鲍坚东 - 福建农林大学 - 生命科学学院

个人简介

鲍坚东，男，1981年出生，浙江宁海人，博士，福建农林大学生命科学院生物信息系讲师，硕导。2005年本科毕业于浙江大学生科院生物技术系，随后留校免试直攻博，先后师从朱军教授和樊龙江教授，2011年获得浙江大学生物信息学博士。毕业后进入浙江省农科院病生所周波课题组从事博士后研究。期间分别于2009年和2012年访问过德国基尔大学植物分子病理研究所和菲律宾国际水稻所。2013年年底进入福建农林大学，2014年入选金山学者“青年学术新秀”，2015年获得校杰青项目资助。2017年在美国范德堡大学医学中心做访问学者。主讲本科生课程《生物信息程序设计》、《生物信息综合实验Ⅱ》和《生物信息学》。在《Molecularplant》、《NewPhytologist》和《MolecularBreeding》等学术刊物上发表SCI论文多篇；主持国家自然科学基金1项目，校杰青项目1项，参与国家自然科学基金1项目。近5年主要承担课题： 1.国家自然科学基金青年科学基金项目，稻瘟菌无毒基因Avrpi9的克隆和变异机制研究（31301621，2014-2016，21万,主持） 2.福建农林大学杰青项目，稻瘟菌无毒基因变异机制和监测方法研究（XJQ201511，2015-2018，30万，主持） 3.国家自然科学基金青年科学基金项目，FgMsb3生化功能及其调控禾谷镰刀菌致病过程的机制研究（31701742，2018-2020，24万，参加) 4.国家自然科学基金青年科学基金项目，稻瘟病菌无毒基因Avr-Pikh的克隆与分析，(31401692，2015-2017，24万，参与)

研究领域

利用生物信息学方法研究稻瘟菌和水稻互作过程中的变异机制

近期论文

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1、JiandongBao†,MeilianChen†,ZhenhuiZhong†,WeiTang†,LianyuLin,XingtanZhang,HaolangJiang,DeyuZhang,ChenyongMiao,HaibaoTang,JisenZhang,GuodongLu,RayMing,JusticeNorvienyeku*,BaohuaWang*,ZonghuaWang*.(2017).PacBioSequencingRevealsTransposableElementasaKeyContributortoGenomicPlasticityandVirulenceVariationinMagnaportheoryzae.MolecularPlant.2017,10(11):1465-1468.(IF=8.8269，植物科学1区) 2、ZhenhuiZhong†,MeilianChen†,LianyuLin,YijuanHan,JiandongBao,WeiTang,LiliLin,YahongLin,RewishSomai,LinLu,WenjingZhang,JianChen,YongheHong,XiaofengChen,BaohuaWang,Wei-ChiangShen*,GuodongLu,JusticeNorvienyek*u,DanielJ.Ebbole*&ZonghuaWang*.Populationgenomicanalysisofthericeblastfungusrevealsspecificeventsassociatedwithexpansionofthreemainclades.TheISMEJournal.2018,online.doi:10.1038/s41396-018-0100-6.(IF=9.664,微生物学1区) 3、ZhuKun-peng,BaoJian-dong,ZhangLian-hu,YangXue,LiYuan,ZhuMing-hui,LinQing-yun,ZhaoAo,ZhaoZhen,ZhouBo,LuGuo-dong.ComparativeanalysisofthegenomeofthefieldisolateV86010ofthericeblastfungusMagnaportheoryzaefromPhilippines[J].JournalofIntegrativeAgriculture,Doi:10.1016/S2095-3119(16)61607-6.(Online,IF=1.033农业综合4区) 4、ZhenhuiZhong†,JusticeNorvienyeku†,MeilianChen†,JiandongBao†,LianyuLin,LiqiongChen,YahongLin,XiaoxianWu,ZenaCai,QiZhang,XiaoyeLin,YongheHong,JunHuang,LinghongXu,HonghongZhang,LongChen,WeiTang,HuakunZheng,XiaofengChen,YanliWang,BiLian,LiangshengZhang,HaibaoTang,GuodongLu,DanielJ.Ebbole,BaohuaWang*,ZonghuaWang*.DirectionalselectionfromhostplantsisamajorforcedrivinghostspecificityinMagnaporthespecies.ScientificReports,2016,6:25591.(并列第一作者，IF=4.259，综合性期刊2区) 5、HengXu†,JiandongBao†,JisongDai,YongqingLiY,YingZhu*.Genome-wideidentificationofnewreferencegenesforqRT-PCRnormalizationunderhightemperaturestressinriceendosperm.PLoSONE,2015,10(11):e0142015.(并列第一作者，IF=3.057，综合性期刊3区） 6、JunWu†,YanjunKou†,JiandongBao†,YaLi,MingzhiTang,XiaoliZhu,ArianePonaya,GuiXiao,JinbinLi,ChenyunLi,Min-YoungSong,ChristianJosephR.Cumagun,QiyunDeng,GuodongLu,Jong-SeongJeon,NaweedNaqviandBoZhou*.ComparativegenomicsidentifiestheMagnaportheoryzaeavirulenceeffectorAvrPi9thattriggersPi9-mediatedblastresistanceinrice.NewPhytologist,2015,206(4):1463-1475(并列第一作者，IF=7.21，植物科学1区） 7、LongbiaoGuo,JieQiu,ZujingHan,ZihongYe,ChaoChen,ChuanjunLiu,XiufangXin,ChuyuYe,YingyingWang,HongqingXie,YuWang,JiandongBao,SheTang,JieXu,YijieGui,FeiFu,WeidiWang,XingchenZhang,QianhuaZhu,XuanminGuang,ChongzhiWang,HaifengCui,DaguangCai,SongGe,GeraldTuskan,XiaohanYang,QianQian,ShengyangHe,JunWang*,XuepingZhou*,LongjiangFan*.Ahostplantgenome(Zizanialatifolia)afteracentury-longendophyteinfection.PlantJournal,2015.83:600–609.(IF=5.468,植物科学1区) 8、YongZhang†,KangZhang†,AnfeiFang†,YanqingHan,JunYang,MinfengXue,JiandongBao,DongweiHu,BoZhou,XianyunSun,ShaojieLi,MingWen,NanYao,Li-JunMa,YongfengLiu,MinZhang,FuHuang,ChaoxiLuo,LigangZhou,JianqiangLi,ZhiyiChen,JiankunMiao,ShuWang,JinshengLai,Jin-RongXu,TomHsiang,You-LiangPeng*,WenxianSun*.SpecificadaptationofUstilaginoideavirensinoccupyinghostfloretsrevealedbycomparativeandfunctionalgenomics.NatureCommunications,2014,5:3849(IF=11.47，综合性期刊1区) 9、YongWei†,JiandongBao†,HuijuanCao,JingZhai,ChatchawanJantasuriyarat,HuaWang,BoZhou*.HaplotypevariationandphylogeographyofRhizoctoniasolaniAG1-IAstrainsbasedonrDNA5.8S-ITSandß-actingenesequenceanalyses.MycologicalProgress,2014,13(2):247-255(并列第一作者，IF=1.913，真菌学4区) 10、JiandongBao,JianqiangYao,JinqingZhu,WeiminHu,DaguangCai,YuLi,QingyaoShu,LongjiangFan*.Identificationofglutinousmaizelandracesandinbredlineswithalteredtranscriptionofwaxygene.MolecularBreeding,2012,30(4):1707-1714.(IF=3.251，农林科学1区) 11、LongjiangFan*,JiandongBao,YuWang,JianqiangYao,YijieGui,WeimingHu,JinqingZhu,MengqianZeng,YuLi,YunbiXu.Post-domesticationselectioninthemaizestarchpathway.PLoSONE,2009,4(10):e7612.(IF=4.351，生物学2区) 12、XingyiGuo,JiandongBao,LongjiangFan*.Evidenceofselectivelydrivencodonusageinrice:ImplicationsforGCcontentevolutionofGramineaeGenes.FEBSLetters,2007,581(5):1015-1021.(IF=3.263，生化与分子生物学3区)