专利号: ZL20110430564.5
科研项目
（ 1 ） 原生动物嗜热四膜虫组蛋白 3 甲基化/去甲基化表观遗传信息网络的组成及进化研究, 主持, 国家级, 2011-01--2013-12
（ 2 ） 原生动物嗜热四膜虫细胞色素P450基因家族的功能基因组研究, 主持, 国家级, 2009-01--2011-12
（ 3 ） 基于四膜虫高效表达技术的抗菌肽水产饲料添加剂的研发, 主持, 部委级, 2011-01--2013-12
（ 4 ） 嗜热四膜虫基因表达数据库的建立及表观遗传学研究, 主持, 部委级, 2009-09--2012-08
（ 5 ） 用于水体重金属污染物监测和富集的四膜虫细胞株的研发, 主持, 省级, 2010-10--2012-09
（ 6 ） 基于实验进化基因组学的嗜热四膜虫有性生殖和无性生殖对新环境适应分子机制的比较研究, 主持, 国家级, 2013-01--2015-03
（ 7 ） 生殖健康研究：四膜虫减数分裂基因功能分析, 主持, 国家级, 2013-04--2016-03
（ 8 ） 原生动物学, 主持, 国家级, 2016-01--2020-12
（ 9 ） 嗜热四膜虫有性生殖和无性生殖突变率差异的分子机理和群体遗传学研究, 主持, 国家级, 2017-01--2019-12
（ 10 ） 十五种原生动物四膜虫砷耐受性的比较分析、砷甲基化酶基因的功能研究及砷减毒四膜虫基因工程细胞株的构建, 主持, 国家级, 2020-01--2023-12
（ 11 ） 四膜虫多种性别的性别决定和维持机制及进化遗传学研究, 主持, 部委级, 2019-09--2024-08
（ 12 ） 高效甲基化砷的四膜虫砷减毒基因工程细胞株的研发, 主持, 省级, 2019-07--2021-12
参与会议
（1）嗜热四膜虫遗传学分析 2016年遗传学联盟大会 2016-07-12
（2）Comparative genomics reveals insights into genome divergence and speciation of Tetrahymena 2015-07-10
近期论文
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（1） A strategy for complete telomere-to-telomere assembly of ciliate macronuclear genome using ultra-high coverage Nanopore data, BioRxiv, 2020, 通讯作者
（2） Insights into the origin and evolution of Peritrichia (Oligohymenophorea, Ciliophora) based on analyses of morphology and phylogenomics, Molecular phylogenetics and evolution, 2019, 通讯作者
（3） Tetrahymena Comparative Genomics Database (TCGD): a community resource for Tetrahymena, Database, 2019, 通讯作者
（4） RNAi-dependent Polycomb repression controls transposable elements in Tetrahymena, Genes & development, 2019, 其他（合作组作者）
（5） Hidden genomic evolution in a morphospecies—The landscape of rapidly evolving genes in Tetrahymena, PLoS Biology, 2019, 通讯作者
（6） Exploration of Genetic Variations through Single cell Whole genome Sequencing in the Model Ciliate Tetrahymena thermophila, Journal of Eukaryotic Microbiology, 2019, 通讯作者
（7） Single-cell transcriptome sequencing of rumen ciliates provides insight into their molecular adaptations to the anaerobic and carbohydrate-rich rumen microenvironment, Molecular Phylogenetics and Evolution, 2019, 通讯作者
（8） 嗜热四膜虫有性后代的分离纯化, 动物学杂志, 2019, 通讯作者
（9） 竹节参处理下嗜热四膜虫基因表达变化分析, 中国中药杂志, 2019, 通讯作者
（10） 西藏温泉两种中国新记录纤毛虫第一双小核草履虫和明布雷斯四膜虫的形态学和系统发育学研究, 水生生物学报, 2019, 通讯作者
（11） EOGD: the Euplotes octocarinatus genome database, BMC Genomics, 2018, 第 2 作者
（12） Transcriptome Analysis Reveals the Molecular Mechanism of Resting Cyst Formation in Colpoda aspera, Journal of Eukaryotic Microbiology, 2018, 通讯作者
（13） A DP-like transcription factor protein interacts with E2fl1 to regulate meiosis in Tetrahymena thermophila, Cell cycle, 2018, 通讯作者
（14） Pseudocohnilembus persalinus genome database-the first genome database of facultative scuticociliatosis pathogens, BMC genomics, 2018, 第 3 作者
（15） Nonsense-mediated mRNA decay in Tetrahymena is EJC independent and requires a protozoa-specific nuclease, Nucleic Acids Research, 2017, 通讯作者
（16） A germline-limited piggyBac transposase gene is required for precise excision in Tetrahymena genome rearrangement, Nucleic Acids Research, 2017, 通讯作者
（17） E2fl1 is a meiosis-specific transcription factor in the protist Tetrahymena thermophila, Cell Cycle, 2017, 通讯作者
（18） Phylogenomic analysis of Balantidium ctenopharyngodoni (Ciliophora, Litostomatea) based on single-cell transcriptome sequencing, Parasite, 2017, 通讯作者
（19） 四种淡水缘毛类纤毛虫的形态学研究, 水生生物学报, 2017, 通讯作者
（20） Dissecting relative contributions of cis- and trans-determinants to nucleosome distribution by comparing Tetrahymena macronuclear and micronuclear chromatin, Nucleic Acids Research, 2016, 通讯作者
（21） 原生动物柯立斯四膜虫 (Tetrahymena corlissi) 超高砷耐受性的分子机制研究, 中国科学: 生命科学, 2016, 通讯作者
（22） 嗜热四膜虫减数分裂研究进展, 动物学杂志, 2016, 通讯作者
（23） Cdk3, a conjugation-specific cyclin-dependent kinase, is essential for the initiation of meiosis in Tetrahymena thermophila, Cell Cycle, 2016, 通讯作者
（24） 嗜热四膜虫 SPO11 基因缺陷型细胞株的基因表达变化分析, 基因组学与应用生物学, 2016, 通讯作者
（25） Cyc17, a meiosis-specific cyclin, is essential for anaphase initiation and chromosome segregation in Tetrahymena thermophila, Cell Cycle, 2016, 通讯作者
（26） 八种纤毛虫减数分裂基因的分子进化研究, 动物学杂志, 2016, 通讯作者
（27） Phylogenomic analyses reveal subclass Scuticociliatia as the sister group of subclass Hymenostomatia within class Oligohymenophorea, Molecular Phylogenetics and Evolution, 2015, 通讯作者
（28） Genome of the facultative scuticociliatosis pathogen Pseudocohnilembus persalinus provides insight into its virulence through horizontal gene transfer, Scientific reports, 2015, 通讯作者
（29） Tracing the Structural Evolution of Eukaryotic Atp Binding Cassette Transporter Superfamily, Scientific Reports, 2015, 通讯作者
（30） 嗜热四膜虫可变剪接基因鉴定及功能分析, 基因组学与应用生物学, 2015, 通讯作者
（31） New Phylogenomic and Comparative Analyses Provide Corroborating Evidence that Myxozoa is Cnidaria, Molecular Phylogenetics and Evolution, 2014, 通讯作者
（32） A P450 gene associated with robust resistance to dichlorodiphenyltrichloroethane (DDT) in ciliated protozoan, Tetrahymena thermophila by efficient degradation, Aquatic Toxicology, 2014, 通讯作者
（33） Identification and characterization of the arsenite methyltransferase from a protozoan, Tetrahymena pyriformis, Aquatic Toxicology,, 2014, 通讯作者
（34） Phosphoproteomic Analysis of Protein Phosphorylation Networks in Tetrahymena thermophila, a Model Single-celled Organism, Molecular & Cellular Proteomics, 2014, 通讯作者
（35） Cd-Metallothioneins in Three Additional Tetrahymena Species: Intragenic Repeat Patterns and Induction by Metal Ions, Journal of Eukaryotic Microbiology, 2014, 通讯作者
（36） ATP-binding cassette transporter enhances tolerance to DDT in Tetrahymena, Science China-Life Sciences, 2014, 通讯作者
（37） Selecting One of Several Mating Types through Gene Segment Joining and Deletion in Tetrahymena thermophila, PLoS Biology, 2013, 通讯作者
（38） Transcriptome Analysis of the Model Protozoan, Tetrahymena thermophila, Using Deep RNA Sequencing, PLoS One, 2012, 通讯作者
（39） The nonhistone N-terminal tail of an essential chimeric H2A variant regulates mitotic H3 S10 dephosphorylation, Genes and Development , 2012, 第 3 作者
（40） Tetrahymena Gene Expression Database(TGED): a resource of microarray data and co-expression analyses for Tetrahymena, Science China Life Science, 2011, 通讯作者
（41） Gene Network Landscape of the Ciliate Tetrahymena thermophila. , PLoS One, 2011, 通讯作者
（42） Genome-wide identification and evolution of ATP-binding cassette transporters in the ciliate Tetrahymena thermophila: A case of functional divergence in a multigene family. , BMC Evolutionary Biology, 2010, 通讯作者
（43） Microarray analyses of gene expression during the Tetrahymena thermophila life cycle. , PLoS One, 2009, 第 1 作者
（44） Genome-wide identification and characterization of cytochrome P450 monooxygenase genes in the ciliate Tetrahymena thermophila., BMC Genomics, 2009, 通讯作者
（45） Differentially expressed genes of Tetrahymena thermophila in response to tributyltin (TBT) identified by suppression subtractive hybridization. , Aquatic Toxicology, 2007, 通讯作者
（46） Characterisation of A Novel Cadmium-induced Metallothionein in Tetrahymena pyriformis. , Protist, 2006, 通讯作者
（47） Identification of differentially expressed genes in Tetrahymena thermophila in response to Dichlorodiphenyltrichloroethane (DDT) by suppression subtractive hybridisation. , Environmental Microbiology, 2006, 第 1 作者
学术兼职
2015-01-01-今,国际原生生物学家学会, 国际委员会委员
2014-04-01-今,湖北省动物学会, 副理事长
2013-01-01-2020-12-30,国际四膜虫研究指导委员会（Tetrahymena Research Advisory Board， TetRA）, 当然委员（ex officio）
2009-09-01-今,中国动物学会, 理事
2001-09-30-今,中国动物学会原生动物学会, 副理事长，秘书长
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