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珍珠贝（Pinctada fucata）体细胞组织中的Piwi相互作用RNA（piRNA）表达模式。
Scientific Reports ( IF 3.8 ) Pub Date : 2019-01-22 , DOI: 10.1038/s41598-018-36726-0 Songqian Huang 1 , Yuki Ichikawa 1 , Yoji Igarashi 1 , Kazutoshi Yoshitake 1 , Shigeharu Kinoshita 1 , Fumito Omori 2 , Kaoru Maeyama 2 , Kiyohito Nagai 3 , Shugo Watabe 4 , Shuichi Asakawa 1
Scientific Reports ( IF 3.8 ) Pub Date : 2019-01-22 , DOI: 10.1038/s41598-018-36726-0 Songqian Huang 1 , Yuki Ichikawa 1 , Yoji Igarashi 1 , Kazutoshi Yoshitake 1 , Shigeharu Kinoshita 1 , Fumito Omori 2 , Kaoru Maeyama 2 , Kiyohito Nagai 3 , Shugo Watabe 4 , Shuichi Asakawa 1
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piwi相互作用RNA（piRNA）属于最近发现的一类小型非编码RNA，其最佳理解的功能是抑制转座因子的活性。大部分piRNA研究都是在模型生物上进行的，而关于piRNA在软体动物中的表达和功能的知之甚少。我们对珍珠牡蛎Pinctada fucata的地幔，内收肌，muscle和卵巢组织中提取的小RNA进行了高通量测序。大约30 nt的序列的RNA种类在所有组织中广泛表达。在5'端的尿苷和在3'端的β-消除保护表明这些是假定的piRNA。将总共1800万个推定piRNA分配给280万个独特piRNA，并鉴定出35848个piRNA簇。映射到参考基因组显示，有25％的独特piRNA映射到支架上的多个串联基因座。piRNA簇的表达模式在体细胞组织中相似，但在体细胞和性腺组织之间存在显着差异。这些发现表明，在牡蛎中，piRNA具有超越种系中重要且新颖的功能。
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更新日期：2019-01-23
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