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利用微卫星(SSR)标记对蔗糖和菊苣属的遗传多样性和种群结构进行分析。
Scientific Reports ( IF 3.8 ) Pub Date : 2019-01-23 , DOI: 10.1038/s41598-018-36630-7
Ahmad Ali 1 , Yong-Bao Pan 2 , Qin-Nan Wang 3 , Jin-Da Wang 1 , Jun-Lü Chen 3 , San-Ji Gao 1
Affiliation  

为了了解蔗糖属和赤眼莲属之间以及它们之间的遗传多样性和结构,从五个物种(S. officinarum,S。spontaneum,S.robustum,S。barberi,S。sinense)的79个种质中,E的六个种质arundinaceus和30 Saccharum spp。使用21对荧光标记的高度多态性SSR引物和毛细管电泳(CE)检测系统分析杂种。通过CE鉴定总共167个多态性SSR等位基因,平均多态性信息含量(PIC)为0.92。这115个种质之间的遗传多样性参数表明,该菌属为Saccharum spp。杂种比蔗糖和野菊属物种更多样化。根据SSR数据,将115个种质分为7个主要系统发育组,通过系统发育分析和主成分分析(PCA)分别对应于蔗糖属和赤藓属。我们建议,七个核心SSR引物对,即SMC31CUQ,SMC336BS,SMC597CS,SMC703BS,SMC24DUQ,mSSCIR3和mSSCIR43,在糖类和糖菌的基因型鉴定中可能具有广泛的适用性。杂种。因此,本研究的信息旨在管理甘蔗遗传资源。



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更新日期:2019-01-23
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