刘长宁 - 中国科学院西双版纳热带植物园 -

个人简介

刘长宁 2.学习经历： 1996.9-2000.7武汉大学国家生物学基地班学士（导师黄诗笺教授） 2002.9-2007.7中科院计算技术研究所生物信息学博士（导师李国杰院士、陈润生院士） 2006.6-2007.1哈佛大学DanaFarber癌症研究所访问学生 3.工作经历： 2007.7-2010.7中科院计算技术研究所助理研究员 2010.7-2014.9中科院计算技术研究所副研究员 2011.1-2013.1德克萨斯大学达拉斯分校访问学者 2014.9–至今中科院西双版纳热带植物园研究员

研究领域

1.基于高通量测序数据分析和分子生物学实验的植物功能基因组(Functionalgenomics)研究； 2.基于宏基因组分析的微生物生态学(Microbialecology)研究； 3.基于进化分析和多种模式生物基因网络的长非编码RNA(Longnon-codingRNA)功能研究。

近期论文

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01)Liu,C.,B.Bai,etal."Noncode:AnIntegratedKnowledgeDatabaseofNon-CodingRnas."NucleicAcidsRes33,no.Databaseissue(2005):D112-5.(影响因子9.2引用次数200) 02)Zhang,Z.#,C.Liu#,G.Skogerbo,etal."DynamicChangesinSubgraphPreferenceProfilesofCrucialTranscriptionFactors."PLoSComputBiol2,no.5(2006):e47.(影响因子4.6计算生物学类Top3) 03)He,S.#,C.Liu#,G.Skogerbo,etal."NoncodeV2.0:DecodingtheNon-Coding."NucleicAcidsRes36,no.Databaseissue(2008):D170-2.(影响因子9.2引用次数108) 04)Zhao,Y.#,S.He#,C.Liu#,S.Ru,etal."MicrornaRegulationofMessenger-LikeNoncodingRnas:ANetworkofMutualMicrornaControl."TrendsGenet24,no.7(2008):323-7.(影响因子9.9引用次数33) 05)He,S.#,H.Su#,C.Liu#,G.Skogerbo,etal."Microrna-EncodingLongNon-CodingRnas."BMCGenomics9,(2008):236.(影响因子3.9引用次数51) 06)Yuan,X.#,C.Liu#,P.Yang,etal."ClusteredMicrornas'CoordinationinRegulatingProtein-ProteinInteractionNetwork."BMCSystBiol3,(2009):65.(影响因子2.2引用次数86) 07)Liu,C.*,J.LiandY.Zhao."ExploringHierarchicalandOverlappingModularStructureintheYeastProteinInteractionNetwork."BMCGenomics11Suppl4,(2010):S17.(影响因子3.9第九届国际生物信息学大会，大会报告) 08)Liao,Q.#,C.Liu#,X.Yuan,etal."Large-ScalePredictionofLongNon-CodingRnaFunctionsinaCoding-Non-CodingGeneCo-ExpressionNetwork."NucleicAcidsRes39,no.9(2011):3864-78.(影响因子9.2引用次数194) 09)Liao,Q.,H.Xiao,...,Z.Wu,C.Liu*andY.Zhao*."Ncfans:AWebServerforFunctionalAnnotationofLongNon-CodingRnas."NucleicAcidsRes39,no.WebServerissue(2011):W118-24.(影响因子9.2引用次数69次) 10)Li,J.,Z.XuanandC.Liu*."LongNon-CodingRnasandComplexHumanDiseases."IntJMolSci14,no.9(2013):18790-808.(影响因子3.3invitedreview引用次数42)