CD98 has been implicated in the experimental model of inflammatory bowel disease. We have previously shown that IEC-specific overexpression of CD98 mediates intestinal inflammation and intestinal epithelial barrier dysfunction. Mice overexpressing CD98 exhibited severe colitis and a greater susceptibility to CAC. Here we demonstrated CD98 overexpression to dysregulate homeostatic gradient profile of miRNA and protein expression along the ileal villus-crypt axis. Using miRNA-target gene prediction module, we observed differentially expressed miRNAs to target proteins of villus and crypt profoundly affected by CD98 overexpression. We have utilized online bioinformatics as methods to further scrutinize the biological meanings of miRNA-target data. We identified significant interactions among the differentially regulated proteins targeted by altered miRNAs in Tg mice. The biological processes affected by the predicted targets of miRNAs deviate from the homeostatic functions of the miRNA-gene-protein axis of the wildtype mice. Our results emphasize a dynamic perturbation of miRNA and protein expression in villus-crypt axis contributing to potential biological consequences of altering CD98 expression. Our findings also suggest the need for a consideration of arrays of interacting biological entities (i.e. miRNAs-mRNAs, protein-protein interaction) or a combination comparison for a better understanding of the disease pathology which is necessary for an effective therapeutic target development.

中文翻译：

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CD98在肠上皮细胞中的过度表达会沿回肠绒毛-隐窝轴调节miRNA及其靶蛋白。

CD98已经涉及炎症性肠病的实验模型。先前我们已经表明，IEC特异性CD98的过度表达介导了肠道炎症和肠道上皮屏障功能障碍。过表达CD98的小鼠表现出严重的结肠炎和对CAC的更大敏感性。在这里，我们证明了CD98过表达会沿回肠绒毛-隐窝轴失调miRNA的稳态梯度谱和蛋白质表达。使用miRNA靶基因预测模块，我们观察到差异表达的miRNA靶向受CD98过度表达影响的绒毛和隐窝的靶蛋白。我们已经利用在线生物信息学作为进一步研究miRNA靶标数据生物学意义的方法。我们在Tg小鼠中发现了被改变的miRNA靶向的差异调节蛋白之间的显着相互作用。受miRNA预测靶标影响的生物学过程偏离了野生型小鼠miRNA基因蛋白轴的稳态功能。我们的研究结果强调绒毛-隐窝轴中的miRNA和蛋白质表达的动态扰动，有助于改变CD98表达的潜在生物学后果。我们的发现还表明需要考虑相互作用的生物实体阵列（即miRNA-mRNA，蛋白质-蛋白质相互作用）或组合比较，以更好地了解有效治疗靶标开发所必需的疾病病理学。受miRNA预测靶标影响的生物学过程偏离了野生型小鼠miRNA基因蛋白轴的稳态功能。我们的研究结果强调绒毛-隐窝轴中的miRNA和蛋白质表达的动态扰动，有助于改变CD98表达的潜在生物学后果。我们的发现还表明需要考虑相互作用的生物实体阵列（即miRNA-mRNA，蛋白质-蛋白质相互作用）或组合比较，以更好地了解有效治疗靶标开发所必需的疾病病理学。受miRNA预测靶标影响的生物学过程偏离了野生型小鼠miRNA基因蛋白轴的稳态功能。我们的研究结果强调绒毛-隐窝轴中的miRNA和蛋白质表达的动态扰动，有助于改变CD98表达的潜在生物学后果。我们的发现还表明需要考虑相互作用的生物实体阵列（即miRNA-mRNA，蛋白质-蛋白质相互作用）或组合比较，以更好地了解有效治疗靶标开发所必需的疾病病理学。我们的研究结果强调绒毛-隐窝轴中的miRNA和蛋白质表达的动态扰动，有助于改变CD98表达的潜在生物学后果。我们的发现还表明需要考虑相互作用的生物实体阵列（即miRNA-mRNA，蛋白质-蛋白质相互作用）或组合比较，以更好地了解有效治疗靶标开发所必需的疾病病理学。我们的研究结果强调绒毛-隐窝轴中的miRNA和蛋白质表达的动态扰动，有助于改变CD98表达的潜在生物学后果。我们的发现还表明需要考虑相互作用的生物实体阵列（即miRNA-mRNA，蛋白质-蛋白质相互作用）或组合比较，以更好地了解有效治疗靶标开发所必需的疾病病理学。