个人简介
招生专业
071005-微生物学
招生方向
工业酿造微生物
酿酒酵母的起源与进化
传统酿造微生物组
教育背景
1992-09--1996-04 中国科学院研究生院 理学博士
1984-09--1987-09 中国科学院研究生院 理学硕士
1980-09--1984-07 中山大学生物系 理学学士
学历
1992/09 – 1996/04 中国科学院研究生院，微生物学专业，理学博士
1984/09 – 1987/09 中国科学院研究生院，微生物学专业，理学硕士
1980/09 – 1984/07 中山大学生物系，理学学士
主要从事酵母菌生物多样性、分子系统学和进化生物学以及酿造微生物组研究。在酵母菌资源调查、分类鉴定和菌种保藏的基础上，重点进行下述方面的研究：1) 酵母菌系统发育、物种分化与形成机制；2) 酿酒酵母菌群体遗传学和群体基因组学；3) 工业酵母菌优良发酵和抗逆性能的分子机制与遗传改造；4) 传统酿造微生物组学。 已发表酵母菌新纲3个、新目5个、新科20个、新属58个、新种190余个和新组合340余个；重建了酵母菌重要类群的分类系统；发现了白念珠菌致病类型、药物敏感性和基因型之间的对应性；确立了酿酒酵母菌的中国/东亚起源说和拉格啤酒酵母菌的青藏高原起源说。 已发表酵母菌新纲3个、新目5个、新科20个、新属58个、新种190余个和新组合340余个；重建了酵母菌重要类群的分类系统；发现了白念珠菌致病类型、药物敏感性和基因型之间的对应性；确立了酿酒酵母菌的中国/东亚起源说和拉格啤酒酵母菌的青藏高原起源说。已在国际核心(SCI)期刊发表研究论文近100篇。参与国际酵母菌系统学研究领域权威专著和工具书《The Yeasts, a Taxonomic Study》第5版(Elsevier，2011)的编著，并以共同主编身份，组织该工具书下一版的编著。
工作简历
2013-01~2018-12,荷兰皇家艺术与科学院真菌多样性研究中心(CBS), 兼职研究员
2008-12~2009-03,日本千叶大学医学部, 客座教授
2002-01~2002-10,日本畜产草地研究所, JSPS Fellow
2000-10~现在, 中国科学院微生物研究所, 博士生导师
1999-11~现在, 中国科学院微生物研究所, 研究员
1999-04~1999-10,日本理化学研究所, 研究员
1997-02~1997-08,日本理化学研究所, 研究员
1996-09~1999-10,中国科学院微生物研究所, 副研究员
教授课程
微生物学前沿
真菌系统学及进化生物学
真菌学前沿
奖励信息
（1） 青藏高原经济真菌资源研究与评价利用, 一等奖, 省级, 2019
（2） 戴芳澜杰出成就奖, 其他, 2019
（3） 中国科学院优秀导师奖, 院级, 2019
（4） 国务院政府特殊津贴, 国家级, 2016
专利成果
（ 1 ） 基于高通量测序技术的银耳菌种纯度检测方法及其应用, 发明, 2019, 第 3 作者, 专利号: 201810268642.8
科研活动
作为主持人已完成过多项国家自然科学基金项目和国家科技攻关项目，包括国家杰出青年科学基金项目：酵母菌资源与系统学；基金委重大国际合作项目：担子菌酵母的分子系统发育；基金委重大研究计划培育项目：酿酒酵母菌驯化群体的进化基因组学研究。
目前主持的在研项目包括科技部科技基础资源调查专项：我国主要沿海滩涂特色微生物资源调查；中国科学院知识创新工程基础前沿项目：酿酒酵母群体基因组学与分子演化工程；来自北京牛栏山酒厂、贵州茅台酒厂、山西汾酒厂、江苏今世缘酒厂和湖北安琪酵母公司等8家大型企业的企业委托研发项目。
科研项目
（ 1 ） 我国驯养酵母菌资源、遗传多样性与群体演化研究, 主持, 国家级, 2015-01--2018-12
（ 2 ） 酿酒酵母菌的进化生物学研究, 主持, 部委级, 2016-08--2020-12
（ 3 ） 茅台酒发酵过程中酵母菌和乳酸菌全程解析, 主持, 院级, 2016-10--2020-09
（ 4 ） 微生物资源深度挖掘和可持续利用国际合作网络, 主持, 部委级, 2016-01--2020-12
（ 5 ） 功能微生物群体合成库建设, 主持, 部委级, 2016-11--2018-06
（ 6 ） 我国主要沿海滩涂特色微生物资源调查, 主持, 国家级, 2020-01--2023-12
（ 7 ） 汾酒大曲评价体系建立及机械化酿造品质提升, 主持, 院级, 2020-04--2023-03
参与会议
（1）Adaptive evolution of sugar metabolism networks in domesticated lineages of Saccharomyces cerevisiae 2019-10-21
（2）Adaptive evolution of sugar metabolism networks in yeast 2019-10-01
（3）The Origin and Adaptive Evolution of Domestic Populations of Yeast from Far East Asia 2018-04-18
（4）The Origin and Genome Evolution of the Wild and Domestic Populations of Yeast 2017-07-17
（5）A hidden species and sibling genus of Saccharomyces predicted by gene introgression events 2016-09-11
（6）The origin, domestication and taxonomy of lager beer yeast 2016-06-13
合作情况
与日本、欧洲和美国同行开展了广泛的国际合作。与荷兰皇家艺术与科学院真菌多样性研究中心(CBS-KNAW Fungal Bioversity Center)酵母菌研究组建立了长期稳定的合作研究关系。双方的合作研究项目成功获得了中国国家自然科学基金委员会重大国际合作项目和荷兰皇家艺术与科学院中国交流项目的资助，合作其间双方研究组长定期短期互访，本实验室年轻研究人员每年可在CBS工作5个月。
作为主要编辑之一，与国际酵母菌系统分类学研究领域的权威合作，共同编辑国际酵母菌研究领域的权威专著《The Yeasts》电子版 (http://www.theyeasts.org/page/Homepage)。
通过承接企业委托研发项目和共建院士专家工作站等方式，与北京牛栏山酒厂、贵州茅台酒厂、山西汾酒厂、江苏今世缘酒厂和湖北安琪酵母公司等8家大型企业建立了合作研究关系，获得研发项目合同经费1760万元。
近期论文
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（1） Diversity and phylogeny of basidiomycetous yeasts from plant leaves and soil: Proposal of two new orders, three new families, eight new genera and one hundred and seven new species, Studies in Mycology, 2020, 通讯作者
（2） Diversity and distribution of yeasts in indigenous fermented foods and beverages of Ethiopia, Journal of the Science of Food and Agriculture, 2020, 通讯作者
（3） Occurrence and molecular identification of wild yeasts from Jimma Zone, South West Ethiopia, Microorganisms, 2019, 通讯作者
（4） Takashi Nakase’s last tweet: what is the current direction of microbial taxonomy research?, FEMS Yeast Research, 2019, 第 3 作者
（5） Reverse evolution of a classic gene network in yeast offers a competitive advantage, Current Biology, 2019, 通讯作者
（6） Revision of the medically relevant species of the yeast genus Diutina, Medical Mycology, 2019, 第 10 作者
（7） Virulence and antifungal susceptibility of microsatellite genotypes of Candida albicans from superficial and deep locations, Yeast, 2019, 第 10 作者
（8） Four new species of Tremella (Tremellales, Basidiomycota) based on morphology and DNA sequence data, MycoKeys, 2019, 第 3 作者
（9） Adaptation by Loss of Heterozygosity in Saccharomyces cerevisiae Clones Under Divergent Selection, Genetics, 2019, 第 8 作者
（10） Himalayan Saccharomyces eubayanus Genome Sequences Reveal Genetic Markers Explaining Heterotic Maltotriose Consumption by Saccharomyces pastorianus Hybrids, Applied and Environmental Microbiology, 2019, 第 8 作者
（11） 低温大曲酵母菌分离和计数培养方法优化, Development of mold-inhibiting methods for selective isolation and counting of yeasts from low-temperature liquor starter “daqu”, 菌物学报, 2019, 通讯作者
（12） Phylogenetic re-evaluation of Thielavia with the introduction of a new family Podosporaceae, Studies in Mycology, 2019, 第 2 作者
（13） Redefining Humicola sensu stricto and related genera in the Chaetomiaceae, Studies in Mycology, 2019, 第 8 作者
（14） Kondoa gutianensis f.a. sp. nov., a novel ballistoconidiumforming yeast species isolated from plant leaves, Antonie van Leeuwenhoek, 2018, 通讯作者
（15） Cryptococcus neoformans sexual reproduction is controlled by a quorum sensing peptide, Nature Microbiology, 2018, 第 10 作者
（16） The Origin and Adaptive Evolution of Domesticated Populations of Yeast from Far East Asia, Nature Communications, 2018, 通讯作者
（17） 拉格啤酒酵母菌物种和株系的快速分子鉴定, Simple molecular methods for rapid identification of species and groups of lager beer yeasts, 菌物学报, 2018, 通讯作者
（18） Heitmania gen. nov., a new yeast genus in Microbotryomycetes, and description of three novel species: Heitmania litseae sp. nov., Heitmania castanopsis sp. nov. and Heitmania elacocarpi sp. nov., InternationalJournal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2017, 通讯作者
（19） Microbial diversity in daqu during production of Luzhou-flavored liquor, Journal of the American Society of Brewing Chemists, 2017, 第 4 作者
（20） Transcriptome responses of Lactobacillus acetotolerans F28 to a short and long term ethanol stress, Scientific Reports, 2017, 第 8 作者
（21） Selected Schizosaccharomyces pombe strains have characteristics that are beneficial for winemaking, PLoS One, 2016, 第 5 作者
（22） Starmerella orientalis f.a., sp. nov., an ascomycetous yeast species isolated from flowers, International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2016, 第 6 作者
（23） Genomics and the making of yeast biodiversity, Current Opinion in Genetics & Development 35:100–109, 2015, 第 3 作者
（24） Phylogeny of tremellomycetous yeasts and related dimorphic and filamentous basidiomycetes reconstructed from multiple gene sequence analyses, Studies in Mycology 81: 1–26, 2015, 通讯作者
（25） Phylogeny of yeasts and related filamentous fungi within Pucciniomycotina determined from multigene sequence analyses, Studies in Mycology 81: 27-53, 2015, 通讯作者
（26） Multigene phylogeny and taxonomic revision of yeasts and related fungi in the Ustilaginomycotina, Studies in Mycology 81: 55–83, 2015, 通讯作者
（27） Towards an integrated phylogenetic classification of the Tremellomycetes, Studies in Mycology 81: 85-147, 2015, 通讯作者
（28） Phylogenetic classification of yeasts and related filamentous fungi within Pucciniomycotina, Studies in Mycology 81: 149-189, 2015, 通讯作者
（29） Evidence for a Far East Asian origin of lager beer yeast, Current Biology, 2014, 通讯作者
（30） Moniliellomycetes and Malasseziomycetes, two new classes in Ustilaginomycotina, Persoonia, 2014, 通讯作者
（31） White-Opaque Switching in Natural MTLa/a Isolates of Candida albicans: Evolutionary Implications for Roles in Host Adaptation, Pathogenesis, and Sex, PLoS Biology, 2013, 第 4 作者
（32） Surprisingly diverged populations of Saccharomyces cerevisiae in natural environments remote from human activity, Molecular Ecology, 2012, 通讯作者
（33） N-acetylglucosamine induces white-to-opaque switching and mating in Candida tropicalis, providing new insights into adaptation and fungal sexual evolution, Eukaryotic Cell , 2012, 通讯作者
（34） Prevalence of specific and phylogenetically closely related genotypes in the population of Candida albicans associated with genital candidiasis in China, Fungal Genetetics and Biology, 2012, 通讯作者
（35） Candida cellulosicola sp. nov., a xylose-utilizing anamorphic yeast from rotten wood, Int J Syst Evol Microbiol , 2012, 通讯作者
（36） Derxomyces amylogenes sp. nov., Derxomyces bambusicola sp. nov. and Derxomyces corylopsis sp. nov., three ballistoconidium-forming yeast species isolated from subtropical plant leaves, Int J Syst Evol Microbiol, 2012, 通讯作者
（37） Bensingtonia rectispora sp. nov. and Bensingtonia bomiensis sp. nov., novel ballistoconidium-forming yeast species from plant leaves collected in Tibet, Int J Syst Evol Microbiol, 2012, 通讯作者
（38） Proposal of Mingxiaea gen. nov. for the anamorphic basidiomycetous yeast species in the Bulleribasidium clade (Tremellales) based on molecular phylogenetic analysis and description of four novel Mingxiaea species, Int J Syst Evol Microbiol, 2011, 通讯作者
（39） Cryptococcus foliicola sp. nov. and Cryptococcus taibaiensis sp. nov., novel basidiomycetous yeast species from plant leaves., J Gen Appl Microbiol, 2011, 第 3 作者
（40） Correlation between azole susceptibilities, genotypes, and ERG11 mutations in Candida albicans isolates associated with vulvovaginal candidiasis in China, Antimicrob Agents Chemother, 2010, 通讯作者
（41） Lindnera wuzhiensis sp. nov., a novel ascomycetous yeast species, J Gen Appl Microbiol, 2010, 通讯作者
（42） Kazachstania taianensis sp. nov., a novel ascomycetous yeast species from orchard soil, Int J Syst Evol Microbiol, 2010, 通讯作者
（43） Four novel Candida species in the Candida albicans/Lodderomyces elongisporus clade isolated from the gut of flower beetles., Antonie van Leeuwenhoek, 2009, 通讯作者
（44） Candida pseudocylindracea sp. nov. and Candida wuzhishanensis sp. nov. from Hainan Island, southern China, Mycosystema, 2009, 通讯作者
（45） Torulaspora quercuum sp. nov. and Candida pseudohumilis sp. nov., novel yeasts from human and forest habitats., FEMS Yeast Research, 2009, 通讯作者
（46） 海南热带雨林腐木上酵母菌物种多样性研究, 菌物学报, 2009, 通讯作者
（47） 26S rDNA单链构象多态性分析在临床酵母菌菌种鉴定中的应用, 微生物学报, 2009, 通讯作者
学术兼职
2020-01-01-今,Studies in Mycology, 编委
2016-04-01-今,国际食品真菌委员会, 委员
2016-01-01-今,Yeast, 编辑
2015-07-01-今,中国菌物学会, 秘书长
2014-07-30-2017-09-01,国际微生物学会联盟真菌与真核微生物部执委, 秘书/财务
2013-09-01-今,国际酵母菌系统学和命名法委员会委员,
2011-04-01-今,Mycoscience编辑,
2008-08-15-今,国际酵母菌委员会委员,
2000-12-31-2014-12-30,FEMS Yeast Research 编委
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