张岩 - 哈尔滨医科大学 - 生物信息学院

个人简介

张岩，哈尔滨医科大学，生物信息科学与技术学院，教授，博士生导师。 2000年留学日本，2006年获得理学博士学位。同年受聘为哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院教授。多年来一直从事生物信息学和计算表观遗传学领域的教学和科研工作。现为黑龙江生物医学工程学会理事，黑龙江省生物工程学会理事，国家自然科学基金通讯评审及会评专家，功能基因组信息学与系统生物学分会转化医学信息学学组专家委员。《基因组学与应用生物学》编委。《PlosOne》学术编辑，《CancerGeneticsandEpigenetics》及《ComputationalMolecularandBiology》执行主编。作为编委参与编写卫生部八年制规划教材《生物信息学》，副主编参编《生物信息学学习指导与习题》、《生物信息学与医学实践》。全国高等学校生物医学工程专业首轮规划教材《生物医学信息学概论》副主编。共发表论文60余篇，SCI收录论文36篇，以第一及通讯作者累计发表SCI收录论文30篇（总SCI影响因子130），其中有9篇SCI论文发表在国际著名期刊《NucleicAcidsResearch》，并在Nature子刊《ScienceReports》、《Development》、《Database》、《BriefingsinBioinformatics》、《Genomics》、《PLoSONE》、《Gene》等有重要国际影响的杂志上发表了多篇论文。主持国家自然科学基金面上项目3项，教育部留学回国基金1项，省市各级项目7项。张岩教授所带领的计算表观遗传学课题组致力于表观遗传领域的高通量数据挖掘的算法和软件开发，可视化网络平台及数据库构建。

近期论文

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1.DiseaseMethversion2.0:amajorexpansionandupdateofthehumandiseasemethylationdatabase.XiongY,WeiY,GuY,ZhangS,LyuJ,ZhangB,ChenC,ZhuJ,WangY,LiuH,ZhangY(*).NucleicAcidsRes.2017Jan4;45(Databaseissue):D888–D895. 2.IdentificationandfunctionalanalysisoflongintergenicnoncodingRNAgenesinporcinepre-implantationembryonicdevelopment.LiJ,GaoZ,WangX,LiuH,ZhangY(*),LiuZ. SciRep.2016Dec6;6:38333. 3.ComputationalidentificationofputativelincRNAsinmouseembryonicstemcell. LiuH,LyuJ,LiuH,GaoY,GuoJ,HeH,HanZ,ZhangY,WuQ.SciRep.2016Oct7;6:34892. 4.DNAmethylationdynamics:identificationandfunctionalannotation.LiuH,LiS,WangX,ZhuJ,WeiY,WangY,WenY,WangL,HuangY,ZhangB,ShangS,ZhangY(*). BriefFunctGenomics.2016Nov;15(6):470-484. 5.CellsubpopulationdeconvolutionrevealsbreastcancerheterogeneitybasedonDNAmethylationsignature.WenY,WeiY,ZhangS,LiS,LiuH,WangF,ZhaoY,ZhangD, ZhangY(*).BriefBioinform.2016Mar25.pii:bbw028. 6.Theidentificationofage-associatedcancermarkersbyanintegrativeanalysisofdynamicDNAmethylationchanges.WangY,ZhangJ,XiaoX,LiuH,WangF,LiS,WenY,WeiY,SuJ,ZhangY,ZhangY(*).SciRep.2016Mar7;6:22723 7.SEA:acomprehensiveSuperEnhancerArchive.WeiY,ZhangS,ShangS,ZhangB,WangX,LiS,LiuH,ZhangY(*).NucleicAcidsResearch2016Jan4;44(D1):D172-9. 8.Systematicidentificationandannotationofhumanmethylationmarksbasedonbisulfitesequencingmethylomesrevealsdistinctrolesofcell-type-specifichypomethylationinregulationofcellidentifygenes.LiuH,LiuX,ZhangS,LvJ,LiS,ShangS,JiaS,WeiY,WangF,SuJ,ZhangY(*):NucleicAcidsResearch.2016Jan8;44(1):75-94. 9.CellMethy:IdentificationofafocalconcordantlymethylatedpatternofCpGsrevealedwidedifferencesbetweennormalandcancertissues.WangF,ZhangS,LiuH,WeiY,WangY,HanX,SuJ,ZhangD,XieB,ZhangY(*).SciRep.2015Dec10;5:18037. 10.ChromatinmodificationsandgenomiccontextslinkedtodynamicDNAmethylationpatternsacrosshumancelltypes.YanH,ZhangD,LiuH,WeiY,LvJ,WangF,ZhangC,WuQ,SuJ,ZhangY(*).SciRep.2015Feb12;5:8410 11.MetaImprint:aninformationrepositoryofmammalianimprintedgenes.WeiY,SuJ,LiuH,LvJ,WangF,YanH,WenY,LiuH,WuQ,ZhangY(*).Development.2014Jun;141(12):2516-23. 12.Revealingthearchitectureofgeneticandepigeneticregulation:amaximumlikelihoodmodel. WangF,ZhangS,WenY,WeiY,YanH,LiuH,SuJ,ZhangY(*),CheJ.BriefBioinform.2014Nov;15(6):1028-43. 13.CpG_MPs:identificationofCpGmethylationpatternsofgenomicregionsfromhigh-throughputbisulfitesequencingdata.SuJ,YanH,WeiY,LiuH,LiuH,WangF,LvJ,WuQ,ZhangY(*).NucleicAcidsRes.2013Jan7;41(1):e4. 14.DiseaseMeth:ahumandiseasemethylationdatabase.LvJ,LiuH,SuJ,WuX,LiuH,LiB,XiaoX,WangF,WuQ,ZhangY(*).NucleicAcidsRes.2012Jan;40(Databaseissue):D1030-5. 15.QDMR:aquantitativemethodforidentificationofdifferentiallymethylatedregionsbyentropy.ZhangY(*),LiuH,LvJ,XiaoX,ZhuJ,LiuX,SuJ,LiX,WuQ,WangF,CuiY. NucleicAcidsRes.2011May;39(9):e58. 16.HHMD:thehumanhistonemodificationdatabase.ZhangY(*),LvJ,LiuH,ZhuJ,SuJ,WuQ,QiY,WangF,LiX.NucleicAcidsRes.2010Jan;38(Databaseissue):D149-54. 17.CpG_MI:anovelapproachforidentifyingfunctionalCpGislandsinmammaliangenomes. SuJ,ZhangY(*),LvJ,LiuH,TangX,WangF,QiY,FengY,LiX.NucleicAcidsRes.2010Jan;38(1):e6.

学术兼职

黑龙江生物医学工程学会理事，黑龙江省生物工程学会理事，国家自然科学基金通讯评审及会评专家，功能基因组信息学与系统生物学分会转化医学信息学学组专家委员。《基因组学与应用生物学》编委。《PlosOne》学术编辑，《CancerGeneticsandEpigenetics》及《ComputationalMolecularandBiology》执行主编