个人简介
个人简介
李磊,青岛大学基础医学院特种医学系学系副主任,博士。
一、个人简介
2006年新加坡南洋理工大学生物信息学博士;2006到2015年加拿大西安大略大学、多伦多大学、儿童医院研究院博士后,科研助理;2014年山东省海外泰山学者特聘专家。
四、主持的科研项目
1.国家自然科学基金面上项目(3197110198);
2.山东省自然科学基金面上项目(ZR2016CM14)
五、主要荣誉称号
2014年山东省泰山学者海外特聘专家
研究领域
主要研究方向
整合生物信息学、生化及细胞实验和有机化学等方向来分析多种组学数据,研究方向涵盖以下四个方面:
1.蛋白质翻译后修饰多样性及其特性、预测算法等研究
2.蛋白质磷酸化功能与肿瘤诊疗的研究
3.噬菌体展示技术研制抗体及相关应用
4.蛋白质翻译后修饰功能的系统研究
近期论文
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代表性科研成果(#共同第一作者,*:通讯作者)
ChenZ,HeN,HuangY,QinWT,LiuX*,LiL*.IntegrationofADeepLearningClassifierwithARandomForestApproachforPredictingMalonylationSites.GenomicsProteomicsBioinformatics.2018Dec;16(6):451-459.(一区)
HuangY#,HeN#,ChenY,ChenZ*,LiL*.BERMP:across-speciesclassifierforpredictingm6Asitesbyintegratingadeeplearningalgorithmandarandomforestapproach.IntJBiolSci.2018Sep7;14(12):1669-1677.(二区)
ChenZ#,LiuX#,LiF,LiC,Marquez-LagoT,LeierA,AkutsuT,WebbGI,XuD,SmithAI,LiL*,ChouKC*,SongJ*.Large-scalecomparativeassessmentofcomputationalpredictorsforlysinepost-translationalmodificationsites.BriefBioinform.2018Oct4.(一区)
BianY#,LiL#,DongM#,LiuX,KanekoT,ChengK,LiuH,VossC,CaoX,WangY,LitchfieldD,YeM*,LiSS*,ZouH*,Ultradeeptyrosinephosphoproteomicsenabledbyaphosphotyrosinesuperbinder.NatChemBiol.2016Sep19.(Nature子刊)
LiL,WeiY,ToC,ZhuCQ,TongJ,PhamNA,TaylorP,IgnatchenkoV,IgnatchenkoA,ZhangW,WangD,YanagawaN,LiM,PintilieM,LiuG,MuthuswamyL,ShepherdFA,TsaoMS,KislingerT,MoranMF*.Integratedomicanalysisoflungcancerrevealsmetabolismproteomesignatureswithprognosticimpact.NatCommun.2014Nov28;5:5469.(Nature子刊)
ZamanN#,LiL#,JaramilloML,SunZ,TibicheC,BanvilleM,CollinsC,TrifiroM,PaliourasM,NantelA,O'Connor-McCourtM,WangE*.Signalingnetworkassessmentofmutationsandcopynumbervariationspredictbreastcancersubtype-specificdrugtargets.CellRep.2013Oct17;5(1):216-23.(Cell子刊)
LiL#,TibicheC#,FuC,KanekoT,MoranMF,SchillerMR,LiSS*,WangE*.Thehumanphosphotyrosinesignalingnetwork:evolutionandhotspotsofhijackingincancer.GenomeRes.2012Jul;22(7):1222-30.(一区)