个人简介
博士、副研究员、硕导。2000年毕业于中南民族大学化学系生物化学专业，获学士学位；2003年毕业于华中科技大学生命科学与技术学院生物化学工程专业，获硕士学位；2008年毕业于复旦大学化学系化学生物学专业，2010年获博士学位。2008年8月留校于复旦大学生物医学研究院任助理研究员，2012年12月晋升副研究员。2012年任中国人类蛋白质组学组织（CNHUPO）生物信息学工作组成员。2014年7月双聘为复旦大学基础医学院医学系统生物学系副研究员。2014年9月～2016年8月赴瑞典卡罗琳斯卡医学院生物科学与营养系Jussi Taipale教授课题组开展博士后工作。2016~2020年担任CNHUPO理事。2017年1月~2018年12月双聘为上海市松江区中心医院消化科PI。2018年1月起双聘为同济大学附属皮肤病医院中心实验室PI。
硕士阶段从事植物组织和肿瘤细胞系培养，HBV、HPV表面抗原和IL12的重组表达，细胞培养动力学计算机建模，紫杉醇肝靶向结构化改造等课题。硕士毕业后先后从事蛋白质组学实验和生物信息学研究，主要包括人胎肝表达谱蛋白质组和人类肝脏蛋白质组计划（HLPP）的数据收集、处理和分析及平台建设工作。博士期间研究方向为系统生物学组学数据处理的方法论研究：建立和完善了基于质谱和二维凝胶灰度的大规模蛋白半定量方法；创建了从样品配对设计、转录组数据处理到生物学挖掘分析的平台；提出了转录组与蛋白组对接的新方法，并从生物学和进化角度进行了解释。先后围绕以肝癌、前列腺癌等为代表的恶性肿瘤开展多组学数据整合研究，包括标志物/药靶发现和预测预后模型建立。
已主持1项国家自然科学基金和1项上海市卫生局科研项目，参加国家传染病重大专项十一五、十二五子课题各1个，以及2个重点研发、3个973、1个863、1个国际合作项目、1个军工项目课题和1个国家自然科学基金重大研究计划集成项目。共计获得科研经费1,268万元。发表责任作者SCI论文20篇，另署名作者SCI论文27篇，总引用次数1400，H因子17。获得2项国内发明专利和1项软件著作权，申请3项国内发明专利。引进和参与翻译两本学术专著《分子克隆手册：蛋白质—蛋白质相互作用》、《系统生物学的理论、方法和应用》。被BMC Genomic Data、Scientific Reports、Therapeutic Medicine等杂志特邀为审稿人。
教育经历
1996.9～2000.6 中南民族学院 化学系 生物化学 本科
2000.9～2003.6 华中科技大学 生命科学与技术学院 生化工程 硕士
2002.3～2003.5 军事医学科学院 毒物药物研究所 药物化学 硕士联合培养
2005.3～2008.6 复旦大学 化学系 化学生物学 博士
工作经历
2003.8～2005.3 军事医学科学院 放射医学研究所 生物信息学 技术员
2008.7～2012.11 复旦大学 生物医学研究院 生物信息学助理研究员
2012.12～今 复旦大学 生物医学研究院 生物医学信息学副研究员
2014.7～今 复旦大学 基础医学院医学系统生物学系生物医学信息学副研究员
2014.9～2016.8卡罗琳斯卡医学院 生物科学与营养系 生物信息学博士后
2017.1～2018.12 上海市松江区中心医院消化科双聘PI
2018.1～今同济大学附属皮肤病医院中心实验室双聘PI
研究领域
基于深度学习方法的生物医学知识图谱推理
基于知识图谱推理的药物重定位和新药研发
基于多模态数据融合的疾病预测和诊断模型构建
基于多组学数据和生物分子网络的数据挖掘和知识发现
精准医学大数据知识库和知识图谱构建
近期论文
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学术兼职
2012～2019 中国人类蛋白质组组织生物信息学工作组成员
2016～2021 中国人类蛋白质组组织（CNHUPO）第四届理事
2020～今上海市抗癌协会遗传性消化道肿瘤专委会委员
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