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Density functional study on the binding properties of nucleobases to stanane nanosheet
Applied Surface Science ( IF 6.3 ) Pub Date : 2018-12-01 , DOI: 10.1016/j.apsusc.2018.08.066 R. Keerthi Bhavadharani , V. Nagarajan , R. Chandiramouli
Applied Surface Science ( IF 6.3 ) Pub Date : 2018-12-01 , DOI: 10.1016/j.apsusc.2018.08.066 R. Keerthi Bhavadharani , V. Nagarajan , R. Chandiramouli
Abstract We report the interaction of stanane nanosheet (Sn-NS) with deoxy ribo nucleic acids (DNA)/ribo nucleic acids (RNA) utilizing density functional theory (DFT) technique. The calculated formation energy led us to conclude that Sn-NS exhibits a stable geometric structure. The energy band structure and density of states (DOS) spectrum provide the electronic characteristics of Sn-NS, and the band gap is found to be 1.73 eV, which exhibit semiconducting property. Our results confirmed the adsorption of nucleobases with stanane nanosheet, which follows the sequence C > U > A > T > G. The interaction property of nucleobases on Sn-NS material is authenticated with the Bader charge transfer, energy gap, adsorption energy and average energy gap changes. Moreover, the interaction of nucleobases on Sn-NS is also explored using the change in the DOS-spectrum, electron density diagrams and energy band structure. The findings of the current work infer that the DNA sequencing can be carried out using stanane nanosheet.
中文翻译:
核碱基与锡烷纳米片结合特性的密度泛函研究
摘要 我们利用密度泛函理论 (DFT) 技术报告了锡烷纳米片 (Sn-NS) 与脱氧核糖核酸 (DNA)/核糖核酸 (RNA) 的相互作用。计算的形成能使我们得出结论,Sn-NS 表现出稳定的几何结构。能带结构和态密度(DOS)谱提供了 Sn-NS 的电子特性,发现带隙为 1.73 eV,表现出半导体特性。我们的结果证实了核碱基与锡烷纳米片的吸附,其顺序为 C > U > A > T > G。核碱基在 Sn-NS 材料上的相互作用性质通过 Bader 电荷转移、能隙、吸附能和平均能隙变化。而且,还使用 DOS 光谱、电子密度图和能带结构的变化探索了 Sn-NS 上核碱基的相互作用。当前工作的结果推断可以使用锡烷纳米片进行 DNA 测序。
更新日期:2018-12-01
中文翻译:
核碱基与锡烷纳米片结合特性的密度泛函研究
摘要 我们利用密度泛函理论 (DFT) 技术报告了锡烷纳米片 (Sn-NS) 与脱氧核糖核酸 (DNA)/核糖核酸 (RNA) 的相互作用。计算的形成能使我们得出结论,Sn-NS 表现出稳定的几何结构。能带结构和态密度(DOS)谱提供了 Sn-NS 的电子特性,发现带隙为 1.73 eV,表现出半导体特性。我们的结果证实了核碱基与锡烷纳米片的吸附,其顺序为 C > U > A > T > G。核碱基在 Sn-NS 材料上的相互作用性质通过 Bader 电荷转移、能隙、吸附能和平均能隙变化。而且,还使用 DOS 光谱、电子密度图和能带结构的变化探索了 Sn-NS 上核碱基的相互作用。当前工作的结果推断可以使用锡烷纳米片进行 DNA 测序。