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个人简介

招生专业 071021-生物信息学 071007-遗传学 071023-计算生物学 招生方向 生物信息学 基因组结构与进化 基因调控网络 教育背景 1999-05--2001-06 加拿大Waterloo大学计算机系 硕士 1992-09--1995-07 中科院遗传所 博士 1985-09--1989-07 武汉大学 学士 工作简历 2012-02--今 中科院遗传发育所 研究员 2009-12--2012-02 菲律宾国际水稻所 Scientist/Crop Information Systems Specialist 2004-10--2009-11 美国冷泉港实验室 Scientific Informatics Manager I 2003-07--2004-10 美国University of Maryland Biotechnology Institute Research Associate 2001-07--2003-06 加拿大Bioinformatics Solutions公司 Bioinformatics Scientist 1996-06--1998-12 美国purdue大学昆虫系 postdoctoral Research Associate 科研项目 ( 1 ) 数据库建设与新算法开发, 主持, 部委级, 2013-08--2018-07

研究领域

新基因组测序、组装、注释 水稻基因组测序:结合二、三代测序和大片段DNA文库,比如BAC库、Fosmid文库,现已构建出一个接近完成的高质量籼稻参考基因组。 小麦基因组测序:结合二、三代测序和BAC文库,构建高质量的二倍体和六倍体参考基因组。 其它多个物种基因组测序:以三代测序为主的基因组组装。 水稻等群体基因型分析及GWAS 基因调控网络:利用RNA-seq数据为主进行基因共表达网络的构建 组学数据整合、分析、和数据库建设

近期论文

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(1) Genome sequence of the progenitor of wheat A subgenome Triticum urartu, Nature, 2018, 通讯作者 (2) The Tartary Buckwheat Genome Provides Insights into Rutin Biosynthesis and Abiotic Stress Tolerance, Molecular Plant, 2017, 通讯作者 (3) Sequencing and de novo assembly of a near complete indica rice genome, Nature Communications, 2017, 通讯作者 (4) Improving of Rice Blast Resistances in Japonica by Pyramiding Major R Genes, Frontiers in Plant Science, 2017, 通讯作者 (5) Melatonin regulates root architecture by modulating auxin response in rice, Frontiers in Plant Science, 2017, 第 5 作者 (6) Integrated analysis of phenome, genome, and transcriptome of hybrid rice uncovered multiple heterosis-related loci for yield increase, PNAS, 2016, 第 10 作者 (7) Gene expression analysis and SNP/InDel discovery to investigate yield heterosis of two rubber tree F1 hybrids, Scientific Reports, 2016, 通讯作者

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