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对 Siphoviridae 噬菌体 TSK1 进行完整基因组分析，显示针对肺炎克雷伯菌的生物膜去除潜力。
Scientific Reports ( IF 3.8 ) Pub Date : 2018-Dec-17 , DOI: 10.1038/s41598-018-36229-y Rabia Tabassum 1 , Muafia Shafique 1 , Komal Amer Khawaja 1 , Iqbal Ahmed Alvi 1 , Yasir Rehman 1 , Cody S Sheik 2 , Zaigham Abbas 1 , Shafiq Ur Rehman 1
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多重耐药 肺炎克雷伯菌 是一种院内病原体，可引起败血症、肺炎和 UTI。过度使用抗生素会导致多重耐药性的出现。噬菌体疗法是抗生素的潜在替代品，具有许多优点。在这项研究中，提出了 TSK1 噬菌体的微生物学和基因组特征及其生物膜消除能力。TSK1 在 pH 7 和 37 °C 下表现出较窄的宿主范围和最高的稳定性。TSK1 在感染的最初 14 小时内减少了肺炎克雷伯菌的生长。TSK1 针对不同年龄的肺炎克雷伯菌生物膜处理后降低了 85-100% 的生物量。针对肺炎克雷伯菌生物膜的 TSK1 噬菌体预处理在孵育的最初 24 小时内降低了 > 99% 的生物量。TSK1 噬菌体基因组由 49,836 个碱基对组成，GC 组成为 50.44%。总共预测了 75 个开放阅读框 （ORF），其中 25 个显示与已知功能蛋白同源，而 50 个称为假设，因为基因组数据库中不存在具有已证实功能的同源物。稻瘟病和系统发育分析将其归入 Siphoviridae 科的 Kp36 病毒属。TSK1 噬菌体基因组的拟议包装策略是使用 pac 位点的头部包装。TSK1 噬菌体的潜力可用于在临床和非临床环境中减少细菌载量和生物膜。
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