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蛋白质介导的无定形碳酸钙生物矿化的分子动力学模拟
RSC Advances ( IF 3.9 ) Pub Date : 2019-01-16 00:00:00 , DOI: 10.1039/c8ra08459a R Sandya Rani 1 , Moumita Saharay 1
RSC Advances ( IF 3.9 ) Pub Date : 2019-01-16 00:00:00 , DOI: 10.1039/c8ra08459a R Sandya Rani 1 , Moumita Saharay 1
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生物体中蛋白质介导的碳酸钙 (CaCO 3 ) 生物矿化主要受蛋白质、溶剂、钙 (Ca 2+ ) 和碳酸盐 (CO 3 2− )的带电氨基酸之间的关键相互作用控制。) 离子。本文利用分子动力学和元动力学模拟研究了溶菌酶介导的无定形碳酸钙 (ACC) 成核的分子机制。结果表明，通过作为成核位点，表面暴露的精氨酸残基带正电的侧链与碳酸盐形成氢键并促进其周围离子的聚集，从而导致ACC在蛋白质表面的形成和生长。由于离子聚集诱导的水从成核位点排出，新形成的 ACC 斑块的水合度较低。尽管天冬氨酸和谷氨酸的带负电荷的侧链与钙离子有良好的静电相互作用，但这些残基对蛋白质表面上 ACC 的生长贡献最小。
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更新日期：2019-01-16
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