魏冬青 - 上海交通大学 - 生命科学技术学院

个人简介

1987年7月在美属波多黎各大学获博士学位 1987年8月-1992年12月加拿大不列颠哥伦比亚大学做博士后研究和研究学者 1993年1月-2006年2月加拿大计算及其应用研究中心，任研究员 2000年2月-2000年7月北京大学教授 2002年1月起任加拿大康克迪亚大学分子设计研究中心成员(兼职) 2003年1月-2006年1月，天津市及天津师大特聘教授（海河学者），天津大学博士生导师，生物信息与药物开发研究所所长 2006年2月起任上海交通大学生物信息与生物统计系教授及长聘教授，博士生导师，以及微生物代谢国家重点实验室成员

研究领域

结构生物信息学以及AI辅助药物设计

近期论文

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Jing Chang, Peng Lian, Dong-Qing Wei*, Xiang-Rong Chen, Zizheng Gong and Qingming Zhang, “Thermal decomposition of the solid phase of nitromethane: Ab initio molecular dynamics simulations”, Phys. Rev. Lett. 105, 188302 -188305(2010). Ruo-Xu Gu, Limin Angela Liu*, and Dong-Qing Wei*, “Free Energy Calculations on the Two Drug Binding Sites in the M2 Proton Channel”, J. Am. Chem. Soc., 133 (28), 10817–10825(2011). Maoping Tang, Zhaoxia Wang, Ying Zhou, Wangjie Xu, Shengtian Li,Lianyun Wang, Dong-Qing Wei*, Zhongdong Qiao*, “A novel drug candidate for Alzheimer disease treatment - gx-50 derived from Zanthoxylum Bungeanum”, J. Alzheimer’s Disease, 34, 203–213 (2013). Wei, D. and G. Patey, "Orientational order in simple dipolar liquids: computer simulation of a ferroelectric nematic phase". Physical review letters, 1992. 68(13): p. 2043-2045. Wei, D. and D. Salahub, "Hydrated proton clusters and solvent effects on the proton transfer barrier: A density functional study". The Journal of chemical physics, 1994. 101(9): p. 7633-7642. Chu, Y., A.C. Kaushik, X. Wang, W. Wang, Y. Zhang, X. Shan, D.R. Salahub, Y. Xiong, and Wei D.Q., "DTI-CDF: a cascade deep forest model towards the prediction of drug-target interactions based on hybrid features". Briefings in Bioinformatics, 2019, doi: 10.1093/bib/bbz152. Wang, C., Wang, S., Li, D., Wei, D.Q.*, Zhao, J*. and Wang, J.*, “Human intestinal defensin 5 inhibits SARS-CoV-2 invasion by cloaking ACE2”. Gastroenterology, 2020, DOI: 10.1053/j.gastro.2020.05.015. Chu, Y., Zhang, Y., Wang , Q.K., Zhang, L.F., Wang, X.H., Wang, Y.J., , Salahub, D.R., Xu, Q.., Wang, J.M., Jiang, X., Xiong, Y*, and Wei, D.Q.*, “A transformer-based model to predict peptide–HLA class I binding and optimize mutated peptides for vaccine design”, Nature Machine Intelligence, 2022, 4(3):300-311, DOI: 10.1038/s42256-022-00459-7 (2021).