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尿素及其甲基衍生物的蛋白质变性作用的微观见解
The Journal of Physical Chemistry Letters ( IF 4.8 ) Pub Date : 2018-05-16 00:00:00 , DOI: 10.1021/acs.jpclett.8b00960
Bei Ding , Lijiang Yang 1 , Debopreeti Mukherjee , Jianxin Chen , Yiqin Gao 1 , Feng Gai
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我们采用特定位置,线性和非线性红外光谱技术以及荧光光谱和分子动力学模拟来研究尿素及其三种衍生物(甲基脲,1,3-二甲基脲和四甲基脲)与蛋白质芳香族和极性化合物的结合相互作用侧链。我们发现(1)尿素甲基化导致助溶剂分子与芳族侧链之间的优先相互作用,其亲和力随甲基数的增加而增加;(2)与四甲基脲的相互作用导致芳族侧链显着脱水,色氨酸的影响最为明显。(3)虽然尿素和四甲基脲都没有在极性侧链周围显示优先积累,在存在四甲基脲的情况下,该侧链周围的氢键供体的数量显着减少。综上所述,我们的发现表明这些脲衍生物,尤其是四甲基脲,可以有效破坏蛋白质中的疏水相互作用。另外,如所观察到的,四甲基脲可促进分子内氢键的形成,并因此诱导肽中的α-螺旋折叠。



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更新日期:2018-05-16
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