许艳 - 哈尔滨医科大学 - 生物信息学院

个人简介

一、自然简历许艳，女，1965年5月生人，理学博士，教授，硕士生导师。现任哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院生物物理教研室副主任。 1990年毕业于哈尔滨医科大学与哈尔滨船舶工程学院合办的生物医学工程专业，同年留校在哈医大基础医学学院生物物理教研室工作；2000年获医学硕士学位，晋副教授；2006年获理学博士学位，转入哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院工作，同年9月进入哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院博士后流动站；2007年晋教授，2010年博士后出站。现任黑龙江生物医学工程学会常务理事。二、教学工作多年从事本科生、七年制学生、研究生等教学和科研指导工作。承担多轨道的医用生物物理学、生物医学工程概论、生物信息学进展、生理系统建模、生物医学图像处理、Photoshop应用等课程的教学工作。任《医用生物物理学》（第二版，人民卫生出版社）编委。培养硕士研究生已毕业15人，在研6人。研究生有3人获国家级研究生奖学金，5人获得黑龙江省优秀研究生创新基金项目资助，1人获省优秀研究生毕业生，5人获学校优秀研究生称号。指导本科毕设学生39人，3人获校优秀毕业生；指导本科学生数学建模9人，3人获全国大学生数学建模竞赛国家二等奖，3人获黑龙江赛区二等奖，3人获黑龙江赛区三等奖。三、科研工作主要从事基于拷贝数变异的非编码RNA与转录因子对癌症协同调控机制、非编码RNA介导的生物网络模型分析、非编码调控区域变异与癌症的关联研究以及整合多组学数据识别癌症候选靶标等方向研究工作。主持国家及省、厅级科研课题9项。在《BriefingsinBioinformatics》、《HumanMutation》、《ScientificReports》、《JournaloftheRoyalSocietyInterface》、《BMCSystemsBiology》、《MolecularBioSystems》等学术知名刊物上发表科研文章30余篇，其中以第一或通讯作者发表SCI索引文章15篇、EI索引文章3篇。获得计算机软件著作权1项。担任天津市自然科学基金以及福建、河北、内蒙等省份的自然科学基金信函评审专家；《BriefingsinBioinformatics》、《ScientificReports》、《MolecularBioSystems》论文评审专家。四、主持课题国家自然科学基金面上项目，基于剂量敏感性的癌症风险lncRNA识别及其特征调控模式的研究(81673036)，50万，2017.01-2020.12。 2）国家自然科学基金面上项目，基于拷贝数变异识别抑癌的miRNA与转录因子及其协同纠错机制的研究(81372492)，72万，2014.01-2017.12。 3）黑龙江省教育厅基金面上项目，基于拷贝数变异识别乳腺癌的抑癌miRNA与转录因子及其协同调控通路(12541278），3万，2014.01-2016.12。 4）黑龙江省自然科学基金面上项目，癌症相关通路信息交互机制的研究（D201116），5万，2012.01-2014.12。 5）黑龙江省博士后启动基金项目，结合CNVs和基因表达谱的癌症基因网络重构与分析（LBH-Q11044），3万，2012.01-2014.12。 6）黑龙江省教育厅基金项目，基于SNPs遗传谱的阿片受体多基因挖掘（11531112），1.2万，2008.01-2010.12。 7）黑龙江省自然科学基金面上项目，阿片受体相关生物大分子的系统生物信息学研究（D200606），3万，2007.01-2009.02。 8）黑龙江省博士后基金项目，阿片受体相关生物大分子生物信息学研究（LBH-Z06110），4万，2006.01-2008.12年。 9）黑龙江省教育厅基金项目，物理因子改善脑部血液循环治疗缺血性脑血管病机理的研究（10541104），1万，2004.01-2006.12

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NingZhao†,YongjingLiu†,YunzhenWei†,ZichuangYan,QiangZhang,ChengWu,ZhiqiangChangandYanXu*,Optimizationofcelllinesastumourmodelsbyintegratingmulti-omicsdata,BriefingsinBioinformatics,2017,18(3):515-529. QiangZhang,YunzhenWei,ZichuangYan,ChengWu,ZhiqiangChang,YinlingZhu,KunLiandYanXu*,ThecharacteristiclandscapeoflncRNAsclassifiedbyRBP-lncRNAinteractionsacross10cancers.MolecularBiosyStems,2017.13.1142-1151 ZichuangYan†,YongjingLiu†,YunZhenWei†,NingZhao,QiangZhang,ChengWu,ZhiqiangChang,YanXu*.Thefunctionalconsequencesandprognosticvalueofdosagesensitivityinovariancancer.MolecularBiosyStems,2017Jan31;13(2):380-391 YongjingLiu†,RuiZhang†,NingZhao†,QiangZhang,ZichuangYan,ZhiqiangChang,YunzhenWei,ChengWu,JinXuandYanXu*.AcomparativeanalysisrevealsthedosagesensitivityandregulatorypatternsoflncRNAinprostatecancer,MolecularBiosyStems,2016,July,12,3176-3185 KeningLi†,YongjingLiu†,YuanshuaiZhou,RuiZhang,NingZhao,ZichuangYan,QiangZhang,ShujuanZhang,FujunQiuandYanXu*.AnintegratedapproachtorevealmiRNAs’impactsonthefunctionalconsequenceofcopynumberalterationsincancer,ScientificReports,2015Jun23;5:11567 YongjingLiu†,RuiZhang†,FujunQiu†,KeningLi,YuanshuaiZhou,DesiShangandYanXu*.ConstructionofalncRNA–PCGbipartitenetworkandidentificationofcancer-relatedlncRNAs:acasestudyinprostatecancer.MolecularBiosyStems,2015Feb;11(2):384-93.2.829 YuanshuaiZhou†,YongjingLiu†,KeningLi†,RuiZhang,FujunQiu,NingZhao,YanXu*.ICan:Anintegratedco-alterationnetworktoidentifyovariancancer-relatedgenes.PLoSOne,2015;10(3):e0116095 NingZhao†,YongjingLiu†,ZhiqiangChang,KeningLi,RuiZhang,YuanshuaiZhou,FujunQiu,XiaoleHan,YanXu*.IdentificationofBiomarkerandCo-RegulatoryMotifsinLungAdenocarcinomaBasedonDifferentialInteractions.PLoSOne,2015,10(9):e0139165 KeningLi†,ZihuiLi†,NingZhao†,YaoqunXu,YongjingLiu,YuanshuaiZhou,DesiShang,FujunQiu,RuiZhang,ZhiqiangChangandYanXu*.FunctionalanalysisofmicroRNAandtranscriptionfactorsynergisticregulatorynetworkbasedonidentifyingregulatorymotifsinnon-smallcelllungcancer,BMCSystemsBiology,2013,7:122 FujunQiu†,YanXu*.KeningLi†,ZihuiLi†,YufengLiu†,HuiziDuanMu,ShanzhenZhang,ZhenqiLi,ZhiqiangChang,YuanshuaiZhou,RuiZhang,ShujuanZhang,ChunquanLi,YanZhang,MinzhaiLiuandXiaLi.CNVD:TextMining-basedCopyNumberVariationinDiseaseDatabase,HumanMutation,2012,Vol.33,No.11,E2375-2381 XuY,DuanmuH†,ChangZ,ZhangS,LiZ,LiZ,LiuY,LiK,QiuF,LiXTheapplicationofgeneco-expressionnetworkreconstructionbasedonCNVsandgeneexpressionmicroarraydatainbreastcancer,MolecularBiologyReports,2012,Vol.39,No.2,1627-1637 ZihuiLi†,YufengLiu†,KeningLi†,HuiziDuanMu,ZhiqiangChang,ZhenqiLi,ShanzhenZhang,YanXu*.Analysisoffunctionalandpathwayassociationofdifferentialco-expressedgenes:Acasestudyindrugaddiction,JournalofBiomedicalInformatics,2012,Vol.45,No.1,30-36 ShanzhenZhang†,ZhiqiangChang†,ZhenqiLi†,HuiziDuanMu,ZihuiLi,KeningLi,YufengLiu,FujunQiu,YanXu*.Calculatingphenotypicsimilaritybetweengenesusinghierarchicalstructuredatabasedonsemanticsimilarity,2012,Gene,Vol.497,No.1,58-65 YanXu†,WenHu†,ZhiqiangChang†,LiliYu,HuiziDuanMu,ZhenqiLi,ZihuiLi,ShanzhenZhang,XiaLi*.PredictionofHumanProtein-ProteinInteractionbyMixedBayesianModelandItsApplicationtoExploringUnderlyingCancerRelatedPathwayCrosstalk,JournaloftheRoyalSocietyInterface,2011,Vol.8,No.57,555-567 XuYan,XuManying,LiXia*.ModulationofGABAonpainfulsenseincentralnervoussystemofmorphine-dependentrats.NeuroscienceBulletin.2008,24,No.4:278-282