当前位置: X-MOL首页全球导师 国内导师 › 童春发

个人简介

教育背景与工作(挂职)经历: 教育背景: 1999.09–2003.06南京林业大学林木遗传育种博士 1988.09–1991.06湖南大学应用数学硕士 1986.09–1988.06安徽教育学院数学 1983.09–1986.06合肥教育学院数学 工作经历: 2011.06-至今南京林业大学林学院教授 2009.10-2011.10美国宾夕伐尼亚州立大学博士后 2008.06-2011.05南京林业大学森林资源与环境学院副教授 2001.06-2008.05南京林业大学信息院副教授 2000.09-2001.08加拿大阿尔伯特大学可再生资源系访问学者 1994.06-2001.05南京林业大学信息院讲师 1991.07-1994.05南京林业大学基础课部助教 科研项目: 国家自然科学基金项目:利用杂交F2代群体和二代简化基因组测序技术构建杨树整合的遗传连锁图谱(31870654),2019.1~2020.12 国家自然科学基金项目:林木数量性状基因座功能作图统计模型及其在杨树中的应用(31270706),2013.1~2016.12 国家自然科学基金项目:林木不平衡试验数据遗传模型分析及应用(31070601),2011.1~2013.12 国家自然科学基金项目:林木高质量遗传图谱构建和QTL精确定位统计方法及应用(30872051),2009.1~2011.12 软件著作权登记: 童春发,多元性状复合区间QTL定位软件mvqtlcim,2016SR307662,2016.06.16 刘粉香,童春发,林木全同胞群体多变量QTL定位R语言程序mvqtlmap,2016SR317892,2016.05.06 王德源,童春发,林木半同胞子代测定育种值计算分析R语言程序HalfsibBV,2015SR151809,2015.05.05 王德源,童春发,林木多地点半同胞子代测定遗传分析R语言程序HalfsibMS,2015SR005301,2014.09.01 童春发,双列杂交设计遗传模型配合力分析软件GSCA,2015SR028845,2011.12.01 童春发,因子交配设计遗传模型分析软件WinNC2,2014SR132488,2013.06.01

研究领域

二代测序数据分析,包括基因组变异位点(SNP)识别、DNA序列拼接和转录组水平上基因注释及差异表达分析。 林木遗传图谱构建和数量性状基因(QTL)定位,包括分子标记连锁分析、分群、排序和绘图;QTL统计模型的建立、分析计算和软件开发。 林木常规遗传育种模型统计分析,包括配合力、育种值、遗传力和遗传相关系数等遗传参数计算以及相应的软件开发。

近期论文

查看导师新发文章 (温馨提示:请注意重名现象,建议点开原文通过作者单位确认)

DanYao,HainanWu,YuhuaChen,WenguoYang,HuaGao,ChunfaTong*.2018.gmRAD:anintegratedSNPcallingpipelineforgeneticmappingwithRADseqacrossahybridpopulation.BriefingsinBioinformatics,doi:10.1093/bib/bby114 ShentongTao,JiyanWu,DanYao,YuhuaChen,WenguoYang,ChunfaTong*.2018.Identificationofrecombinationeventsinoutbredspecieswithnext-generationsequencingdata.BMCGenomics,19:398 FenxiangLiu,ChunfaTong*,ShentongTao,JiyanWu,YuhuaChen,DanYao,HuogenLi,JisenShi.2017.MVQTLCIM:compositeintervalmappingofmultivariatetraitsinahybridF1populationofoutbredspecies.BMCBioinformatics,18:515 MohaddesehMousavi,ChunfaTong*,FenxiangLiu,ShentongTao,JiyanWu,HuogenLi,JisenShi.2016.DenovoSNPdiscoveryandgeneticlinkagemappinginpoplarusingrestrictionsiteassociatedDNAandwhole-genomesequencingtechnologies.BMCGenomics,17:656 ChunfaTong*,HuogenLi,YingWang,XuranLi,JiajiaOu,DeyuanWang,HouxiXu,ChaoMa,XianyeLang,GuangxinLiu,BoZhang,JisenShi.2016.ConstructionofHigh-DensityLinkageMapsofPopulusdeltoidsxP.simoniiUsingRestriction-SiteAssociatedDNASequencing.PLOSONE,doi:10.1371/journal.pone.0150692 FangXu#,ChunfaTong,YafeiLyu,WenhaoBo,XiaomingPang,RonglingWu*.2015.Allotetraploidandautotetraploidmodelsoflinkageanalysis.BriefingsinBioinformatics,16:32-38 王德源,童春发*.2015.林木多地点半同胞子代测定遗传分析R语言程序包及其应用.南京林业大学学报,39(5):45-51 FangXu#,YafeiLyu#,ChunfaTong#,WenhaoBo,XuliZhu,DanniYin,QinYan,JianZhang,XiaomingPan,ChristianM.Tobias,RonglingWu*.2014.AstatisticalmodelforQTLmappinginpolysomicautotetraploidsunderlyingdoublereduction.BriefingsinBioinformatics,15:1044-1056 童春发,施季森.2014.林木遗传模型统计分析及R语言实现.科学出版社 ChunfaTong,LianyingShen,YafeiLv,ZhongWang,XiaolingWang,SisiFeng,XinLi,YihanSui,XiaomingPang,RonglingWu*.2014.Structuralmapping:howtostudythegeneticarchitectureofaphenotypictraitthroughitsformationmechanism.BriefingsinBioinformatics,15:43-53 童春发,蒋安纳,杨立伟,施季森*.2014.WinNC2:因子交配设计遗传分析软件.林业科学,50(1):55-62. ZhongwenHuang,ChunfaTong,WenhaoBo,XiaomingPang,ZhongWang,JichenXu,JunyiGai,RonglingWu*.2014.Anallometricmodelformappingseeddevelopmentinplants.BriefingsinBioinformatics,15:562-570 童春发,杨立伟,蒋安纳,施季森*.2013.不平衡巢式设计遗传模型分析.林业科学,49(1):1-8. ChunfaTong,GuangxinLiu,LiweiYang,JisenShi*.2012.GSCA:newsoftwareandalgorithmstoanalysediallelmatingdesignsbasedonrestrictedlinearmodel.SilvaeGenetica,61(3):126-132 ChunfaTong,BoZhang,HuogenLi,JisenShi*.2012.Modelselectionforquantitativetraitlocimappinginafull-sibfamily.GeneticsandMolecularBiology,35(3):622-631 XiyangZhao#,ChunfaTong#,XiaomingPang#,ZhongWang,YunqianGuo,FangDu,RonglingWu*.2012.Functionalmappingofontogenyinfloweringplants.BriefingsinBioinformatics,13(3):317-328 ChunfaTong,BoZhang,ZhongWang,MengXu,XiaomingPang,JingnaSi,MinrenHuang,RonglingWu*.2011.Multiallelicepistaticmodelforanoutbredcrossandmappingalgorithmofinteractivequantitativetraitloci.BMCPlantBiology,11:148 ChunfaTong,ZhongWang,BoZhang,JishenShi,RonglingWu*.2011.3FunMap:Full-sibfamilyfunctionalmappingofdynamictraits.Bioinformatics,27(14):2006-2008 WuRongling*,ChunfaTong,ZhongWang.2011.Aconceptualframeworkforpharmacodynamicgenome-wideassociationstudiesinpharmacogenomics.DrugDiscoveryToday,16(19-20):884-890 ChunfaTong,BoZhang,JisenShi*.2010.AhiddenMarkovmodelapproachtomultilocuslinkageanalysisinafull-sibfamily.TreeGeneticsandGenomes,6:651-662 童春发,卫巍,尹辉,施季森*.2010.林木半同胞子代测定遗传模型分析.林业科学,46(1):29-35 BoZhang,ChunfaTong,TongmingYin,XinyeZhang,QiangZhuge,MinrenHuang,MingxiuWang,RonglingWu*.2009.DetectionofquantitativetraitlociinfluencinggrowthtrajectoriesofadventitiousrootsinPopulususingfunctionalmapping.TreeGeneticsandGenomes,5:539-552 单文娟,童春发,施季森*.2008.基因芯片筛选差异表达基因方法比较.遗传,30(12):1640-1646 MengZhou,ChunfaTong,JisenShi*.2007.Analysisofcodonusagebetweendifferentpoplarspecies.JournalofGeneticsandGenomics,34(6):555-561 施季森,童春发.2006.林木遗传图谱构建和QTL定位统计分析.科学出版社 童春发,施季森*.2004.利用杉木的F1代群体构建遗传连锁图谱.遗传学报,31(10):1149-1156

推荐链接
down
wechat
bug